MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 30171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016929	AT	3	6	156122	156127	50 %	50 %	0 %	0 %	379022530
4003	NC_016929	TAT	2	6	156134	156139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022530
4004	NC_016929	AGT	2	6	156200	156205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022530
4005	NC_016929	TTA	2	6	156334	156339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022530
4006	NC_016929	A	6	6	156345	156350	100 %	0 %	0 %	0 %	379022530
4007	NC_016929	TAAT	2	8	156374	156381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016929	ATT	2	6	156403	156408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016929	TTA	2	6	156443	156448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016929	TAA	2	6	156459	156464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016929	TAA	2	6	156478	156483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016929	T	6	6	156494	156499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016929	T	6	6	156603	156608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016929	CTT	2	6	156624	156629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_016929	AG	3	6	156645	156650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016929	TAG	3	9	156691	156699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016929	GTGA	2	8	156700	156707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016929	TAA	2	6	156760	156765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016929	T	6	6	156809	156814	0 %	100 %	0 %	0 %	379022531
4020	NC_016929	TAG	2	6	156882	156887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022531
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4022	NC_016929	TTTG	2	8	156918	156925	0 %	75 %	25 %	0 %	379022531
4023	NC_016929	ATA	2	6	156945	156950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022531
4024	NC_016929	ATA	2	6	157017	157022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022532
4025	NC_016929	CTT	2	6	157029	157034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022532
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4029	NC_016929	T	7	7	157141	157147	0 %	100 %	0 %	0 %	379022532
4030	NC_016929	AT	3	6	157152	157157	50 %	50 %	0 %	0 %	379022532
4031	NC_016929	A	7	7	157212	157218	100 %	0 %	0 %	0 %	379022532
4032	NC_016929	TAA	2	6	157363	157368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022532
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4035	NC_016929	A	7	7	157488	157494	100 %	0 %	0 %	0 %	379022532
4036	NC_016929	GTA	2	6	157583	157588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016929	TAAA	2	8	157624	157631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016929	T	6	6	157632	157637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016929	TTA	2	6	157667	157672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016929	ATT	2	6	157676	157681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016929	A	7	7	157694	157700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016929	AT	4	8	157732	157739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016929	A	7	7	157788	157794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016929	CCT	2	6	157876	157881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379022533
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4047	NC_016929	TAAAA	2	10	158019	158028	80 %	20 %	0 %	0 %	379022533
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4061	NC_016929	A	6	6	158279	158284	100 %	0 %	0 %	0 %	379022534
4062	NC_016929	GGT	2	6	158289	158294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022534
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4064	NC_016929	AG	3	6	158313	158318	50 %	0 %	50 %	0 %	379022534
4065	NC_016929	TA	3	6	158338	158343	50 %	50 %	0 %	0 %	379022534
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4084	NC_016929	TATTT	2	10	159091	159100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4104	NC_016929	A	6	6	159790	159795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016929	GAA	2	6	159819	159824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022536
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4109	NC_016929	GCT	2	6	159900	159905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022536
4110	NC_016929	CTG	2	6	159934	159939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022536
4111	NC_016929	GAA	2	6	159945	159950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022536
4112	NC_016929	AGT	2	6	159977	159982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022536
4113	NC_016929	A	6	6	160002	160007	100 %	0 %	0 %	0 %	379022536
4114	NC_016929	TGA	2	6	160073	160078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022536
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4116	NC_016929	CAGAAG	2	12	160114	160125	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379022536
4117	NC_016929	GCT	2	6	160146	160151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022536
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4119	NC_016929	ATT	2	6	160211	160216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016929	TAA	2	6	160246	160251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016929	GTT	2	6	160268	160273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016929	A	6	6	160281	160286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016929	T	6	6	160349	160354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016929	TAAA	2	8	160396	160403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016929	A	6	6	160401	160406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4127	NC_016929	AAT	2	6	160452	160457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_016929	TAAT	2	8	166006	166013	50 %	50 %	0 %	0 %	379022538
4253	NC_016929	ATA	2	6	166059	166064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022538
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4369	NC_016929	AAAAT	3	15	170771	170785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_016929	CAT	2	6	170947	170952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022540
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4494	NC_016929	T	6	6	175876	175881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4495	NC_016929	CAT	2	6	175920	175925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4497	NC_016929	A	6	6	175993	175998	100 %	0 %	0 %	0 %	379022544
4498	NC_016929	TATTAC	2	12	176036	176047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379022544
4499	NC_016929	ATT	2	6	176082	176087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022544
4500	NC_016929	CTA	3	9	176098	176106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022544

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