MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 30171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016929	CGG	2	6	213299	213304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379022580
5502	NC_016929	TGC	2	6	213350	213355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022580
5503	NC_016929	ATA	2	6	213396	213401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022580
5504	NC_016929	TGT	2	6	213497	213502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022580
5505	NC_016929	TTGT	2	8	213511	213518	0 %	75 %	25 %	0 %	379022580
5506	NC_016929	AAG	2	6	213673	213678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022580
5507	NC_016929	AAAGC	2	10	213684	213693	60 %	0 %	20 %	20 %	379022580
5508	NC_016929	TAAA	2	8	213802	213809	75 %	25 %	0 %	0 %	379022580
5509	NC_016929	A	7	7	213807	213813	100 %	0 %	0 %	0 %	379022580
5510	NC_016929	ATT	2	6	213884	213889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022580
5511	NC_016929	AGCT	2	8	213949	213956	25 %	25 %	25 %	25 %	379022580
5512	NC_016929	GCT	2	6	213965	213970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022580
5513	NC_016929	TA	3	6	213984	213989	50 %	50 %	0 %	0 %	379022580
5514	NC_016929	TAC	2	6	214064	214069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022580
5515	NC_016929	TA	3	6	214071	214076	50 %	50 %	0 %	0 %	379022580
5516	NC_016929	AAT	2	6	214083	214088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022580
5517	NC_016929	ATT	2	6	214239	214244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022580
5518	NC_016929	GA	3	6	214359	214364	50 %	0 %	50 %	0 %	379022580
5519	NC_016929	AGA	2	6	214382	214387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022580
5520	NC_016929	ATGT	2	8	214392	214399	25 %	50 %	25 %	0 %	379022580
5521	NC_016929	TGA	2	6	214454	214459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022580
5522	NC_016929	TGA	2	6	214529	214534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022580
5523	NC_016929	TAC	2	6	214547	214552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022580
5524	NC_016929	TAAA	2	8	214576	214583	75 %	25 %	0 %	0 %	379022580
5525	NC_016929	TAT	2	6	214632	214637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022580
5526	NC_016929	TTTG	2	8	214640	214647	0 %	75 %	25 %	0 %	379022580
5527	NC_016929	AAT	2	6	214659	214664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022580
5528	NC_016929	ATT	2	6	214677	214682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022580
5529	NC_016929	A	7	7	214708	214714	100 %	0 %	0 %	0 %	379022580
5530	NC_016929	CAT	2	6	214723	214728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022580
5531	NC_016929	A	7	7	214733	214739	100 %	0 %	0 %	0 %	379022580
5532	NC_016929	ATTT	2	8	214757	214764	25 %	75 %	0 %	0 %	379022580
5533	NC_016929	GAA	2	6	214773	214778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022580
5534	NC_016929	GAA	2	6	214781	214786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022580
5535	NC_016929	TA	3	6	214803	214808	50 %	50 %	0 %	0 %	379022580
5536	NC_016929	GCC	2	6	214839	214844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379022580
5537	NC_016929	TAA	2	6	214847	214852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022580
5538	NC_016929	GTAG	2	8	214866	214873	25 %	25 %	50 %	0 %	379022580
5539	NC_016929	AG	3	6	214872	214877	50 %	0 %	50 %	0 %	379022580
5540	NC_016929	CAG	2	6	214891	214896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022580
5541	NC_016929	ATA	2	6	214915	214920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022580
5542	NC_016929	CAG	2	6	214923	214928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022580
5543	NC_016929	AAG	2	6	214942	214947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022580
5544	NC_016929	GTT	2	6	214992	214997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_016929	ATT	2	6	215036	215041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_016929	T	6	6	215056	215061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_016929	T	6	6	215107	215112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_016929	AAGA	2	8	215198	215205	75 %	0 %	25 %	0 %	379022581
5549	NC_016929	GAA	2	6	215339	215344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022581
5550	NC_016929	AAAT	2	8	215352	215359	75 %	25 %	0 %	0 %	379022581
5551	NC_016929	TAA	2	6	215389	215394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022581
5552	NC_016929	AGC	2	6	215413	215418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022581
5553	NC_016929	CA	3	6	215419	215424	50 %	0 %	0 %	50 %	379022581
5554	NC_016929	TAA	2	6	215464	215469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022581
5555	NC_016929	ATA	2	6	215523	215528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022581
5556	NC_016929	CTA	2	6	215601	215606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022581
5557	NC_016929	CAG	2	6	215709	215714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022581
5558	NC_016929	ACT	2	6	215723	215728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022581
5559	NC_016929	ATTGC	2	10	215756	215765	20 %	40 %	20 %	20 %	379022581
5560	NC_016929	AGA	2	6	215779	215784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022581
5561	NC_016929	A	6	6	215792	215797	100 %	0 %	0 %	0 %	379022581
5562	NC_016929	T	6	6	215825	215830	0 %	100 %	0 %	0 %	379022581
5563	NC_016929	TA	3	6	215901	215906	50 %	50 %	0 %	0 %	379022581
5564	NC_016929	ATT	2	6	215910	215915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022581
5565	NC_016929	TGT	2	6	215962	215967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022581
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5567	NC_016929	CGG	2	6	216091	216096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379022581
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5570	NC_016929	GAT	2	6	216214	216219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022581
5571	NC_016929	TA	3	6	216221	216226	50 %	50 %	0 %	0 %	379022581
5572	NC_016929	ATC	2	6	216240	216245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022581
5573	NC_016929	AAG	2	6	216261	216266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022581
5574	NC_016929	AGC	2	6	216291	216296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022581
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5576	NC_016929	TAC	2	6	216398	216403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5578	NC_016929	TTA	2	6	216471	216476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_016929	ATA	2	6	216486	216491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_016929	TCG	2	6	216506	216511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022582
5581	NC_016929	ATT	2	6	216537	216542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022582
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5583	NC_016929	CAAA	2	8	216607	216614	75 %	0 %	0 %	25 %	379022582
5584	NC_016929	TTAA	2	8	216648	216655	50 %	50 %	0 %	0 %	379022582
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5587	NC_016929	AT	3	6	216762	216767	50 %	50 %	0 %	0 %	379022582
5588	NC_016929	CTG	2	6	216787	216792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022582
5589	NC_016929	A	6	6	216812	216817	100 %	0 %	0 %	0 %	379022582
5590	NC_016929	TTGTT	2	10	216890	216899	0 %	80 %	20 %	0 %	379022582
5591	NC_016929	GCAT	2	8	216909	216916	25 %	25 %	25 %	25 %	379022583
5592	NC_016929	ATGAA	2	10	216921	216930	60 %	20 %	20 %	0 %	379022583
5593	NC_016929	GAT	2	6	217028	217033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022583
5594	NC_016929	ATT	2	6	217068	217073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022583
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5596	NC_016929	TAC	2	6	217087	217092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022583
5597	NC_016929	A	6	6	217113	217118	100 %	0 %	0 %	0 %	379022583
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5599	NC_016929	TGC	2	6	217147	217152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022583
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5603	NC_016929	ATA	2	6	217307	217312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022583
5604	NC_016929	AAAT	2	8	217314	217321	75 %	25 %	0 %	0 %	379022583
5605	NC_016929	TAAA	2	8	217369	217376	75 %	25 %	0 %	0 %	379022583
5606	NC_016929	TAAG	2	8	217402	217409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_016929	TAT	2	6	217457	217462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022584
5608	NC_016929	TA	3	6	217469	217474	50 %	50 %	0 %	0 %	379022584
5609	NC_016929	TTC	2	6	217557	217562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022584
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5611	NC_016929	T	6	6	217637	217642	0 %	100 %	0 %	0 %	379022584
5612	NC_016929	TAC	2	6	217646	217651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022584
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5615	NC_016929	T	7	7	217769	217775	0 %	100 %	0 %	0 %	379022584
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5620	NC_016929	TTG	2	6	218041	218046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022584
5621	NC_016929	CTTA	2	8	218090	218097	25 %	50 %	0 %	25 %	379022584
5622	NC_016929	TA	3	6	218096	218101	50 %	50 %	0 %	0 %	379022584
5623	NC_016929	A	7	7	218136	218142	100 %	0 %	0 %	0 %	379022584
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