MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016915	GA	3	6	116631	116636	50 %	0 %	50 %	0 %	379018619
3002	NC_016915	T	6	6	116643	116648	0 %	100 %	0 %	0 %	379018619
3003	NC_016915	AGA	2	6	116660	116665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018619
3004	NC_016915	ATA	2	6	116677	116682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018619
3005	NC_016915	TTC	2	6	116718	116723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018619
3006	NC_016915	TTA	2	6	116836	116841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018619
3007	NC_016915	GAA	2	6	116871	116876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018619
3008	NC_016915	A	7	7	116875	116881	100 %	0 %	0 %	0 %	379018619
3009	NC_016915	GTT	2	6	116983	116988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016915	AAT	2	6	117130	117135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016915	A	6	6	117169	117174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016915	ACTC	2	8	117184	117191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_016915	CAAA	2	8	117206	117213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_016915	CTAT	2	8	117277	117284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_016915	TAA	2	6	117285	117290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016915	T	6	6	117302	117307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016915	TAA	2	6	117314	117319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016915	TTA	3	9	117363	117371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016915	TGC	2	6	117415	117420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018620
3020	NC_016915	TGC	2	6	117430	117435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018620
3021	NC_016915	ATG	2	6	117474	117479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018620
3022	NC_016915	GTA	2	6	117500	117505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018620
3023	NC_016915	TA	3	6	117635	117640	50 %	50 %	0 %	0 %	379018620
3024	NC_016915	A	7	7	117772	117778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016915	GTC	2	6	117851	117856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_016915	CTA	2	6	117913	117918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_016915	GTT	2	6	117927	117932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_016915	TAT	2	6	117971	117976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016915	TAC	2	6	118072	118077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_016915	AGA	2	6	118078	118083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016915	T	6	6	118159	118164	0 %	100 %	0 %	0 %	379018621
3032	NC_016915	AGT	2	6	118293	118298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016915	TAT	2	6	118302	118307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016915	TAA	2	6	118472	118477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018622
3035	NC_016915	ATT	2	6	118518	118523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018622
3036	NC_016915	TTAGT	2	10	118541	118550	20 %	60 %	20 %	0 %	379018622
3037	NC_016915	GCT	2	6	118582	118587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018622
3038	NC_016915	ATA	2	6	118645	118650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018622
3039	NC_016915	TGC	2	6	118665	118670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018622
3040	NC_016915	CCG	2	6	118705	118710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018622
3041	NC_016915	A	7	7	118733	118739	100 %	0 %	0 %	0 %	379018622
3042	NC_016915	TA	3	6	118767	118772	50 %	50 %	0 %	0 %	379018622
3043	NC_016915	ATC	2	6	118776	118781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018622
3044	NC_016915	TAGCGG	2	12	118811	118822	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379018622
3045	NC_016915	ATA	2	6	118888	118893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018622
3046	NC_016915	CTT	2	6	119021	119026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018622
3047	NC_016915	A	6	6	119163	119168	100 %	0 %	0 %	0 %	379018622
3048	NC_016915	TAG	2	6	119223	119228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018622
3049	NC_016915	ATA	2	6	119335	119340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018622
3050	NC_016915	TATC	2	8	119342	119349	25 %	50 %	0 %	25 %	379018622
3051	NC_016915	AAG	2	6	119417	119422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018622
3052	NC_016915	AACG	2	8	119432	119439	50 %	0 %	25 %	25 %	379018622
3053	NC_016915	TAT	2	6	119459	119464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018622
3054	NC_016915	TGCT	2	8	119498	119505	0 %	50 %	25 %	25 %	379018622
3055	NC_016915	TTA	2	6	119638	119643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018622
3056	NC_016915	TCT	2	6	119722	119727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018622
3057	NC_016915	TAA	2	6	119736	119741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018622
3058	NC_016915	ATAAA	2	10	119758	119767	80 %	20 %	0 %	0 %	379018622
3059	NC_016915	TAA	2	6	119772	119777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018622
3060	NC_016915	ATA	2	6	119793	119798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018622
3061	NC_016915	TAA	2	6	119799	119804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018622
3062	NC_016915	CAT	2	6	119805	119810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018622
3063	NC_016915	TAT	2	6	119933	119938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018623
3064	NC_016915	TAA	2	6	119992	119997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018623
3065	NC_016915	TA	3	6	120046	120051	50 %	50 %	0 %	0 %	379018623
3066	NC_016915	TAT	2	6	120080	120085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018623
3067	NC_016915	TAG	2	6	120145	120150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018623
3068	NC_016915	CTA	2	6	120154	120159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018623
3069	NC_016915	CTA	2	6	120181	120186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018623
3070	NC_016915	AAGTA	2	10	120364	120373	60 %	20 %	20 %	0 %	379018623
3071	NC_016915	TATT	2	8	120423	120430	25 %	75 %	0 %	0 %	379018623
3072	NC_016915	T	6	6	120432	120437	0 %	100 %	0 %	0 %	379018623
3073	NC_016915	T	6	6	120443	120448	0 %	100 %	0 %	0 %	379018623
3074	NC_016915	ATT	2	6	120462	120467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018623
3075	NC_016915	T	7	7	120466	120472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_016915	AAGT	2	8	120522	120529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_016915	GCT	2	6	120577	120582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_016915	ATG	2	6	120587	120592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016915	TC	3	6	120638	120643	0 %	50 %	0 %	50 %	379018624
3080	NC_016915	TAC	2	6	120731	120736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018624
3081	NC_016915	CTT	2	6	120748	120753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018624
3082	NC_016915	AAT	2	6	120788	120793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018624
3083	NC_016915	T	7	7	120918	120924	0 %	100 %	0 %	0 %	379018624
3084	NC_016915	TA	3	6	120947	120952	50 %	50 %	0 %	0 %	379018624
3085	NC_016915	AGC	2	6	120980	120985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018624
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3088	NC_016915	ATC	2	6	121178	121183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018624
3089	NC_016915	ATC	2	6	121205	121210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018624
3090	NC_016915	TTC	2	6	121265	121270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018624
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3092	NC_016915	AAT	2	6	121460	121465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018624
3093	NC_016915	TA	4	8	121504	121511	50 %	50 %	0 %	0 %	379018624
3094	NC_016915	CCG	2	6	121521	121526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018624
3095	NC_016915	TAT	2	6	121535	121540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018624
3096	NC_016915	TCA	2	6	121542	121547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018624
3097	NC_016915	TAT	2	6	121561	121566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018624
3098	NC_016915	TTGC	2	8	121591	121598	0 %	50 %	25 %	25 %	379018624
3099	NC_016915	CGC	2	6	121661	121666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018624
3100	NC_016915	ATA	2	6	121719	121724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018624
3101	NC_016915	T	6	6	121736	121741	0 %	100 %	0 %	0 %	379018624
3102	NC_016915	T	7	7	121753	121759	0 %	100 %	0 %	0 %	379018624
3103	NC_016915	AAT	2	6	121808	121813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018624
3104	NC_016915	TA	3	6	121852	121857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016915	AT	3	6	121883	121888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_016915	ATA	2	6	121930	121935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_016915	CTT	2	6	121978	121983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_016915	T	6	6	121989	121994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016915	T	7	7	122018	122024	0 %	100 %	0 %	0 %	379018625
3110	NC_016915	T	6	6	122034	122039	0 %	100 %	0 %	0 %	379018625
3111	NC_016915	TCC	2	6	122053	122058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018625
3112	NC_016915	CTCAAT	2	12	122076	122087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018625
3113	NC_016915	T	7	7	122137	122143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016915	ATTCG	2	10	122144	122153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3115	NC_016915	AGATT	2	10	122162	122171	40 %	40 %	20 %	0 %	379018626
3116	NC_016915	TTC	3	9	122203	122211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018626
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3118	NC_016915	TTCT	2	8	122237	122244	0 %	75 %	0 %	25 %	379018626
3119	NC_016915	TAA	2	6	122247	122252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018626
3120	NC_016915	T	6	6	122300	122305	0 %	100 %	0 %	0 %	379018626
3121	NC_016915	CTAC	2	8	122338	122345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_016915	TAA	2	6	122351	122356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016915	AATT	2	8	122380	122387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016915	ATT	3	9	122398	122406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016915	TAT	2	6	122435	122440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_016915	ATT	2	6	122502	122507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018627
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