MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016915	T	6	6	19708	19713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016915	T	6	6	19753	19758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016915	TAC	2	6	19778	19783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016915	TCC	2	6	19787	19792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_016915	AAT	2	6	19903	19908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016915	AGTA	2	8	19914	19921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016915	AT	3	6	19932	19937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016915	AAAC	2	8	19964	19971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_016915	A	6	6	19974	19979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016915	A	7	7	19982	19988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016915	TTG	2	6	19989	19994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016915	AAT	2	6	20029	20034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016915	TAAA	2	8	20039	20046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016915	ATT	2	6	20071	20076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016915	AT	3	6	20217	20222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016915	TTAT	2	8	20237	20244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016915	TTTAA	2	10	20274	20283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016915	AAC	2	6	20315	20320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018527
519	NC_016915	A	7	7	20328	20334	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
520	NC_016915	AAG	2	6	20414	20419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
521	NC_016915	TAA	2	6	20439	20444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
522	NC_016915	TTG	2	6	20446	20451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018527
523	NC_016915	GCA	2	6	20499	20504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018527
524	NC_016915	GTA	2	6	20648	20653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
525	NC_016915	A	6	6	20720	20725	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
526	NC_016915	TAA	2	6	20792	20797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
527	NC_016915	TAC	2	6	20862	20867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
528	NC_016915	TAC	2	6	20889	20894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
529	NC_016915	CAT	2	6	20909	20914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
530	NC_016915	ACC	2	6	20982	20987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018527
531	NC_016915	GCA	2	6	21004	21009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018527
532	NC_016915	CAA	2	6	21040	21045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018527
533	NC_016915	TCC	2	6	21084	21089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018527
534	NC_016915	A	7	7	21117	21123	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
535	NC_016915	GTAA	2	8	21151	21158	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
536	NC_016915	GAT	2	6	21177	21182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
537	NC_016915	A	6	6	21232	21237	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
538	NC_016915	A	6	6	21284	21289	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
539	NC_016915	TCAAG	2	10	21302	21311	40 %	20 %	20 %	20 %	379018527
540	NC_016915	ATAAA	2	10	21356	21365	80 %	20 %	0 %	0 %	379018527
541	NC_016915	AGAT	2	8	21405	21412	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
542	NC_016915	A	6	6	21428	21433	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
543	NC_016915	AGCA	2	8	21524	21531	50 %	0 %	25 %	25 %	379018527
544	NC_016915	TAA	2	6	21561	21566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
545	NC_016915	AAAT	2	8	21567	21574	75 %	25 %	0 %	0 %	379018527
546	NC_016915	AGAAA	2	10	21618	21627	80 %	0 %	20 %	0 %	379018527
547	NC_016915	A	6	6	21625	21630	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
548	NC_016915	AAG	2	6	21632	21637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
549	NC_016915	GCT	2	6	21712	21717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018527
550	NC_016915	AGA	2	6	21726	21731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
551	NC_016915	AATG	2	8	21768	21775	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
552	NC_016915	TTA	2	6	21817	21822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018527
553	NC_016915	TGT	2	6	21828	21833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018527
554	NC_016915	AAAGC	2	10	21874	21883	60 %	0 %	20 %	20 %	379018527
555	NC_016915	AAC	2	6	21926	21931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018527
556	NC_016915	CAG	2	6	21970	21975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018527
557	NC_016915	ATTA	2	8	22069	22076	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
558	NC_016915	GAATA	2	10	22080	22089	60 %	20 %	20 %	0 %	379018527
559	NC_016915	ATAG	2	8	22117	22124	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
560	NC_016915	ATAG	2	8	22129	22136	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
561	NC_016915	TAT	2	6	22358	22363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018527
562	NC_016915	ATC	2	6	22392	22397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
563	NC_016915	GAA	2	6	22405	22410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
564	NC_016915	ACA	2	6	22460	22465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018527
565	NC_016915	TTC	2	6	22488	22493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018527
566	NC_016915	TAA	2	6	22506	22511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
567	NC_016915	ATTTAG	2	12	22526	22537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379018527
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569	NC_016915	TAA	2	6	22601	22606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
570	NC_016915	AAT	2	6	22654	22659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
571	NC_016915	ACA	2	6	22683	22688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018527
572	NC_016915	A	6	6	22700	22705	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
573	NC_016915	GAT	2	6	22732	22737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
574	NC_016915	GAA	2	6	22780	22785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
575	NC_016915	A	6	6	22810	22815	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
576	NC_016915	TAATA	2	10	22821	22830	60 %	40 %	0 %	0 %	379018527
577	NC_016915	AG	3	6	22832	22837	50 %	0 %	50 %	0 %	379018527
578	NC_016915	CA	3	6	22864	22869	50 %	0 %	0 %	50 %	379018527
579	NC_016915	ATT	2	6	22871	22876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018527
580	NC_016915	CAAAG	2	10	22913	22922	60 %	0 %	20 %	20 %	379018527
581	NC_016915	TAGT	2	8	22994	23001	25 %	50 %	25 %	0 %	379018527
582	NC_016915	A	6	6	23010	23015	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
583	NC_016915	AAC	2	6	23067	23072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018527
584	NC_016915	TTAGT	2	10	23096	23105	20 %	60 %	20 %	0 %	379018527
585	NC_016915	TC	3	6	23147	23152	0 %	50 %	0 %	50 %	379018527
586	NC_016915	CAG	2	6	23161	23166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018527
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588	NC_016915	AGCAG	2	10	23239	23248	40 %	0 %	40 %	20 %	379018527
589	NC_016915	ATA	2	6	23261	23266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
590	NC_016915	A	6	6	23349	23354	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
591	NC_016915	TA	3	6	23390	23395	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
592	NC_016915	CAA	2	6	23410	23415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018527
593	NC_016915	TAA	2	6	23441	23446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
594	NC_016915	A	6	6	23491	23496	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
595	NC_016915	CTA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018527
596	NC_016915	TA	3	6	23517	23522	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
597	NC_016915	TGA	2	6	23535	23540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
598	NC_016915	AT	3	6	23560	23565	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
599	NC_016915	ATT	2	6	23631	23636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018527
600	NC_016915	ATTTAG	2	12	23669	23680	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379018527
601	NC_016915	AAGC	2	8	23725	23732	50 %	0 %	25 %	25 %	379018527
602	NC_016915	TGA	2	6	23916	23921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
603	NC_016915	GTG	2	6	23939	23944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018527
604	NC_016915	A	6	6	24032	24037	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
605	NC_016915	TAA	2	6	24051	24056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
606	NC_016915	TAAA	2	8	24077	24084	75 %	25 %	0 %	0 %	379018527
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609	NC_016915	TGT	2	6	24216	24221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018527
610	NC_016915	TAA	2	6	24252	24257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
611	NC_016915	TA	3	6	24274	24279	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
612	NC_016915	A	6	6	24302	24307	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
613	NC_016915	AGA	2	6	24309	24314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
614	NC_016915	AAG	2	6	24359	24364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
615	NC_016915	TA	3	6	24373	24378	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
616	NC_016915	A	6	6	24413	24418	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
617	NC_016915	TAA	2	6	24428	24433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018527
618	NC_016915	ATG	2	6	24452	24457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018527
619	NC_016915	A	6	6	24458	24463	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
620	NC_016915	TTC	2	6	24465	24470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018527
621	NC_016915	GAA	2	6	24481	24486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
622	NC_016915	TACCT	2	10	24552	24561	20 %	40 %	0 %	40 %	379018527
623	NC_016915	GAA	2	6	24571	24576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
624	NC_016915	AAG	2	6	24578	24583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
625	NC_016915	AAGT	2	8	24590	24597	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
626	NC_016915	GCATTA	2	12	24643	24654	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379018527
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628	NC_016915	GAA	3	9	24736	24744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018527
629	NC_016915	TCCGAT	2	12	24760	24771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379018527
630	NC_016915	A	7	7	24828	24834	100 %	0 %	0 %	0 %	379018527
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632	NC_016915	GTT	2	6	24886	24891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018527
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