MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 30171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016929	T	6	6	57711	57716	0 %	100 %	0 %	0 %	379022451
1502	NC_016929	ATT	2	6	57752	57757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016929	TA	3	6	57801	57806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016929	AATT	2	8	57807	57814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016929	AT	3	6	57815	57820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016929	T	6	6	57825	57830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016929	ATA	2	6	57838	57843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016929	TAA	2	6	57903	57908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016929	AGTA	2	8	57961	57968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016929	AT	3	6	58001	58006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016929	A	7	7	58025	58031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016929	TAAA	2	8	58078	58085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016929	T	6	6	58091	58096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016929	GAT	2	6	58132	58137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016929	TAAT	2	8	58219	58226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016929	CAT	2	6	58270	58275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_016929	TGTT	2	8	58288	58295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016929	ATG	2	6	58313	58318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016929	GGTAA	2	10	58350	58359	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016929	T	6	6	58368	58373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016929	ATT	2	6	58401	58406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016929	ATT	2	6	58411	58416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016929	TTAT	2	8	58424	58431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016929	TCT	2	6	58456	58461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_016929	TTTCT	2	10	58470	58479	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1526	NC_016929	AT	3	6	58487	58492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016929	TAA	2	6	58586	58591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016929	AT	3	6	58605	58610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016929	TAA	2	6	58647	58652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016929	TTAT	2	8	58653	58660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016929	AAT	2	6	58683	58688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016929	TTTA	2	8	58689	58696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016929	AAAT	2	8	58763	58770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016929	ACG	2	6	58791	58796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022452
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1536	NC_016929	AAT	2	6	58829	58834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022452
1537	NC_016929	AAG	2	6	58860	58865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022452
1538	NC_016929	TTC	2	6	58867	58872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022452
1539	NC_016929	ATG	2	6	58884	58889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022452
1540	NC_016929	TTA	2	6	58899	58904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022452
1541	NC_016929	GTA	2	6	58941	58946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022452
1542	NC_016929	AT	3	6	58985	58990	50 %	50 %	0 %	0 %	379022452
1543	NC_016929	TAC	2	6	58993	58998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022452
1544	NC_016929	T	8	8	59082	59089	0 %	100 %	0 %	0 %	379022452
1545	NC_016929	ATCCTG	2	12	59143	59154	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379022452
1546	NC_016929	TAT	2	6	59278	59283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022452
1547	NC_016929	TTA	2	6	59383	59388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022452
1548	NC_016929	GAA	2	6	59406	59411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022452
1549	NC_016929	TTAT	2	8	59448	59455	25 %	75 %	0 %	0 %	379022452
1550	NC_016929	TAT	3	9	59453	59461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022452
1551	NC_016929	AGC	2	6	59469	59474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022452
1552	NC_016929	AAT	2	6	59480	59485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022452
1553	NC_016929	GATG	2	8	59497	59504	25 %	25 %	50 %	0 %	379022452
1554	NC_016929	CTT	2	6	59529	59534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022452
1555	NC_016929	A	8	8	59557	59564	100 %	0 %	0 %	0 %	379022452
1556	NC_016929	GAT	2	6	59600	59605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022452
1557	NC_016929	CAA	2	6	59713	59718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022452
1558	NC_016929	AAG	2	6	59719	59724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022452
1559	NC_016929	GGTTG	2	10	59763	59772	0 %	40 %	60 %	0 %	379022452
1560	NC_016929	TGC	2	6	59828	59833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022452
1561	NC_016929	ATG	2	6	59850	59855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022452
1562	NC_016929	TTAC	2	8	59856	59863	25 %	50 %	0 %	25 %	379022452
1563	NC_016929	TGC	2	6	59867	59872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022452
1564	NC_016929	T	6	6	59874	59879	0 %	100 %	0 %	0 %	379022452
1565	NC_016929	T	6	6	59889	59894	0 %	100 %	0 %	0 %	379022452
1566	NC_016929	AT	3	6	60032	60037	50 %	50 %	0 %	0 %	379022452
1567	NC_016929	TAT	2	6	60119	60124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022452
1568	NC_016929	TTTAT	2	10	60138	60147	20 %	80 %	0 %	0 %	379022452
1569	NC_016929	GTAATA	2	12	60201	60212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379022452
1570	NC_016929	AT	3	6	60219	60224	50 %	50 %	0 %	0 %	379022452
1571	NC_016929	TAAA	2	8	60238	60245	75 %	25 %	0 %	0 %	379022452
1572	NC_016929	A	6	6	60304	60309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016929	AGA	2	6	60321	60326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016929	T	6	6	60331	60336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016929	A	7	7	60404	60410	100 %	0 %	0 %	0 %	379022453
1576	NC_016929	TAT	3	9	60443	60451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022453
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1581	NC_016929	TTA	2	6	60601	60606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022453
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1589	NC_016929	TA	3	6	60943	60948	50 %	50 %	0 %	0 %	379022453
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1594	NC_016929	TGTT	2	8	61111	61118	0 %	75 %	25 %	0 %	379022453
1595	NC_016929	TA	3	6	61119	61124	50 %	50 %	0 %	0 %	379022453
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1600	NC_016929	T	6	6	61398	61403	0 %	100 %	0 %	0 %	379022453
1601	NC_016929	TGC	3	9	61433	61441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022453
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1603	NC_016929	AGC	2	6	61508	61513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022453
1604	NC_016929	T	6	6	61575	61580	0 %	100 %	0 %	0 %	379022453
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1610	NC_016929	ATG	2	6	61816	61821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022454
1611	NC_016929	T	6	6	61839	61844	0 %	100 %	0 %	0 %	379022454
1612	NC_016929	AT	3	6	61859	61864	50 %	50 %	0 %	0 %	379022454
1613	NC_016929	AGT	2	6	61877	61882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022454
1614	NC_016929	TGA	2	6	61949	61954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022454
1615	NC_016929	TAA	2	6	62063	62068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022454
1616	NC_016929	AAT	2	6	62083	62088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022454
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1618	NC_016929	CT	3	6	62176	62181	0 %	50 %	0 %	50 %	379022455
1619	NC_016929	TGG	2	6	62234	62239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022455
1620	NC_016929	GTTAT	2	10	62293	62302	20 %	60 %	20 %	0 %	379022455
1621	NC_016929	CAG	2	6	62350	62355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022455
1622	NC_016929	A	6	6	62394	62399	100 %	0 %	0 %	0 %	379022455
1623	NC_016929	AT	3	6	62437	62442	50 %	50 %	0 %	0 %	379022455
1624	NC_016929	AGA	2	6	62456	62461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022455
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1627	NC_016929	ATG	2	6	62503	62508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022455
1628	NC_016929	A	6	6	62527	62532	100 %	0 %	0 %	0 %	379022455
1629	NC_016929	GTAGA	2	10	62599	62608	40 %	20 %	40 %	0 %	379022455
1630	NC_016929	GAA	2	6	62610	62615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022455
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