MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016915	AGGTTT	2	12	40089	40100	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016915	TTC	2	6	40107	40112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016915	T	6	6	40163	40168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016915	AT	3	6	40172	40177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016915	ATT	2	6	40225	40230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016915	CTT	2	6	40247	40252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_016915	T	6	6	40266	40271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016915	TAA	2	6	40292	40297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016915	CTT	2	6	40309	40314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_016915	AT	3	6	40324	40329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016915	AGT	2	6	40331	40336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016915	AGC	2	6	40427	40432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016915	TTG	2	6	40468	40473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016915	TTG	2	6	40499	40504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016915	TA	3	6	40531	40536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016915	TAA	2	6	40595	40600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016915	AT	3	6	40655	40660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016915	CTT	2	6	40732	40737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_016915	CTGA	2	8	40743	40750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_016915	TAT	2	6	40780	40785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016915	T	6	6	40802	40807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016915	TAATT	2	10	40838	40847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016915	T	6	6	40899	40904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016915	TA	5	10	40909	40918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016915	ATTG	2	8	40921	40928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016915	ATCTTT	2	12	41007	41018	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1027	NC_016915	TAA	2	6	41043	41048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016915	CTTTT	2	10	41049	41058	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_016915	TAAA	2	8	41077	41084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016915	T	6	6	41126	41131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016915	AGA	2	6	41169	41174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016915	ATTT	2	8	41182	41189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016915	T	6	6	41222	41227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016915	TCT	2	6	41265	41270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016915	TAA	2	6	41280	41285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016915	ATTA	2	8	41358	41365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016915	TA	3	6	41371	41376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016915	CTT	2	6	41406	41411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_016915	ATTA	2	8	41413	41420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016915	AT	3	6	41438	41443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016915	TTATT	2	10	41466	41475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016915	ATC	2	6	41500	41505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_016915	TGCT	2	8	41536	41543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_016915	TTTTA	2	10	41570	41579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016915	TCA	2	6	41628	41633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_016915	ATT	2	6	41657	41662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016915	GCTT	2	8	41663	41670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_016915	ACT	2	6	41683	41688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_016915	T	6	6	41804	41809	0 %	100 %	0 %	0 %	379018547
1050	NC_016915	TAG	2	6	41826	41831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018547
1051	NC_016915	T	6	6	41847	41852	0 %	100 %	0 %	0 %	379018547
1052	NC_016915	TAG	2	6	41871	41876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018547
1053	NC_016915	AGC	2	6	41893	41898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018547
1054	NC_016915	T	6	6	41936	41941	0 %	100 %	0 %	0 %	379018547
1055	NC_016915	T	7	7	41982	41988	0 %	100 %	0 %	0 %	379018547
1056	NC_016915	TCT	2	6	42067	42072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_016915	TTA	2	6	42100	42105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016915	AAT	2	6	42114	42119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016915	ATTA	2	8	42144	42151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016915	TCT	2	6	42216	42221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_016915	T	6	6	42221	42226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016915	CAT	2	6	42230	42235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_016915	ATT	2	6	42272	42277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016915	AGTTG	2	10	42318	42327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016915	TTG	3	9	42330	42338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016915	CTA	2	6	42365	42370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_016915	T	6	6	42387	42392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016915	TAT	2	6	42425	42430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016915	TAAT	2	8	42437	42444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016915	GTT	2	6	42455	42460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016915	T	6	6	42459	42464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016915	TAA	2	6	42468	42473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016915	A	6	6	42483	42488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016915	TAA	2	6	42501	42506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016915	ATTA	2	8	42507	42514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016915	GAT	2	6	42568	42573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016915	AT	3	6	42583	42588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016915	TAT	2	6	42604	42609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016915	AAAT	2	8	42610	42617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016915	TAA	2	6	42620	42625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016915	ATA	2	6	42644	42649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018548
1082	NC_016915	TAT	2	6	42663	42668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018548
1083	NC_016915	ATA	2	6	42703	42708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018548
1084	NC_016915	TTC	2	6	42726	42731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018548
1085	NC_016915	AAG	2	6	42815	42820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018548
1086	NC_016915	GAAA	2	8	42821	42828	75 %	0 %	25 %	0 %	379018548
1087	NC_016915	ATTT	2	8	42865	42872	25 %	75 %	0 %	0 %	379018548
1088	NC_016915	TAC	2	6	42876	42881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018548
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1090	NC_016915	TAT	2	6	42924	42929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018548
1091	NC_016915	GAA	2	6	42939	42944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018548
1092	NC_016915	AGT	2	6	42963	42968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018548
1093	NC_016915	TTA	2	6	42971	42976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018548
1094	NC_016915	A	7	7	43011	43017	100 %	0 %	0 %	0 %	379018548
1095	NC_016915	A	6	6	43025	43030	100 %	0 %	0 %	0 %	379018548
1096	NC_016915	GAT	2	6	43033	43038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018548
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1099	NC_016915	ACA	2	6	43149	43154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018548
1100	NC_016915	ATT	2	6	43202	43207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018548
1101	NC_016915	TGA	2	6	43262	43267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018549
1102	NC_016915	TCA	2	6	43278	43283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018549
1103	NC_016915	AAAT	2	8	43336	43343	75 %	25 %	0 %	0 %	379018549
1104	NC_016915	TTA	2	6	43347	43352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018549
1105	NC_016915	TTC	3	9	43385	43393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018549
1106	NC_016915	TCT	2	6	43467	43472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018549
1107	NC_016915	TAT	2	6	43531	43536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018549
1108	NC_016915	GAA	2	6	43549	43554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018549
1109	NC_016915	A	6	6	43553	43558	100 %	0 %	0 %	0 %	379018549
1110	NC_016915	AT	3	6	43589	43594	50 %	50 %	0 %	0 %	379018549
1111	NC_016915	GTT	2	6	43611	43616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018549
1112	NC_016915	T	6	6	43626	43631	0 %	100 %	0 %	0 %	379018549
1113	NC_016915	A	6	6	43637	43642	100 %	0 %	0 %	0 %	379018549
1114	NC_016915	CTT	2	6	43696	43701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018549
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1116	NC_016915	TA	3	6	43829	43834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016915	AT	3	6	43835	43840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016915	ATT	2	6	43855	43860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016915	AAT	2	6	43875	43880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018550
1120	NC_016915	T	6	6	43888	43893	0 %	100 %	0 %	0 %	379018550
1121	NC_016915	TAT	2	6	43911	43916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018550
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1123	NC_016915	T	6	6	44007	44012	0 %	100 %	0 %	0 %	379018550
1124	NC_016915	AT	3	6	44019	44024	50 %	50 %	0 %	0 %	379018550
1125	NC_016915	AT	3	6	44043	44048	50 %	50 %	0 %	0 %	379018550
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1130	NC_016915	GTA	2	6	44296	44301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018550
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1134	NC_016915	CT	3	6	44457	44462	0 %	50 %	0 %	50 %	379018550
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1136	NC_016915	GAT	2	6	44536	44541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018550
1137	NC_016915	ATT	2	6	44584	44589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_016915	AAAC	2	8	44698	44705	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1140	NC_016915	TAAT	2	8	44774	44781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_016915	ATTT	2	8	44801	44808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_016915	ATTA	2	8	44809	44816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_016915	CGT	2	6	44822	44827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1145	NC_016915	TAAGT	2	10	44852	44861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_016915	TAA	2	6	44905	44910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1155	NC_016915	ATT	2	6	45085	45090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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