MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 3476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016929	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016929	ATTT	2	8	1384	1391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016929	GGCA	2	8	2326	2333	25 %	0 %	50 %	25 %	379022408
4	NC_016929	TTAT	2	8	2833	2840	25 %	75 %	0 %	0 %	379022408
5	NC_016929	TTAT	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	379022408
6	NC_016929	AATA	2	8	5324	5331	75 %	25 %	0 %	0 %	379022409
7	NC_016929	AAGG	2	8	5396	5403	50 %	0 %	50 %	0 %	379022409
8	NC_016929	TCAC	2	8	5551	5558	25 %	25 %	0 %	50 %	379022409
9	NC_016929	TAGT	2	8	6015	6022	25 %	50 %	25 %	0 %	379022409
10	NC_016929	ACCT	2	8	6687	6694	25 %	25 %	0 %	50 %	379022410
11	NC_016929	ATAA	2	8	6778	6785	75 %	25 %	0 %	0 %	379022410
12	NC_016929	ATAA	2	8	6942	6949	75 %	25 %	0 %	0 %	379022410
13	NC_016929	TCAA	2	8	8291	8298	50 %	25 %	0 %	25 %	379022412
14	NC_016929	AGAA	2	8	8743	8750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016929	ATTT	2	8	8841	8848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016929	ATGA	2	8	9120	9127	50 %	25 %	25 %	0 %	379022413
17	NC_016929	CAAA	2	8	9306	9313	75 %	0 %	0 %	25 %	379022413
18	NC_016929	GATC	2	8	9575	9582	25 %	25 %	25 %	25 %	379022413
19	NC_016929	TTGG	2	8	9715	9722	0 %	50 %	50 %	0 %	379022413
20	NC_016929	TAAG	2	8	9891	9898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016929	TAAA	2	8	10109	10116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016929	TAAA	2	8	10136	10143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016929	AGAA	2	8	10319	10326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016929	GTTT	2	8	10475	10482	0 %	75 %	25 %	0 %	379022414
25	NC_016929	GTTT	2	8	10992	10999	0 %	75 %	25 %	0 %	379022415
26	NC_016929	TTAA	2	8	11034	11041	50 %	50 %	0 %	0 %	379022415
27	NC_016929	AATT	2	8	11399	11406	50 %	50 %	0 %	0 %	379022415
28	NC_016929	ATGT	2	8	11646	11653	25 %	50 %	25 %	0 %	379022415
29	NC_016929	CGCA	2	8	12865	12872	25 %	0 %	25 %	50 %	379022416
30	NC_016929	CTTG	2	8	12886	12893	0 %	50 %	25 %	25 %	379022416
31	NC_016929	TAAT	2	8	13045	13052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016929	AAGC	2	8	13409	13416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016929	AGTA	2	8	13453	13460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016929	AATA	2	8	13522	13529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016929	TAAG	2	8	13597	13604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016929	ATGA	2	8	13705	13712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016929	CTAC	2	8	13807	13814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016929	GTCA	2	8	13963	13970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016929	TAAT	2	8	14557	14564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016929	TTAT	2	8	14602	14609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016929	TAAT	2	8	14639	14646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016929	AAAG	2	8	15336	15343	75 %	0 %	25 %	0 %	379022418
43	NC_016929	AAAC	2	8	15830	15837	75 %	0 %	0 %	25 %	379022418
44	NC_016929	AGAA	2	8	15940	15947	75 %	0 %	25 %	0 %	379022418
45	NC_016929	AGTA	2	8	16006	16013	50 %	25 %	25 %	0 %	379022418
46	NC_016929	AATG	2	8	16084	16091	50 %	25 %	25 %	0 %	379022418
47	NC_016929	AGAA	2	8	16576	16583	75 %	0 %	25 %	0 %	379022418
48	NC_016929	TTAG	2	8	16715	16722	25 %	50 %	25 %	0 %	379022418
49	NC_016929	TAAG	2	8	18165	18172	50 %	25 %	25 %	0 %	379022418
50	NC_016929	GTAT	2	8	18273	18280	25 %	50 %	25 %	0 %	379022418
51	NC_016929	AATA	2	8	18895	18902	75 %	25 %	0 %	0 %	379022418
52	NC_016929	TAAA	2	8	19041	19048	75 %	25 %	0 %	0 %	379022418
53	NC_016929	ATCT	2	8	19558	19565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016929	TTAT	2	8	19757	19764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016929	ATAA	3	12	19857	19868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016929	ACTT	2	8	19916	19923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016929	AATT	2	8	22057	22064	50 %	50 %	0 %	0 %	379022420
58	NC_016929	CGTT	2	8	22197	22204	0 %	50 %	25 %	25 %	379022420
59	NC_016929	TTTA	2	8	22521	22528	25 %	75 %	0 %	0 %	379022421
60	NC_016929	CTAT	2	8	22612	22619	25 %	50 %	0 %	25 %	379022421
61	NC_016929	ATTT	2	8	22655	22662	25 %	75 %	0 %	0 %	379022421
62	NC_016929	TGTC	2	8	22719	22726	0 %	50 %	25 %	25 %	379022421
63	NC_016929	TAAA	2	8	22768	22775	75 %	25 %	0 %	0 %	379022421
64	NC_016929	CATA	2	8	23035	23042	50 %	25 %	0 %	25 %	379022422
65	NC_016929	TTAA	2	8	23107	23114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016929	ATAC	2	8	23293	23300	50 %	25 %	0 %	25 %	379022423
67	NC_016929	ATAA	2	8	23717	23724	75 %	25 %	0 %	0 %	379022423
68	NC_016929	ACTT	2	8	23812	23819	25 %	50 %	0 %	25 %	379022423
69	NC_016929	TGAA	2	8	24163	24170	50 %	25 %	25 %	0 %	379022424
70	NC_016929	TATT	2	8	24684	24691	25 %	75 %	0 %	0 %	379022425
71	NC_016929	ATTT	2	8	25115	25122	25 %	75 %	0 %	0 %	379022425
72	NC_016929	TTTA	2	8	25289	25296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016929	ACAT	2	8	25888	25895	50 %	25 %	0 %	25 %	379022426
74	NC_016929	ACTA	2	8	26158	26165	50 %	25 %	0 %	25 %	379022427
75	NC_016929	AAGC	2	8	27002	27009	50 %	0 %	25 %	25 %	379022427
76	NC_016929	TTTG	2	8	27751	27758	0 %	75 %	25 %	0 %	379022427
77	NC_016929	AATT	2	8	27787	27794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016929	ATTA	2	8	27906	27913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016929	AAAT	2	8	28183	28190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016929	TAGA	2	8	28384	28391	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016929	TATT	2	8	28425	28432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016929	TTAG	2	8	28660	28667	25 %	50 %	25 %	0 %	379022428
83	NC_016929	TAAT	2	8	28703	28710	50 %	50 %	0 %	0 %	379022428
84	NC_016929	AATT	2	8	28812	28819	50 %	50 %	0 %	0 %	379022428
85	NC_016929	TTCC	2	8	29195	29202	0 %	50 %	0 %	50 %	379022428
86	NC_016929	AGCA	2	8	30096	30103	50 %	0 %	25 %	25 %	379022429
87	NC_016929	TTAT	2	8	30292	30299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016929	TAAT	2	8	30387	30394	50 %	50 %	0 %	0 %	379022430
89	NC_016929	ATGA	2	8	30443	30450	50 %	25 %	25 %	0 %	379022430
90	NC_016929	ATTT	2	8	30650	30657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016929	ATTA	2	8	30724	30731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016929	AAGT	2	8	30858	30865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016929	CTAG	2	8	31306	31313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016929	TTAA	2	8	31340	31347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016929	ATTT	2	8	31384	31391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016929	TGAA	2	8	31861	31868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016929	ACTT	2	8	31942	31949	25 %	50 %	0 %	25 %	379022431
98	NC_016929	AAAT	2	8	31966	31973	75 %	25 %	0 %	0 %	379022431
99	NC_016929	ATAA	2	8	32442	32449	75 %	25 %	0 %	0 %	379022431
100	NC_016929	AGTA	2	8	32934	32941	50 %	25 %	25 %	0 %	379022432
101	NC_016929	ATTT	2	8	33301	33308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016929	ATTA	3	12	33350	33361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016929	TAAA	2	8	33373	33380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016929	TTAC	2	8	33847	33854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016929	ATCA	2	8	34291	34298	50 %	25 %	0 %	25 %	379022434
106	NC_016929	TTAA	2	8	35183	35190	50 %	50 %	0 %	0 %	379022434
107	NC_016929	TTTA	2	8	35282	35289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016929	AAGT	2	8	35701	35708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016929	AGTA	2	8	36068	36075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016929	CTAG	2	8	36380	36387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016929	AGCA	2	8	36643	36650	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016929	TAAA	2	8	37819	37826	75 %	25 %	0 %	0 %	379022435
113	NC_016929	AGCA	2	8	37898	37905	50 %	0 %	25 %	25 %	379022435
114	NC_016929	ATTG	2	8	38228	38235	25 %	50 %	25 %	0 %	379022435
115	NC_016929	TTAT	2	8	38442	38449	25 %	75 %	0 %	0 %	379022435
116	NC_016929	TGCT	2	8	38524	38531	0 %	50 %	25 %	25 %	379022435
117	NC_016929	GTGA	2	8	38631	38638	25 %	25 %	50 %	0 %	379022435
118	NC_016929	GGCA	2	8	39004	39011	25 %	0 %	50 %	25 %	379022435
119	NC_016929	GTTC	2	8	39409	39416	0 %	50 %	25 %	25 %	379022435
120	NC_016929	TAAG	2	8	40456	40463	50 %	25 %	25 %	0 %	379022436
121	NC_016929	ATAA	2	8	41142	41149	75 %	25 %	0 %	0 %	379022437
122	NC_016929	GTAC	2	8	41383	41390	25 %	25 %	25 %	25 %	379022437
123	NC_016929	CTTT	2	8	41842	41849	0 %	75 %	0 %	25 %	379022437
124	NC_016929	ATTA	2	8	42046	42053	50 %	50 %	0 %	0 %	379022438
125	NC_016929	ATAA	2	8	42666	42673	75 %	25 %	0 %	0 %	379022438
126	NC_016929	ATAA	2	8	42720	42727	75 %	25 %	0 %	0 %	379022438
127	NC_016929	CCAA	2	8	42849	42856	50 %	0 %	0 %	50 %	379022438
128	NC_016929	CATC	2	8	42857	42864	25 %	25 %	0 %	50 %	379022438
129	NC_016929	ATTT	3	12	43033	43044	25 %	75 %	0 %	0 %	379022438
130	NC_016929	CAAA	2	8	43153	43160	75 %	0 %	0 %	25 %	379022438
131	NC_016929	TATT	2	8	43542	43549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016929	TTTA	2	8	43935	43942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016929	GTTT	2	8	43945	43952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016929	AGAA	2	8	44197	44204	75 %	0 %	25 %	0 %	379022439
135	NC_016929	AAAG	2	8	44577	44584	75 %	0 %	25 %	0 %	379022440
136	NC_016929	TAAA	2	8	44644	44651	75 %	25 %	0 %	0 %	379022440
137	NC_016929	AAGA	2	8	45972	45979	75 %	0 %	25 %	0 %	379022442
138	NC_016929	TTTG	2	8	46080	46087	0 %	75 %	25 %	0 %	379022442
139	NC_016929	TAAT	2	8	46479	46486	50 %	50 %	0 %	0 %	379022442
140	NC_016929	GAAT	2	8	47366	47373	50 %	25 %	25 %	0 %	379022443
141	NC_016929	AAGT	2	8	47601	47608	50 %	25 %	25 %	0 %	379022443
142	NC_016929	ATGG	2	8	47923	47930	25 %	25 %	50 %	0 %	379022443
143	NC_016929	AAGA	2	8	48208	48215	75 %	0 %	25 %	0 %	379022443
144	NC_016929	GAAA	2	8	48294	48301	75 %	0 %	25 %	0 %	379022443
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146	NC_016929	TATG	2	8	48651	48658	25 %	50 %	25 %	0 %	379022443
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