MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016915	ATG	2	6	58154	58159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018562
1502	NC_016915	ATTT	3	12	58240	58251	25 %	75 %	0 %	0 %	379018562
1503	NC_016915	ATT	2	6	58301	58306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018562
1504	NC_016915	ATA	2	6	58310	58315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018562
1505	NC_016915	ATA	2	6	58386	58391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018562
1506	NC_016915	AT	3	6	58473	58478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016915	ATTAT	2	10	58503	58512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016915	ATCA	2	8	58515	58522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_016915	AACG	2	8	58615	58622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_016915	TAA	2	6	58627	58632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016915	CT	3	6	58655	58660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_016915	TAT	2	6	58728	58733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018563
1513	NC_016915	A	8	8	58766	58773	100 %	0 %	0 %	0 %	379018563
1514	NC_016915	TAA	2	6	58870	58875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018563
1515	NC_016915	TAT	2	6	58876	58881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018563
1516	NC_016915	CTA	2	6	58927	58932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018563
1517	NC_016915	AAG	2	6	58944	58949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018563
1518	NC_016915	A	7	7	58957	58963	100 %	0 %	0 %	0 %	379018563
1519	NC_016915	GTTA	2	8	58986	58993	25 %	50 %	25 %	0 %	379018564
1520	NC_016915	TTA	2	6	59001	59006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018564
1521	NC_016915	TAA	2	6	59031	59036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018564
1522	NC_016915	AGC	2	6	59048	59053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018564
1523	NC_016915	A	7	7	59059	59065	100 %	0 %	0 %	0 %	379018564
1524	NC_016915	CT	4	8	59115	59122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_016915	T	6	6	59152	59157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016915	T	7	7	59159	59165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016915	TCA	2	6	59195	59200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_016915	TTAA	2	8	59216	59223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016915	AAT	2	6	59233	59238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016915	TTA	2	6	59260	59265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016915	ATA	2	6	59304	59309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016915	T	6	6	59311	59316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016915	ATA	2	6	59321	59326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016915	TTG	2	6	59373	59378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016915	TA	3	6	59387	59392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016915	TAT	2	6	59418	59423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018565
1537	NC_016915	TGA	2	6	59463	59468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018565
1538	NC_016915	ATT	2	6	59479	59484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018565
1539	NC_016915	ATA	2	6	59489	59494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018565
1540	NC_016915	A	7	7	59508	59514	100 %	0 %	0 %	0 %	379018565
1541	NC_016915	TAA	2	6	59553	59558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018565
1542	NC_016915	A	6	6	59560	59565	100 %	0 %	0 %	0 %	379018565
1543	NC_016915	ATT	3	9	59570	59578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018565
1544	NC_016915	T	6	6	59577	59582	0 %	100 %	0 %	0 %	379018565
1545	NC_016915	AGA	2	6	59610	59615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018565
1546	NC_016915	AGAA	2	8	59619	59626	75 %	0 %	25 %	0 %	379018565
1547	NC_016915	TAG	2	6	59682	59687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018565
1548	NC_016915	A	6	6	59706	59711	100 %	0 %	0 %	0 %	379018565
1549	NC_016915	TAA	2	6	59751	59756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018565
1550	NC_016915	TAA	2	6	59796	59801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018566
1551	NC_016915	GCT	2	6	59815	59820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018566
1552	NC_016915	A	6	6	59845	59850	100 %	0 %	0 %	0 %	379018566
1553	NC_016915	T	6	6	59854	59859	0 %	100 %	0 %	0 %	379018566
1554	NC_016915	AGA	2	6	59860	59865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018566
1555	NC_016915	TAA	2	6	59930	59935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018566
1556	NC_016915	AAAG	2	8	59999	60006	75 %	0 %	25 %	0 %	379018566
1557	NC_016915	AAT	2	6	60010	60015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018566
1558	NC_016915	TTA	2	6	60043	60048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018566
1559	NC_016915	TAAA	2	8	60066	60073	75 %	25 %	0 %	0 %	379018566
1560	NC_016915	ATA	2	6	60077	60082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016915	TAA	2	6	60097	60102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018567
1562	NC_016915	TAA	2	6	60209	60214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018567
1563	NC_016915	AGA	2	6	60269	60274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018567
1564	NC_016915	A	6	6	60280	60285	100 %	0 %	0 %	0 %	379018567
1565	NC_016915	TTA	2	6	60295	60300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018567
1566	NC_016915	CAA	2	6	60306	60311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018567
1567	NC_016915	TCGGT	2	10	60352	60361	0 %	40 %	40 %	20 %	379018567
1568	NC_016915	TAA	2	6	60365	60370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018567
1569	NC_016915	AT	3	6	60397	60402	50 %	50 %	0 %	0 %	379018567
1570	NC_016915	TTG	2	6	60514	60519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018567
1571	NC_016915	ATCAGA	2	12	60524	60535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379018567
1572	NC_016915	ATT	2	6	60544	60549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018567
1573	NC_016915	AGA	2	6	60575	60580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018567
1574	NC_016915	T	8	8	60601	60608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016915	ATC	2	6	60609	60614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016915	T	6	6	60626	60631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016915	TTG	2	6	60655	60660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016915	T	6	6	60765	60770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016915	CAA	2	6	60810	60815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_016915	TAC	2	6	60840	60845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_016915	ACAA	2	8	60875	60882	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_016915	AAT	2	6	60931	60936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018568
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1586	NC_016915	ATT	2	6	61047	61052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018568
1587	NC_016915	AAT	2	6	61168	61173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018568
1588	NC_016915	AAGA	2	8	61187	61194	75 %	0 %	25 %	0 %	379018568
1589	NC_016915	TGA	2	6	61217	61222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018568
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1595	NC_016915	TAG	2	6	61409	61414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018568
1596	NC_016915	AGTC	2	8	61422	61429	25 %	25 %	25 %	25 %	379018568
1597	NC_016915	ATA	2	6	61430	61435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018568
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1600	NC_016915	AAT	2	6	61677	61682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018568
1601	NC_016915	CAA	2	6	61687	61692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018568
1602	NC_016915	CAA	2	6	61701	61706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018568
1603	NC_016915	GCTTT	2	10	61778	61787	0 %	60 %	20 %	20 %	379018568
1604	NC_016915	TAAT	2	8	61838	61845	50 %	50 %	0 %	0 %	379018568
1605	NC_016915	T	6	6	61845	61850	0 %	100 %	0 %	0 %	379018568
1606	NC_016915	ATA	2	6	61855	61860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018568
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1609	NC_016915	TA	3	6	61989	61994	50 %	50 %	0 %	0 %	379018568
1610	NC_016915	A	6	6	62008	62013	100 %	0 %	0 %	0 %	379018568
1611	NC_016915	ATA	2	6	62057	62062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018568
1612	NC_016915	A	6	6	62076	62081	100 %	0 %	0 %	0 %	379018568
1613	NC_016915	AAG	2	6	62084	62089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018568
1614	NC_016915	ATA	2	6	62134	62139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018568
1615	NC_016915	ATCT	2	8	62171	62178	25 %	50 %	0 %	25 %	379018568
1616	NC_016915	AT	3	6	62252	62257	50 %	50 %	0 %	0 %	379018568
1617	NC_016915	TAAA	2	8	62362	62369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016915	ATTT	2	8	62383	62390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016915	CT	3	6	62397	62402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_016915	TTA	2	6	62419	62424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016915	AAT	2	6	62440	62445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018569
1622	NC_016915	TGG	2	6	62529	62534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018569
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