MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 30171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016929	A	7	7	38102	38108	100 %	0 %	0 %	0 %	379022435
1002	NC_016929	AAT	2	6	38156	38161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022435
1003	NC_016929	TGA	2	6	38168	38173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022435
1004	NC_016929	AAG	2	6	38180	38185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022435
1005	NC_016929	ACG	2	6	38204	38209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022435
1006	NC_016929	AAT	2	6	38217	38222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022435
1007	NC_016929	ATTG	2	8	38228	38235	25 %	50 %	25 %	0 %	379022435
1008	NC_016929	TAT	2	6	38327	38332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022435
1009	NC_016929	GAG	2	6	38385	38390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022435
1010	NC_016929	ATT	2	6	38436	38441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022435
1011	NC_016929	TTAT	2	8	38442	38449	25 %	75 %	0 %	0 %	379022435
1012	NC_016929	TGA	2	6	38450	38455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022435
1013	NC_016929	TGCT	2	8	38524	38531	0 %	50 %	25 %	25 %	379022435
1014	NC_016929	CTA	2	6	38557	38562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022435
1015	NC_016929	AT	3	6	38582	38587	50 %	50 %	0 %	0 %	379022435
1016	NC_016929	GCA	2	6	38598	38603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022435
1017	NC_016929	CCG	2	6	38609	38614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379022435
1018	NC_016929	GTGA	2	8	38631	38638	25 %	25 %	50 %	0 %	379022435
1019	NC_016929	CAT	2	6	38697	38702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022435
1020	NC_016929	GCA	2	6	38733	38738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022435
1021	NC_016929	TTGAT	2	10	38791	38800	20 %	60 %	20 %	0 %	379022435
1022	NC_016929	TGA	2	6	38801	38806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022435
1023	NC_016929	TGA	2	6	38855	38860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022435
1024	NC_016929	TCG	2	6	38867	38872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022435
1025	NC_016929	TAT	2	6	38873	38878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022435
1026	NC_016929	GCA	2	6	38898	38903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022435
1027	NC_016929	AGA	2	6	38954	38959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022435
1028	NC_016929	ATATG	2	10	38984	38993	40 %	40 %	20 %	0 %	379022435
1029	NC_016929	GGCA	2	8	39004	39011	25 %	0 %	50 %	25 %	379022435
1030	NC_016929	AGA	2	6	39047	39052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022435
1031	NC_016929	ATA	2	6	39178	39183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022435
1032	NC_016929	GTT	2	6	39188	39193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022435
1033	NC_016929	TAT	2	6	39227	39232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022435
1034	NC_016929	GTGAGC	2	12	39274	39285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379022435
1035	NC_016929	AGA	2	6	39366	39371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022435
1036	NC_016929	GTTC	2	8	39409	39416	0 %	50 %	25 %	25 %	379022435
1037	NC_016929	CTTTT	2	10	39472	39481	0 %	80 %	0 %	20 %	379022435
1038	NC_016929	TGA	2	6	39482	39487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022435
1039	NC_016929	AT	3	6	39521	39526	50 %	50 %	0 %	0 %	379022435
1040	NC_016929	CTC	2	6	39559	39564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379022435
1041	NC_016929	ATT	2	6	39635	39640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022435
1042	NC_016929	TGA	2	6	39641	39646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022435
1043	NC_016929	TGC	2	6	39682	39687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022435
1044	NC_016929	TGA	2	6	39695	39700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022435
1045	NC_016929	TAT	2	6	39749	39754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022435
1046	NC_016929	AAG	2	6	39799	39804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022435
1047	NC_016929	ATTAT	2	10	39891	39900	40 %	60 %	0 %	0 %	379022435
1048	NC_016929	GAA	2	6	39999	40004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022435
1049	NC_016929	ATT	2	6	40015	40020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022435
1050	NC_016929	AAT	2	6	40092	40097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022435
1051	NC_016929	AGA	2	6	40163	40168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022435
1052	NC_016929	TTA	2	6	40236	40241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016929	ATTTAT	2	12	40280	40291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016929	TAA	2	6	40334	40339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022436
1055	NC_016929	TTA	2	6	40359	40364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022436
1056	NC_016929	TAA	2	6	40382	40387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022436
1057	NC_016929	ACT	2	6	40390	40395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022436
1058	NC_016929	AAT	2	6	40421	40426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022436
1059	NC_016929	TCT	2	6	40436	40441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022436
1060	NC_016929	TAAG	2	8	40456	40463	50 %	25 %	25 %	0 %	379022436
1061	NC_016929	AGT	2	6	40494	40499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022436
1062	NC_016929	TTG	2	6	40500	40505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022436
1063	NC_016929	TTA	2	6	40517	40522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022436
1064	NC_016929	T	6	6	40561	40566	0 %	100 %	0 %	0 %	379022436
1065	NC_016929	GTT	2	6	40601	40606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022436
1066	NC_016929	AT	3	6	40615	40620	50 %	50 %	0 %	0 %	379022436
1067	NC_016929	A	6	6	40677	40682	100 %	0 %	0 %	0 %	379022436
1068	NC_016929	ATA	2	6	40691	40696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022436
1069	NC_016929	A	6	6	40730	40735	100 %	0 %	0 %	0 %	379022436
1070	NC_016929	TTG	2	6	40761	40766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022436
1071	NC_016929	TGT	2	6	40797	40802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022436
1072	NC_016929	T	6	6	40833	40838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016929	TTA	3	9	40865	40873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016929	AAG	2	6	40889	40894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016929	ATA	2	6	40909	40914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016929	GTT	2	6	40941	40946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016929	TAT	2	6	40959	40964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016929	CTC	2	6	40978	40983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_016929	TTC	2	6	41019	41024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022437
1080	NC_016929	TTA	3	9	41071	41079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022437
1081	NC_016929	ATAA	2	8	41142	41149	75 %	25 %	0 %	0 %	379022437
1082	NC_016929	ACT	2	6	41175	41180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022437
1083	NC_016929	AGC	2	6	41205	41210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022437
1084	NC_016929	ATT	2	6	41247	41252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022437
1085	NC_016929	TAC	2	6	41291	41296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022437
1086	NC_016929	TGC	2	6	41328	41333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022437
1087	NC_016929	ATT	2	6	41374	41379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022437
1088	NC_016929	GTAC	2	8	41383	41390	25 %	25 %	25 %	25 %	379022437
1089	NC_016929	ATTTAT	2	12	41453	41464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022437
1090	NC_016929	TCC	2	6	41502	41507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379022437
1091	NC_016929	CAT	2	6	41561	41566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022437
1092	NC_016929	TAG	2	6	41570	41575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022437
1093	NC_016929	ATAAGG	2	12	41652	41663	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379022437
1094	NC_016929	T	7	7	41727	41733	0 %	100 %	0 %	0 %	379022437
1095	NC_016929	ACC	2	6	41778	41783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022437
1096	NC_016929	GCA	2	6	41806	41811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022437
1097	NC_016929	CTTT	2	8	41842	41849	0 %	75 %	0 %	25 %	379022437
1098	NC_016929	GCA	2	6	41896	41901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022437
1099	NC_016929	TAC	2	6	41910	41915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022437
1100	NC_016929	ATC	2	6	42003	42008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022437
1101	NC_016929	ATTA	2	8	42046	42053	50 %	50 %	0 %	0 %	379022438
1102	NC_016929	AAT	2	6	42110	42115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022438
1103	NC_016929	T	7	7	42115	42121	0 %	100 %	0 %	0 %	379022438
1104	NC_016929	T	6	6	42227	42232	0 %	100 %	0 %	0 %	379022438
1105	NC_016929	GAT	2	6	42255	42260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022438
1106	NC_016929	GTA	2	6	42399	42404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022438
1107	NC_016929	ATG	2	6	42512	42517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022438
1108	NC_016929	AAT	2	6	42546	42551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022438
1109	NC_016929	CCA	2	6	42557	42562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022438
1110	NC_016929	T	6	6	42590	42595	0 %	100 %	0 %	0 %	379022438
1111	NC_016929	TTG	3	9	42638	42646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022438
1112	NC_016929	ATAA	2	8	42666	42673	75 %	25 %	0 %	0 %	379022438
1113	NC_016929	CCG	2	6	42702	42707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379022438
1114	NC_016929	ATAA	2	8	42720	42727	75 %	25 %	0 %	0 %	379022438
1115	NC_016929	GCT	2	6	42750	42755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022438
1116	NC_016929	AAT	2	6	42763	42768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022438
1117	NC_016929	TAA	2	6	42785	42790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022438
1118	NC_016929	TTC	2	6	42795	42800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022438
1119	NC_016929	CCAA	2	8	42849	42856	50 %	0 %	0 %	50 %	379022438
1120	NC_016929	CATC	2	8	42857	42864	25 %	25 %	0 %	50 %	379022438
1121	NC_016929	ATG	2	6	42947	42952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022438
1122	NC_016929	ATTT	3	12	43033	43044	25 %	75 %	0 %	0 %	379022438
1123	NC_016929	ATT	2	6	43094	43099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022438
1124	NC_016929	ATA	2	6	43103	43108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022438
1125	NC_016929	CAAA	2	8	43153	43160	75 %	0 %	0 %	25 %	379022438
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1127	NC_016929	AT	3	6	43266	43271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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