MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 32764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016930	ATAG	2	8	20340	20347	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
502	NC_016930	ATAG	2	8	20352	20359	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
503	NC_016930	TAT	2	6	20581	20586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711763
504	NC_016930	ATC	2	6	20615	20620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711763
505	NC_016930	GAA	2	6	20628	20633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
506	NC_016930	ACA	2	6	20683	20688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711763
507	NC_016930	TTC	2	6	20711	20716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711763
508	NC_016930	TAA	2	6	20729	20734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
509	NC_016930	ATTTAG	2	12	20749	20760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379711763
510	NC_016930	CGTT	2	8	20770	20777	0 %	50 %	25 %	25 %	379711763
511	NC_016930	TAA	2	6	20824	20829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
512	NC_016930	AAT	2	6	20877	20882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
513	NC_016930	ACA	2	6	20906	20911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711763
514	NC_016930	A	6	6	20923	20928	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
515	NC_016930	GAT	2	6	20955	20960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711763
516	NC_016930	GAA	2	6	21003	21008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
517	NC_016930	A	6	6	21033	21038	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
518	NC_016930	TAATA	2	10	21044	21053	60 %	40 %	0 %	0 %	379711763
519	NC_016930	AG	3	6	21055	21060	50 %	0 %	50 %	0 %	379711763
520	NC_016930	CA	3	6	21087	21092	50 %	0 %	0 %	50 %	379711763
521	NC_016930	ATT	2	6	21094	21099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711763
522	NC_016930	CAAAG	2	10	21136	21145	60 %	0 %	20 %	20 %	379711763
523	NC_016930	TAGT	2	8	21217	21224	25 %	50 %	25 %	0 %	379711763
524	NC_016930	AAC	2	6	21290	21295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711763
525	NC_016930	TTAGT	2	10	21319	21328	20 %	60 %	20 %	0 %	379711763
526	NC_016930	TC	3	6	21370	21375	0 %	50 %	0 %	50 %	379711763
527	NC_016930	CAG	2	6	21384	21389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379711763
528	NC_016930	A	8	8	21439	21446	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
529	NC_016930	AGCAG	2	10	21462	21471	40 %	0 %	40 %	20 %	379711763
530	NC_016930	ATA	2	6	21484	21489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
531	NC_016930	A	6	6	21572	21577	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
532	NC_016930	TA	3	6	21613	21618	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
533	NC_016930	CAA	2	6	21633	21638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711763
534	NC_016930	TAA	2	6	21664	21669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
535	NC_016930	A	6	6	21714	21719	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
536	NC_016930	CTA	2	6	21745	21750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711763
537	NC_016930	TA	3	6	21749	21754	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
538	NC_016930	TGA	2	6	21767	21772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711763
539	NC_016930	AT	3	6	21792	21797	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
540	NC_016930	ATT	2	6	21863	21868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711763
541	NC_016930	ATTTAG	2	12	21901	21912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379711763
542	NC_016930	AAGC	2	8	21957	21964	50 %	0 %	25 %	25 %	379711763
543	NC_016930	TGA	2	6	22148	22153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711763
544	NC_016930	GTG	2	6	22171	22176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379711763
545	NC_016930	A	6	6	22273	22278	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
546	NC_016930	TAA	2	6	22292	22297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
547	NC_016930	TAAA	2	8	22318	22325	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
548	NC_016930	ATG	3	9	22432	22440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711763
549	NC_016930	AGT	2	6	22446	22451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711763
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551	NC_016930	TAA	2	6	22493	22498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
552	NC_016930	TA	3	6	22515	22520	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
553	NC_016930	A	6	6	22543	22548	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
554	NC_016930	AGA	2	6	22550	22555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
555	NC_016930	AAG	2	6	22600	22605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
556	NC_016930	TA	3	6	22614	22619	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
557	NC_016930	A	6	6	22654	22659	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
558	NC_016930	TAA	2	6	22669	22674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
559	NC_016930	ATG	2	6	22693	22698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711763
560	NC_016930	A	6	6	22699	22704	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
561	NC_016930	TTC	2	6	22706	22711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379711763
562	NC_016930	GAA	2	6	22722	22727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
563	NC_016930	TACCT	2	10	22793	22802	20 %	40 %	0 %	40 %	379711763
564	NC_016930	GAA	2	6	22812	22817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
565	NC_016930	AAG	2	6	22819	22824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
566	NC_016930	AAGT	2	8	22831	22838	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
567	NC_016930	GCATTA	2	12	22884	22895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379711763
568	NC_016930	GAA	2	6	22947	22952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
569	NC_016930	GAA	3	9	22977	22985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
570	NC_016930	TCCGAT	2	12	23001	23012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379711763
571	NC_016930	A	7	7	23069	23075	100 %	0 %	0 %	0 %	379711763
572	NC_016930	AAATGC	2	12	23077	23088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711763
573	NC_016930	GTT	2	6	23127	23132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711763
574	NC_016930	ATA	2	6	23146	23151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
575	NC_016930	TAA	2	6	23183	23188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
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578	NC_016930	TAA	2	6	23264	23269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
579	NC_016930	CTA	2	6	23320	23325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711763
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582	NC_016930	ATTTAA	2	12	23390	23401	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
583	NC_016930	AAT	2	6	23412	23417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
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585	NC_016930	GAA	2	6	23474	23479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711763
586	NC_016930	TTA	2	6	23518	23523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711763
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589	NC_016930	TA	3	6	23692	23697	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
590	NC_016930	AAT	2	6	23745	23750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
591	NC_016930	AT	3	6	23749	23754	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
592	NC_016930	TAA	2	6	23810	23815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
593	NC_016930	AATA	2	8	23873	23880	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
594	NC_016930	GTT	2	6	23883	23888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711763
595	NC_016930	ATA	2	6	23899	23904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711763
596	NC_016930	TAT	2	6	23966	23971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711763
597	NC_016930	TAC	2	6	23987	23992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711763
598	NC_016930	ATT	2	6	24010	24015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711763
599	NC_016930	TAAA	2	8	24019	24026	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
600	NC_016930	TCA	2	6	24038	24043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711763
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602	NC_016930	ACTA	2	8	24155	24162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_016930	ACC	2	6	24209	24214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_016930	TATAA	2	10	24272	24281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016930	AAT	2	6	24289	24294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016930	CAC	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_016930	AGAAAA	2	12	24394	24405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379711764
608	NC_016930	TAC	2	6	24522	24527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016930	AAT	2	6	24665	24670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016930	ATGT	2	8	24818	24825	25 %	50 %	25 %	0 %	379711765
611	NC_016930	AAC	2	6	24866	24871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711765
612	NC_016930	TTAT	2	8	24872	24879	25 %	75 %	0 %	0 %	379711765
613	NC_016930	TAA	2	6	24917	24922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711765
614	NC_016930	TTA	2	6	24935	24940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711765
615	NC_016930	AGCA	2	8	24946	24953	50 %	0 %	25 %	25 %	379711765
616	NC_016930	AT	3	6	24959	24964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016930	CTT	2	6	24994	24999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016930	AAT	2	6	25073	25078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016930	CAAATA	2	12	25172	25183	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
620	NC_016930	AGT	2	6	25192	25197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016930	A	6	6	25237	25242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016930	TAA	2	6	25256	25261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016930	TAA	2	6	25277	25282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016930	TAAAGT	2	12	25335	25346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016930	AG	3	6	25357	25362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016930	ACA	2	6	25415	25420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711766
627	NC_016930	AGA	2	6	25424	25429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711766
628	NC_016930	TTA	2	6	25546	25551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711766
629	NC_016930	GAA	2	6	25632	25637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711766
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631	NC_016930	TAT	2	6	25687	25692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711766
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