MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 32764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016930	T	7	7	118444	118450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016930	AAGT	2	8	118500	118507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016930	GCT	2	6	118555	118560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_016930	TC	3	6	118616	118621	0 %	50 %	0 %	50 %	379711861
3005	NC_016930	TAC	2	6	118709	118714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711861
3006	NC_016930	CTT	2	6	118726	118731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711861
3007	NC_016930	AAT	2	6	118766	118771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711861
3008	NC_016930	T	7	7	118896	118902	0 %	100 %	0 %	0 %	379711861
3009	NC_016930	TA	3	6	118925	118930	50 %	50 %	0 %	0 %	379711861
3010	NC_016930	AGC	2	6	118958	118963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711861
3011	NC_016930	AAT	2	6	119006	119011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711861
3012	NC_016930	T	6	6	119112	119117	0 %	100 %	0 %	0 %	379711861
3013	NC_016930	ATC	2	6	119156	119161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711861
3014	NC_016930	ATC	2	6	119183	119188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711861
3015	NC_016930	TTC	2	6	119243	119248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711861
3016	NC_016930	TAA	3	9	119287	119295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711861
3017	NC_016930	AAT	2	6	119438	119443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711861
3018	NC_016930	TA	4	8	119482	119489	50 %	50 %	0 %	0 %	379711861
3019	NC_016930	CCG	2	6	119499	119504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379711861
3020	NC_016930	TAT	2	6	119513	119518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711861
3021	NC_016930	TCA	2	6	119520	119525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711861
3022	NC_016930	TAT	2	6	119539	119544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711861
3023	NC_016930	TTGC	2	8	119569	119576	0 %	50 %	25 %	25 %	379711861
3024	NC_016930	CGC	2	6	119639	119644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379711861
3025	NC_016930	ATA	2	6	119697	119702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711861
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3027	NC_016930	T	7	7	119731	119737	0 %	100 %	0 %	0 %	379711861
3028	NC_016930	AAT	2	6	119786	119791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711861
3029	NC_016930	GAT	2	6	119836	119841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_016930	AAAT	2	8	119848	119855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016930	TA	3	6	119883	119888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016930	AT	3	6	119914	119919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016930	ATA	2	6	119961	119966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016930	CTT	2	6	120009	120014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_016930	T	6	6	120020	120025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016930	T	7	7	120049	120055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016930	T	6	6	120065	120070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016930	TCC	2	6	120084	120089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_016930	CTCAAT	2	12	120107	120118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_016930	T	7	7	120168	120174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016930	ATTCG	2	10	120175	120184	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3042	NC_016930	AGATT	2	10	120193	120202	40 %	40 %	20 %	0 %	379711862
3043	NC_016930	TTC	3	9	120234	120242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711862
3044	NC_016930	AAT	2	6	120252	120257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711862
3045	NC_016930	TTCT	2	8	120268	120275	0 %	75 %	0 %	25 %	379711862
3046	NC_016930	TAA	2	6	120278	120283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711862
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3048	NC_016930	CTAC	2	8	120369	120376	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_016930	TAA	2	6	120382	120387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016930	ATT	3	9	120429	120437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016930	TAT	2	6	120466	120471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_016930	AGTA	2	8	120472	120479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016930	TAAAA	2	10	120510	120519	80 %	20 %	0 %	0 %	379711863
3054	NC_016930	ATT	2	6	120533	120538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711863
3055	NC_016930	TAA	2	6	120548	120553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711863
3056	NC_016930	TTA	2	6	120566	120571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711863
3057	NC_016930	TA	3	6	120598	120603	50 %	50 %	0 %	0 %	379711863
3058	NC_016930	TATAAA	2	12	120610	120621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711863
3059	NC_016930	TC	3	6	120623	120628	0 %	50 %	0 %	50 %	379711863
3060	NC_016930	TA	3	6	120668	120673	50 %	50 %	0 %	0 %	379711863
3061	NC_016930	ATG	2	6	120686	120691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711863
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3063	NC_016930	T	6	6	120771	120776	0 %	100 %	0 %	0 %	379711863
3064	NC_016930	A	6	6	120777	120782	100 %	0 %	0 %	0 %	379711863
3065	NC_016930	T	6	6	120849	120854	0 %	100 %	0 %	0 %	379711863
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3068	NC_016930	AT	3	6	121177	121182	50 %	50 %	0 %	0 %	379711863
3069	NC_016930	TAA	2	6	121218	121223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711863
3070	NC_016930	ATT	2	6	121231	121236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711863
3071	NC_016930	TTTAA	2	10	121282	121291	40 %	60 %	0 %	0 %	379711863
3072	NC_016930	TAA	2	6	121305	121310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711863
3073	NC_016930	CGA	2	6	121343	121348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711863
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3076	NC_016930	ATAA	2	8	121399	121406	75 %	25 %	0 %	0 %	379711863
3077	NC_016930	T	6	6	121407	121412	0 %	100 %	0 %	0 %	379711863
3078	NC_016930	A	7	7	121415	121421	100 %	0 %	0 %	0 %	379711863
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3081	NC_016930	AATA	2	8	121468	121475	75 %	25 %	0 %	0 %	379711863
3082	NC_016930	TAT	2	6	121479	121484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711863
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3084	NC_016930	TAT	2	6	121527	121532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711864
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3088	NC_016930	TGG	2	6	121603	121608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711864
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3090	NC_016930	AAT	2	6	121775	121780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711864
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3093	NC_016930	GTA	2	6	121941	121946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711864
3094	NC_016930	GTA	2	6	122001	122006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711864
3095	NC_016930	TAC	2	6	122066	122071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711864
3096	NC_016930	CGAT	2	8	122119	122126	25 %	25 %	25 %	25 %	379711864
3097	NC_016930	TGT	2	6	122128	122133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711864
3098	NC_016930	TGA	2	6	122154	122159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711864
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3100	NC_016930	TTA	2	6	122296	122301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711865
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3102	NC_016930	TGCC	2	8	122353	122360	0 %	25 %	25 %	50 %	379711865
3103	NC_016930	GTTAC	2	10	122371	122380	20 %	40 %	20 %	20 %	379711865
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3106	NC_016930	TAG	2	6	122632	122637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711865
3107	NC_016930	TAA	2	6	122690	122695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711865
3108	NC_016930	TGAAA	2	10	122732	122741	60 %	20 %	20 %	0 %	379711865
3109	NC_016930	CAA	2	6	122808	122813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711865
3110	NC_016930	A	6	6	122834	122839	100 %	0 %	0 %	0 %	379711865
3111	NC_016930	GAG	2	6	122919	122924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_016930	TTG	2	6	122928	122933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016930	TCG	2	6	122944	122949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_016930	TTA	2	6	123000	123005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_016930	CAA	2	6	123063	123068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_016930	CGCT	2	8	123073	123080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_016930	ACA	2	6	123092	123097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_016930	TCAC	2	8	123102	123109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_016930	GCAG	2	8	123122	123129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_016930	TAA	2	6	123133	123138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_016930	AGCTA	2	10	123157	123166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3122	NC_016930	AT	3	6	123183	123188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016930	GTT	2	6	123312	123317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016930	TAG	2	6	123323	123328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016930	GCA	2	6	123331	123336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_016930	A	7	7	123336	123342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016930	AAT	2	6	123359	123364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_016930	GCAAG	2	10	123390	123399	40 %	0 %	40 %	20 %	379711866
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