MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 30171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016929	TA	3	6	115638	115643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016929	ATT	2	6	115704	115709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022498
3003	NC_016929	GTA	2	6	115715	115720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3004	NC_016929	TAA	2	6	115736	115741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3005	NC_016929	TC	3	6	115868	115873	0 %	50 %	0 %	50 %	379022498
3006	NC_016929	TTG	2	6	115883	115888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022498
3007	NC_016929	ATTT	2	8	115976	115983	25 %	75 %	0 %	0 %	379022498
3008	NC_016929	ATG	2	6	115997	116002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3009	NC_016929	GTA	2	6	116084	116089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3010	NC_016929	AATT	2	8	116096	116103	50 %	50 %	0 %	0 %	379022498
3011	NC_016929	TTGCTA	2	12	116138	116149	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379022498
3012	NC_016929	AAG	2	6	116189	116194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022498
3013	NC_016929	ATA	2	6	116204	116209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3014	NC_016929	ATT	2	6	116216	116221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022498
3015	NC_016929	TGA	2	6	116247	116252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3016	NC_016929	AT	3	6	116284	116289	50 %	50 %	0 %	0 %	379022498
3017	NC_016929	AAGATA	2	12	116303	116314	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379022498
3018	NC_016929	CAA	2	6	116327	116332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022498
3019	NC_016929	AT	3	6	116367	116372	50 %	50 %	0 %	0 %	379022498
3020	NC_016929	TAA	2	6	116400	116405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3021	NC_016929	TTGA	2	8	116431	116438	25 %	50 %	25 %	0 %	379022498
3022	NC_016929	AGT	2	6	116485	116490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3023	NC_016929	GGA	2	6	116497	116502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022498
3024	NC_016929	AGT	2	6	116538	116543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3025	NC_016929	CCTCT	2	10	116549	116558	0 %	40 %	0 %	60 %	379022498
3026	NC_016929	TG	3	6	116607	116612	0 %	50 %	50 %	0 %	379022498
3027	NC_016929	ATT	2	6	116667	116672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022498
3028	NC_016929	TATGT	2	10	116722	116731	20 %	60 %	20 %	0 %	379022498
3029	NC_016929	T	6	6	116731	116736	0 %	100 %	0 %	0 %	379022498
3030	NC_016929	ACC	2	6	116766	116771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022498
3031	NC_016929	TA	3	6	116782	116787	50 %	50 %	0 %	0 %	379022498
3032	NC_016929	TGC	2	6	116946	116951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022498
3033	NC_016929	ATG	2	6	116993	116998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3034	NC_016929	ATT	2	6	117050	117055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022498
3035	NC_016929	AT	3	6	117065	117070	50 %	50 %	0 %	0 %	379022498
3036	NC_016929	T	6	6	117111	117116	0 %	100 %	0 %	0 %	379022498
3037	NC_016929	TTTAGT	2	12	117130	117141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379022498
3038	NC_016929	AT	3	6	117150	117155	50 %	50 %	0 %	0 %	379022498
3039	NC_016929	ATG	2	6	117190	117195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3040	NC_016929	TGC	2	6	117240	117245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022498
3041	NC_016929	CTC	2	6	117305	117310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379022498
3042	NC_016929	ATT	2	6	117347	117352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022498
3043	NC_016929	TGG	2	6	117398	117403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022498
3044	NC_016929	TAA	2	6	117549	117554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3045	NC_016929	CTA	2	6	117581	117586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022498
3046	NC_016929	A	6	6	117663	117668	100 %	0 %	0 %	0 %	379022498
3047	NC_016929	GTA	2	6	117689	117694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3048	NC_016929	T	6	6	117772	117777	0 %	100 %	0 %	0 %	379022498
3049	NC_016929	GTTA	2	8	117825	117832	25 %	50 %	25 %	0 %	379022498
3050	NC_016929	TAG	2	6	117867	117872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3051	NC_016929	TGC	2	6	117888	117893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022498
3052	NC_016929	AAT	2	6	117919	117924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3053	NC_016929	GCAA	2	8	117939	117946	50 %	0 %	25 %	25 %	379022498
3054	NC_016929	TGC	2	6	117987	117992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022498
3055	NC_016929	AGGAG	2	10	118021	118030	40 %	0 %	60 %	0 %	379022498
3056	NC_016929	GGT	2	6	118048	118053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022498
3057	NC_016929	TGC	2	6	118080	118085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022498
3058	NC_016929	GT	3	6	118094	118099	0 %	50 %	50 %	0 %	379022498
3059	NC_016929	TCT	2	6	118129	118134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022498
3060	NC_016929	AGT	2	6	118162	118167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3061	NC_016929	TGT	2	6	118182	118187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022498
3062	NC_016929	TAC	3	9	118188	118196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022498
3063	NC_016929	CTTC	2	8	118222	118229	0 %	50 %	0 %	50 %	379022498
3064	NC_016929	ATA	2	6	118307	118312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3065	NC_016929	A	6	6	118324	118329	100 %	0 %	0 %	0 %	379022498
3066	NC_016929	ATA	2	6	118337	118342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3067	NC_016929	GAAT	2	8	118500	118507	50 %	25 %	25 %	0 %	379022498
3068	NC_016929	TAG	2	6	118508	118513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3069	NC_016929	GGA	3	9	118519	118527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022498
3070	NC_016929	GAA	2	6	118549	118554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022498
3071	NC_016929	A	6	6	118602	118607	100 %	0 %	0 %	0 %	379022498
3072	NC_016929	GTA	2	6	118612	118617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3073	NC_016929	A	8	8	118622	118629	100 %	0 %	0 %	0 %	379022498
3074	NC_016929	ATA	2	6	118631	118636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3075	NC_016929	TAA	2	6	118644	118649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3076	NC_016929	TGA	2	6	118665	118670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3077	NC_016929	TAA	2	6	118674	118679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3078	NC_016929	AGA	2	6	118698	118703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022498
3079	NC_016929	AGA	2	6	118731	118736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022498
3080	NC_016929	TAC	3	9	118740	118748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022498
3081	NC_016929	A	6	6	118760	118765	100 %	0 %	0 %	0 %	379022498
3082	NC_016929	GAAT	2	8	118902	118909	50 %	25 %	25 %	0 %	379022498
3083	NC_016929	TAG	2	6	118910	118915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3084	NC_016929	GGA	3	9	118921	118929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022498
3085	NC_016929	GAA	2	6	118951	118956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022498
3086	NC_016929	ACG	2	6	118965	118970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022498
3087	NC_016929	A	6	6	119004	119009	100 %	0 %	0 %	0 %	379022498
3088	NC_016929	GTA	2	6	119014	119019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022498
3089	NC_016929	A	8	8	119024	119031	100 %	0 %	0 %	0 %	379022498
3090	NC_016929	ATA	2	6	119033	119038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022498
3091	NC_016929	TAT	2	6	119074	119079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022499
3092	NC_016929	TAGC	2	8	119103	119110	25 %	25 %	25 %	25 %	379022499
3093	NC_016929	TA	3	6	119189	119194	50 %	50 %	0 %	0 %	379022499
3094	NC_016929	GTTTT	2	10	119257	119266	0 %	80 %	20 %	0 %	379022499
3095	NC_016929	GTA	3	9	119280	119288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022499
3096	NC_016929	AAG	2	6	119327	119332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022499
3097	NC_016929	ATA	2	6	119352	119357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022499
3098	NC_016929	A	6	6	119408	119413	100 %	0 %	0 %	0 %	379022499
3099	NC_016929	CCG	2	6	119492	119497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379022499
3100	NC_016929	TTAA	2	8	119570	119577	50 %	50 %	0 %	0 %	379022499
3101	NC_016929	TGCAG	2	10	119590	119599	20 %	20 %	40 %	20 %	379022499
3102	NC_016929	TAA	2	6	119617	119622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022499
3103	NC_016929	T	6	6	119627	119632	0 %	100 %	0 %	0 %	379022499
3104	NC_016929	GCA	2	6	119729	119734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022499
3105	NC_016929	TAT	2	6	119746	119751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022499
3106	NC_016929	T	6	6	119753	119758	0 %	100 %	0 %	0 %	379022499
3107	NC_016929	TAAA	2	8	119775	119782	75 %	25 %	0 %	0 %	379022499
3108	NC_016929	A	6	6	119799	119804	100 %	0 %	0 %	0 %	379022499
3109	NC_016929	TAA	2	6	119817	119822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022499
3110	NC_016929	TTG	2	6	119832	119837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022499
3111	NC_016929	AGC	2	6	119873	119878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022499
3112	NC_016929	AGC	2	6	119935	119940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022499
3113	NC_016929	GAT	2	6	119956	119961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022499
3114	NC_016929	GCA	2	6	119969	119974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022499
3115	NC_016929	ATTG	2	8	120050	120057	25 %	50 %	25 %	0 %	379022499
3116	NC_016929	TTA	2	6	120067	120072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022499
3117	NC_016929	TCGG	2	8	120125	120132	0 %	25 %	50 %	25 %	379022499
3118	NC_016929	TAA	2	6	120148	120153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022499
3119	NC_016929	T	6	6	120227	120232	0 %	100 %	0 %	0 %	379022499
3120	NC_016929	T	6	6	120248	120253	0 %	100 %	0 %	0 %	379022499
3121	NC_016929	GCA	2	6	120278	120283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022499
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