MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 30171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016929	TTA	2	6	136701	136706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022511
3503	NC_016929	GTG	2	6	136752	136757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022511
3504	NC_016929	ATA	2	6	136764	136769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022511
3505	NC_016929	ATT	2	6	136802	136807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022511
3506	NC_016929	GGT	2	6	136841	136846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022511
3507	NC_016929	A	6	6	136885	136890	100 %	0 %	0 %	0 %	379022511
3508	NC_016929	TAG	2	6	136911	136916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022511
3509	NC_016929	AT	3	6	136959	136964	50 %	50 %	0 %	0 %	379022511
3510	NC_016929	GTT	2	6	136995	137000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022511
3511	NC_016929	AAT	2	6	137027	137032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022511
3512	NC_016929	ATTT	2	8	137156	137163	25 %	75 %	0 %	0 %	379022511
3513	NC_016929	GCGGG	2	10	137169	137178	0 %	0 %	80 %	20 %	379022511
3514	NC_016929	GAA	2	6	137195	137200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022511
3515	NC_016929	A	6	6	137228	137233	100 %	0 %	0 %	0 %	379022511
3516	NC_016929	ACT	2	6	137291	137296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022511
3517	NC_016929	ATAA	2	8	137297	137304	75 %	25 %	0 %	0 %	379022511
3518	NC_016929	AGT	2	6	137320	137325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022511
3519	NC_016929	GAA	2	6	137438	137443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022511
3520	NC_016929	ATTG	2	8	137467	137474	25 %	50 %	25 %	0 %	379022511
3521	NC_016929	GGT	2	6	137498	137503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022511
3522	NC_016929	AAT	2	6	137507	137512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022511
3523	NC_016929	GGT	2	6	137531	137536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022511
3524	NC_016929	TTCCG	2	10	137539	137548	0 %	40 %	20 %	40 %	379022511
3525	NC_016929	ATCT	2	8	137560	137567	25 %	50 %	0 %	25 %	379022511
3526	NC_016929	TAT	2	6	137632	137637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022511
3527	NC_016929	ATG	2	6	137759	137764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022511
3528	NC_016929	A	6	6	137786	137791	100 %	0 %	0 %	0 %	379022511
3529	NC_016929	CTT	2	6	137807	137812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022511
3530	NC_016929	AG	3	6	137914	137919	50 %	0 %	50 %	0 %	379022511
3531	NC_016929	AAT	2	6	138017	138022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_016929	GGCA	2	8	138039	138046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_016929	TTA	2	6	138080	138085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_016929	AAT	2	6	138086	138091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016929	TAA	2	6	138127	138132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022512
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3537	NC_016929	CTTTTG	2	12	138156	138167	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379022512
3538	NC_016929	GTAT	2	8	138170	138177	25 %	50 %	25 %	0 %	379022512
3539	NC_016929	TTA	2	6	138198	138203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022512
3540	NC_016929	TA	3	6	138260	138265	50 %	50 %	0 %	0 %	379022512
3541	NC_016929	CTA	2	6	138270	138275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022512
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3543	NC_016929	TCTT	2	8	138308	138315	0 %	75 %	0 %	25 %	379022512
3544	NC_016929	GTG	2	6	138366	138371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022512
3545	NC_016929	AT	3	6	138412	138417	50 %	50 %	0 %	0 %	379022512
3546	NC_016929	ATTG	2	8	138454	138461	25 %	50 %	25 %	0 %	379022512
3547	NC_016929	AT	4	8	138470	138477	50 %	50 %	0 %	0 %	379022512
3548	NC_016929	A	7	7	138485	138491	100 %	0 %	0 %	0 %	379022512
3549	NC_016929	TA	3	6	138515	138520	50 %	50 %	0 %	0 %	379022512
3550	NC_016929	GAA	2	6	138524	138529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022512
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3552	NC_016929	GCTC	2	8	138592	138599	0 %	25 %	25 %	50 %	379022512
3553	NC_016929	TGA	2	6	138619	138624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022512
3554	NC_016929	T	6	6	138645	138650	0 %	100 %	0 %	0 %	379022512
3555	NC_016929	ATA	2	6	138684	138689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022512
3556	NC_016929	ATCA	2	8	138693	138700	50 %	25 %	0 %	25 %	379022512
3557	NC_016929	TAG	2	6	138706	138711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022512
3558	NC_016929	ATTT	2	8	138760	138767	25 %	75 %	0 %	0 %	379022512
3559	NC_016929	CAA	2	6	138774	138779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022512
3560	NC_016929	TGG	2	6	138788	138793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022512
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3562	NC_016929	TTAAAG	2	12	138824	138835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379022512
3563	NC_016929	AAT	2	6	138894	138899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022512
3564	NC_016929	TCA	2	6	138901	138906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022513
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3567	NC_016929	GCTT	2	8	139173	139180	0 %	50 %	25 %	25 %	379022513
3568	NC_016929	TA	3	6	139189	139194	50 %	50 %	0 %	0 %	379022513
3569	NC_016929	GAA	2	6	139210	139215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022513
3570	NC_016929	G	6	6	139222	139227	0 %	0 %	100 %	0 %	379022513
3571	NC_016929	TAA	2	6	139239	139244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022513
3572	NC_016929	TA	3	6	139278	139283	50 %	50 %	0 %	0 %	379022513
3573	NC_016929	ATA	2	6	139310	139315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022513
3574	NC_016929	ATC	2	6	139409	139414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022513
3575	NC_016929	ACCT	2	8	139415	139422	25 %	25 %	0 %	50 %	379022513
3576	NC_016929	GCT	2	6	139450	139455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022513
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3585	NC_016929	ATT	2	6	139721	139726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022514
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3588	NC_016929	T	6	6	139987	139992	0 %	100 %	0 %	0 %	379022514
3589	NC_016929	ATC	2	6	140001	140006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022514
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3591	NC_016929	GAT	2	6	140114	140119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022514
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3594	NC_016929	TAG	2	6	140271	140276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022514
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3596	NC_016929	ATTT	2	8	140388	140395	25 %	75 %	0 %	0 %	379022514
3597	NC_016929	TTGT	2	8	140396	140403	0 %	75 %	25 %	0 %	379022514
3598	NC_016929	AAT	2	6	140426	140431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022514
3599	NC_016929	TAT	2	6	140503	140508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_016929	A	6	6	140635	140640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_016929	ATA	2	6	140645	140650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_016929	GGT	2	6	140701	140706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022515
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3604	NC_016929	GCTT	2	8	140785	140792	0 %	50 %	25 %	25 %	379022515
3605	NC_016929	GAA	2	6	140852	140857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022515
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3607	NC_016929	A	8	8	140974	140981	100 %	0 %	0 %	0 %	379022515
3608	NC_016929	AGAA	2	8	141006	141013	75 %	0 %	25 %	0 %	379022515
3609	NC_016929	TGA	2	6	141070	141075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022515
3610	NC_016929	TTA	2	6	141121	141126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022515
3611	NC_016929	AAT	3	9	141137	141145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022516
3612	NC_016929	GAA	2	6	141197	141202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022516
3613	NC_016929	AGCA	2	8	141256	141263	50 %	0 %	25 %	25 %	379022516
3614	NC_016929	GCA	2	6	141265	141270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022516
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3619	NC_016929	ATA	2	6	141613	141618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022516
3620	NC_016929	CTA	2	6	141631	141636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022516
3621	NC_016929	AAG	2	6	141637	141642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022516
3622	NC_016929	T	6	6	141653	141658	0 %	100 %	0 %	0 %	379022516
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3997	NC_016929	TGAT	2	8	155956	155963	25 %	50 %	25 %	0 %	379022530
3998	NC_016929	ATG	2	6	155995	156000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022530
3999	NC_016929	GCA	2	6	156030	156035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022530
4000	NC_016929	GCA	2	6	156039	156044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022530

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