MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016915	AGT	2	6	218818	218823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018711
5502	NC_016915	GTC	2	6	218840	218845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018711
5503	NC_016915	TAA	2	6	218846	218851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018711
5504	NC_016915	AT	4	8	218855	218862	50 %	50 %	0 %	0 %	379018711
5505	NC_016915	CTT	2	6	218893	218898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018711
5506	NC_016915	TTTA	2	8	218906	218913	25 %	75 %	0 %	0 %	379018711
5507	NC_016915	CAGT	2	8	218968	218975	25 %	25 %	25 %	25 %	379018711
5508	NC_016915	ATC	2	6	219041	219046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018711
5509	NC_016915	TA	3	6	219071	219076	50 %	50 %	0 %	0 %	379018711
5510	NC_016915	TGTA	2	8	219112	219119	25 %	50 %	25 %	0 %	379018711
5511	NC_016915	T	6	6	219163	219168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_016915	A	6	6	219171	219176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016915	GTCAA	2	10	219178	219187	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5514	NC_016915	TAT	2	6	219197	219202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_016915	TAAA	2	8	219203	219210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_016915	AATTA	2	10	219268	219277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_016915	ATT	2	6	219297	219302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018712
5518	NC_016915	TAA	2	6	219324	219329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018712
5519	NC_016915	ACTT	2	8	219337	219344	25 %	50 %	0 %	25 %	379018712
5520	NC_016915	AAAAGC	2	12	219357	219368	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379018712
5521	NC_016915	T	6	6	219406	219411	0 %	100 %	0 %	0 %	379018712
5522	NC_016915	AGTA	2	8	219417	219424	50 %	25 %	25 %	0 %	379018712
5523	NC_016915	GTTT	2	8	219425	219432	0 %	75 %	25 %	0 %	379018712
5524	NC_016915	TAG	2	6	219438	219443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018712
5525	NC_016915	TAA	2	6	219464	219469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018712
5526	NC_016915	AT	3	6	219654	219659	50 %	50 %	0 %	0 %	379018712
5527	NC_016915	ATA	2	6	219679	219684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018712
5528	NC_016915	TGG	2	6	219750	219755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018712
5529	NC_016915	TAG	2	6	219764	219769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018712
5530	NC_016915	AAAT	2	8	219825	219832	75 %	25 %	0 %	0 %	379018712
5531	NC_016915	TTC	2	6	219851	219856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018712
5532	NC_016915	TAT	2	6	219870	219875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018712
5533	NC_016915	CAG	2	6	219877	219882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018712
5534	NC_016915	AG	4	8	219945	219952	50 %	0 %	50 %	0 %	379018712
5535	NC_016915	AGC	2	6	219975	219980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018712
5536	NC_016915	AAGT	2	8	219999	220006	50 %	25 %	25 %	0 %	379018712
5537	NC_016915	AAAT	2	8	220079	220086	75 %	25 %	0 %	0 %	379018712
5538	NC_016915	GAA	2	6	220096	220101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018712
5539	NC_016915	GAA	2	6	220129	220134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018712
5540	NC_016915	AAG	2	6	220136	220141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018712
5541	NC_016915	TAA	2	6	220164	220169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018712
5542	NC_016915	GGA	2	6	220207	220212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018712
5543	NC_016915	TA	3	6	220213	220218	50 %	50 %	0 %	0 %	379018712
5544	NC_016915	TTTA	3	12	220288	220299	25 %	75 %	0 %	0 %	379018713
5545	NC_016915	T	7	7	220337	220343	0 %	100 %	0 %	0 %	379018713
5546	NC_016915	AT	3	6	220506	220511	50 %	50 %	0 %	0 %	379018713
5547	NC_016915	CAT	2	6	220514	220519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018713
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5549	NC_016915	AAT	2	6	220614	220619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018713
5550	NC_016915	GT	3	6	220714	220719	0 %	50 %	50 %	0 %	379018713
5551	NC_016915	AAGGC	2	10	220722	220731	40 %	0 %	40 %	20 %	379018713
5552	NC_016915	TGC	2	6	220758	220763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018714
5553	NC_016915	TTTCTT	2	12	220807	220818	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379018714
5554	NC_016915	TTTTCT	2	12	220827	220838	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379018714
5555	NC_016915	AT	3	6	220840	220845	50 %	50 %	0 %	0 %	379018714
5556	NC_016915	TCA	2	6	220903	220908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018714
5557	NC_016915	TGC	2	6	220939	220944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018714
5558	NC_016915	TAT	2	6	220996	221001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018714
5559	NC_016915	T	6	6	221003	221008	0 %	100 %	0 %	0 %	379018714
5560	NC_016915	AT	3	6	221026	221031	50 %	50 %	0 %	0 %	379018715
5561	NC_016915	ATC	2	6	221097	221102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018715
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5589	NC_016915	TTG	2	6	222123	222128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5591	NC_016915	TAT	2	6	222198	222203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_016915	CAA	2	6	222269	222274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_016915	AAT	2	6	222286	222291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_016915	CTA	2	6	222316	222321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_016915	TAT	2	6	222327	222332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_016915	TTA	2	6	222341	222346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018717
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5613	NC_016915	TA	3	6	222860	222865	50 %	50 %	0 %	0 %	379018717
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