MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016915	GAG	2	6	158914	158919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016915	ATA	2	6	158993	158998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016915	AAT	2	6	159065	159070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016915	ATA	2	6	159090	159095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018659
4005	NC_016915	TAA	2	6	159109	159114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018659
4006	NC_016915	CTTTTG	2	12	159138	159149	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379018659
4007	NC_016915	TTA	2	6	159168	159173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018659
4008	NC_016915	TTA	2	6	159180	159185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018659
4009	NC_016915	TA	3	6	159242	159247	50 %	50 %	0 %	0 %	379018659
4010	NC_016915	ATT	2	6	159279	159284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018659
4011	NC_016915	T	7	7	159292	159298	0 %	100 %	0 %	0 %	379018659
4012	NC_016915	AT	3	6	159394	159399	50 %	50 %	0 %	0 %	379018659
4013	NC_016915	ATTG	2	8	159436	159443	25 %	50 %	25 %	0 %	379018659
4014	NC_016915	ATG	2	6	159444	159449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018659
4015	NC_016915	AT	4	8	159452	159459	50 %	50 %	0 %	0 %	379018659
4016	NC_016915	A	7	7	159467	159473	100 %	0 %	0 %	0 %	379018659
4017	NC_016915	TA	3	6	159497	159502	50 %	50 %	0 %	0 %	379018659
4018	NC_016915	TA	4	8	159595	159602	50 %	50 %	0 %	0 %	379018659
4019	NC_016915	T	6	6	159627	159632	0 %	100 %	0 %	0 %	379018659
4020	NC_016915	ATA	2	6	159666	159671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018659
4021	NC_016915	TAG	2	6	159688	159693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018659
4022	NC_016915	ATTT	2	8	159742	159749	25 %	75 %	0 %	0 %	379018659
4023	NC_016915	CAA	2	6	159756	159761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018659
4024	NC_016915	TGG	2	6	159770	159775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018659
4025	NC_016915	TTA	2	6	159792	159797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018659
4026	NC_016915	GAT	2	6	159991	159996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018660
4027	NC_016915	TTTA	2	8	160059	160066	25 %	75 %	0 %	0 %	379018660
4028	NC_016915	ACTT	2	8	160155	160162	25 %	50 %	0 %	25 %	379018660
4029	NC_016915	A	6	6	160164	160169	100 %	0 %	0 %	0 %	379018660
4030	NC_016915	TA	3	6	160171	160176	50 %	50 %	0 %	0 %	379018660
4031	NC_016915	GAA	2	6	160192	160197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018660
4032	NC_016915	GGCG	2	8	160204	160211	0 %	0 %	75 %	25 %	379018660
4033	NC_016915	TAA	2	6	160221	160226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018660
4034	NC_016915	TA	3	6	160260	160265	50 %	50 %	0 %	0 %	379018660
4035	NC_016915	AAC	2	6	160284	160289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018660
4036	NC_016915	ATC	2	6	160391	160396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018660
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4038	NC_016915	AT	3	6	160405	160410	50 %	50 %	0 %	0 %	379018660
4039	NC_016915	GTAAAA	2	12	160462	160473	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379018660
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4041	NC_016915	AAG	2	6	160508	160513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018660
4042	NC_016915	GCA	2	6	160525	160530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018660
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4044	NC_016915	GCC	2	6	160622	160627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018661
4045	NC_016915	GAAGT	2	10	160676	160685	40 %	20 %	40 %	0 %	379018661
4046	NC_016915	TTA	2	6	160757	160762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018661
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4051	NC_016915	ATT	2	6	160967	160972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018661
4052	NC_016915	TGA	2	6	160990	160995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018661
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4054	NC_016915	ATT	2	6	161036	161041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018661
4055	NC_016915	T	6	6	161101	161106	0 %	100 %	0 %	0 %	379018661
4056	NC_016915	GCTT	2	8	161127	161134	0 %	50 %	25 %	25 %	379018661
4057	NC_016915	AT	3	6	161182	161187	50 %	50 %	0 %	0 %	379018661
4058	NC_016915	GAC	2	6	161228	161233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018661
4059	NC_016915	GCA	2	6	161261	161266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018661
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4062	NC_016915	TAG	2	6	161385	161390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018661
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4066	NC_016915	AAT	2	6	161540	161545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018661
4067	NC_016915	TTG	2	6	161603	161608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016915	ATA	2	6	161659	161664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016915	AAT	2	6	161686	161691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016915	ATA	2	6	161696	161701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018662
4071	NC_016915	AGT	2	6	161740	161745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018662
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4073	NC_016915	ATGCA	2	10	161808	161817	40 %	20 %	20 %	20 %	379018662
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4082	NC_016915	AGCA	2	8	162295	162302	50 %	0 %	25 %	25 %	379018663
4083	NC_016915	GTA	2	6	162304	162309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018663
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4105	NC_016915	GAA	2	6	163041	163046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016915	TGT	2	6	163148	163153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016915	TAAA	2	8	163160	163167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016915	AT	3	6	163227	163232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016915	T	7	7	163235	163241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016915	AT	3	6	163248	163253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016915	CAATAT	2	12	163339	163350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4112	NC_016915	TTA	2	6	163429	163434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016915	AT	4	8	163439	163446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016915	TAA	2	6	163494	163499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018665
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4120	NC_016915	AT	3	6	163650	163655	50 %	50 %	0 %	0 %	379018665
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4123	NC_016915	TA	3	6	163717	163722	50 %	50 %	0 %	0 %	379018665
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4125	NC_016915	TTCG	2	8	163768	163775	0 %	50 %	25 %	25 %	379018665
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4498	NC_016915	AAG	2	6	178025	178030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018679
4499	NC_016915	A	7	7	178127	178133	100 %	0 %	0 %	0 %	379018679
4500	NC_016915	ATTA	2	8	178237	178244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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