MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 32764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016930	TTG	2	6	138901	138906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711885
3502	NC_016930	GTG	2	6	138943	138948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711885
3503	NC_016930	AGC	2	6	139004	139009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711885
3504	NC_016930	GAT	2	6	139025	139030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711885
3505	NC_016930	GCA	2	6	139038	139043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711885
3506	NC_016930	GATT	2	8	139118	139125	25 %	50 %	25 %	0 %	379711885
3507	NC_016930	TTA	2	6	139136	139141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711885
3508	NC_016930	CTTGG	2	10	139143	139152	0 %	40 %	40 %	20 %	379711885
3509	NC_016930	TAA	2	6	139217	139222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711885
3510	NC_016930	T	6	6	139299	139304	0 %	100 %	0 %	0 %	379711885
3511	NC_016930	TTA	2	6	139339	139344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711885
3512	NC_016930	GCA	2	6	139350	139355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711885
3513	NC_016930	TTA	2	6	139399	139404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711885
3514	NC_016930	ATT	2	6	139408	139413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711885
3515	NC_016930	AT	3	6	139445	139450	50 %	50 %	0 %	0 %	379711885
3516	NC_016930	ATTC	2	8	139460	139467	25 %	50 %	0 %	25 %	379711885
3517	NC_016930	GTAT	2	8	139518	139525	25 %	50 %	25 %	0 %	379711885
3518	NC_016930	TAA	2	6	139573	139578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711885
3519	NC_016930	TATG	2	8	139580	139587	25 %	50 %	25 %	0 %	379711885
3520	NC_016930	TGT	2	6	139796	139801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711885
3521	NC_016930	T	6	6	139846	139851	0 %	100 %	0 %	0 %	379711885
3522	NC_016930	AAAG	2	8	139952	139959	75 %	0 %	25 %	0 %	379711885
3523	NC_016930	AGC	2	6	139961	139966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711885
3524	NC_016930	TGC	2	6	139979	139984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711885
3525	NC_016930	GCA	3	9	140051	140059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711885
3526	NC_016930	TTA	2	6	140118	140123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711886
3527	NC_016930	TAG	2	6	140146	140151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3528	NC_016930	GCA	2	6	140175	140180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711886
3529	NC_016930	GCT	2	6	140215	140220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711886
3530	NC_016930	AGG	2	6	140246	140251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379711886
3531	NC_016930	AAT	2	6	140261	140266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711886
3532	NC_016930	TAATGC	2	12	140282	140293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379711886
3533	NC_016930	TGT	2	6	140317	140322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711886
3534	NC_016930	TAG	2	6	140389	140394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3535	NC_016930	GGTC	2	8	140423	140430	0 %	25 %	50 %	25 %	379711886
3536	NC_016930	TA	3	6	140451	140456	50 %	50 %	0 %	0 %	379711886
3537	NC_016930	AAT	2	6	140544	140549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711886
3538	NC_016930	TC	3	6	140557	140562	0 %	50 %	0 %	50 %	379711886
3539	NC_016930	TAA	2	6	140563	140568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711886
3540	NC_016930	A	6	6	140576	140581	100 %	0 %	0 %	0 %	379711886
3541	NC_016930	AATG	2	8	140583	140590	50 %	25 %	25 %	0 %	379711886
3542	NC_016930	ACT	2	6	140724	140729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711886
3543	NC_016930	CTT	2	6	140884	140889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711886
3544	NC_016930	GAT	2	6	140967	140972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3545	NC_016930	ACA	2	6	140998	141003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711886
3546	NC_016930	ATT	2	6	141011	141016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711886
3547	NC_016930	TCC	2	6	141059	141064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379711886
3548	NC_016930	AAAGAT	2	12	141105	141116	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711886
3549	NC_016930	CGG	2	6	141193	141198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379711886
3550	NC_016930	AGG	2	6	141206	141211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379711886
3551	NC_016930	AT	3	6	141231	141236	50 %	50 %	0 %	0 %	379711886
3552	NC_016930	ATGA	2	8	141240	141247	50 %	25 %	25 %	0 %	379711886
3553	NC_016930	TTG	2	6	141298	141303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711886
3554	NC_016930	TAAAGA	2	12	141329	141340	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711886
3555	NC_016930	TA	3	6	141352	141357	50 %	50 %	0 %	0 %	379711886
3556	NC_016930	TA	4	8	141362	141369	50 %	50 %	0 %	0 %	379711886
3557	NC_016930	TAG	2	6	141440	141445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3558	NC_016930	GGA	2	6	141456	141461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379711886
3559	NC_016930	TGA	2	6	141527	141532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3560	NC_016930	CAT	2	6	141551	141556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711886
3561	NC_016930	TA	3	6	141663	141668	50 %	50 %	0 %	0 %	379711886
3562	NC_016930	TAA	2	6	141695	141700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711886
3563	NC_016930	GCT	2	6	141828	141833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711886
3564	NC_016930	T	6	6	141894	141899	0 %	100 %	0 %	0 %	379711886
3565	NC_016930	TGA	2	6	141931	141936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3566	NC_016930	ATT	2	6	142098	142103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711886
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3568	NC_016930	CTA	2	6	142135	142140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711886
3569	NC_016930	T	6	6	142191	142196	0 %	100 %	0 %	0 %	379711886
3570	NC_016930	CTT	2	6	142227	142232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711886
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3572	NC_016930	AT	3	6	142254	142259	50 %	50 %	0 %	0 %	379711886
3573	NC_016930	ATT	2	6	142266	142271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711886
3574	NC_016930	ATT	2	6	142293	142298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711886
3575	NC_016930	TAT	2	6	142325	142330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711886
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3577	NC_016930	TTA	2	6	142386	142391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711886
3578	NC_016930	TATT	2	8	142407	142414	25 %	75 %	0 %	0 %	379711886
3579	NC_016930	ATG	2	6	142464	142469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3580	NC_016930	TAT	2	6	142475	142480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711886
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3582	NC_016930	TCT	2	6	142612	142617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711886
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3584	NC_016930	TTA	2	6	142699	142704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711886
3585	NC_016930	GTA	2	6	142749	142754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3586	NC_016930	TGG	2	6	142793	142798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711886
3587	NC_016930	ATG	2	6	142810	142815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3588	NC_016930	GAT	2	6	142848	142853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711886
3589	NC_016930	ACAAG	2	10	142857	142866	60 %	0 %	20 %	20 %	379711886
3590	NC_016930	AAC	2	6	142897	142902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711886
3591	NC_016930	AAG	2	6	142951	142956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711886
3592	NC_016930	GAA	2	6	142974	142979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711886
3593	NC_016930	GCT	2	6	143102	143107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_016930	AGTTT	2	10	143185	143194	20 %	60 %	20 %	0 %	379711887
3595	NC_016930	GAT	2	6	143230	143235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711887
3596	NC_016930	TGG	2	6	143262	143267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711887
3597	NC_016930	GTT	2	6	143285	143290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711887
3598	NC_016930	AATT	2	8	143334	143341	50 %	50 %	0 %	0 %	379711887
3599	NC_016930	AAAT	2	8	143402	143409	75 %	25 %	0 %	0 %	379711887
3600	NC_016930	TAT	2	6	143453	143458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711887
3601	NC_016930	ATT	2	6	143510	143515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711887
3602	NC_016930	GTA	2	6	143698	143703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711887
3603	NC_016930	TTAGT	2	10	143708	143717	20 %	60 %	20 %	0 %	379711887
3604	NC_016930	T	7	7	143730	143736	0 %	100 %	0 %	0 %	379711887
3605	NC_016930	ATA	2	6	143771	143776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711887
3606	NC_016930	GCT	2	6	143809	143814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379711887
3607	NC_016930	ATA	2	6	143852	143857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711887
3608	NC_016930	AAT	2	6	143859	143864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711887
3609	NC_016930	GT	3	6	143884	143889	0 %	50 %	50 %	0 %	379711887
3610	NC_016930	GAAA	2	8	143905	143912	75 %	0 %	25 %	0 %	379711887
3611	NC_016930	TTAA	2	8	144019	144026	50 %	50 %	0 %	0 %	379711887
3612	NC_016930	TGCT	2	8	144063	144070	0 %	50 %	25 %	25 %	379711887
3613	NC_016930	GAT	2	6	144090	144095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711887
3614	NC_016930	TTA	2	6	144116	144121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711887
3615	NC_016930	TA	3	6	144171	144176	50 %	50 %	0 %	0 %	379711887
3616	NC_016930	GGT	2	6	144193	144198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711887
3617	NC_016930	TA	3	6	144304	144309	50 %	50 %	0 %	0 %	379711887
3618	NC_016930	T	6	6	144333	144338	0 %	100 %	0 %	0 %	379711887
3619	NC_016930	GTT	2	6	144347	144352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711887
3620	NC_016930	GAT	2	6	144357	144362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711887
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