MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016915	TAAAA	2	10	198832	198841	80 %	20 %	0 %	0 %	379018691
5002	NC_016915	CTG	2	6	198885	198890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018691
5003	NC_016915	TAGCA	2	10	198943	198952	40 %	20 %	20 %	20 %	379018691
5004	NC_016915	T	6	6	198961	198966	0 %	100 %	0 %	0 %	379018691
5005	NC_016915	TTC	2	6	198988	198993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018691
5006	NC_016915	ATC	2	6	199024	199029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018691
5007	NC_016915	ATT	2	6	199091	199096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018691
5008	NC_016915	T	6	6	199133	199138	0 %	100 %	0 %	0 %	379018691
5009	NC_016915	ATT	2	6	199139	199144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018691
5010	NC_016915	AT	3	6	199199	199204	50 %	50 %	0 %	0 %	379018691
5011	NC_016915	CAG	2	6	199212	199217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018691
5012	NC_016915	TAA	3	9	199336	199344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018691
5013	NC_016915	TTG	2	6	199348	199353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018691
5014	NC_016915	GTT	2	6	199411	199416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016915	TCA	2	6	199433	199438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_016915	T	7	7	199499	199505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016915	ATT	2	6	199506	199511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016915	T	6	6	199510	199515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016915	ATG	2	6	199548	199553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016915	A	6	6	199703	199708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016915	TCT	2	6	199760	199765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018692
5022	NC_016915	TAAAG	2	10	199817	199826	60 %	20 %	20 %	0 %	379018692
5023	NC_016915	ATA	2	6	199833	199838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018692
5024	NC_016915	AG	3	6	199941	199946	50 %	0 %	50 %	0 %	379018692
5025	NC_016915	AAAG	2	8	199953	199960	75 %	0 %	25 %	0 %	379018692
5026	NC_016915	A	6	6	200024	200029	100 %	0 %	0 %	0 %	379018692
5027	NC_016915	AAAG	2	8	200105	200112	75 %	0 %	25 %	0 %	379018692
5028	NC_016915	ATA	2	6	200191	200196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018692
5029	NC_016915	GCT	2	6	200337	200342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018692
5030	NC_016915	TA	3	6	200377	200382	50 %	50 %	0 %	0 %	379018692
5031	NC_016915	T	6	6	200424	200429	0 %	100 %	0 %	0 %	379018692
5032	NC_016915	GGC	2	6	200432	200437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379018692
5033	NC_016915	ATA	2	6	200492	200497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016915	T	6	6	200519	200524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016915	ATTA	2	8	200533	200540	50 %	50 %	0 %	0 %	379018693
5036	NC_016915	ATT	2	6	200659	200664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018693
5037	NC_016915	CCA	2	6	200710	200715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018693
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5039	NC_016915	T	6	6	200787	200792	0 %	100 %	0 %	0 %	379018693
5040	NC_016915	AGCA	2	8	200808	200815	50 %	0 %	25 %	25 %	379018693
5041	NC_016915	CAG	2	6	200819	200824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018693
5042	NC_016915	T	6	6	200841	200846	0 %	100 %	0 %	0 %	379018693
5043	NC_016915	ATC	2	6	200883	200888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018693
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5045	NC_016915	TAT	2	6	201041	201046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018693
5046	NC_016915	TAAT	3	12	201058	201069	50 %	50 %	0 %	0 %	379018693
5047	NC_016915	GAT	2	6	201099	201104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018693
5048	NC_016915	ATC	2	6	201135	201140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018693
5049	NC_016915	ATT	2	6	201144	201149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018693
5050	NC_016915	TGC	2	6	201165	201170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018693
5051	NC_016915	TC	3	6	201198	201203	0 %	50 %	0 %	50 %	379018693
5052	NC_016915	TAA	2	6	201276	201281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016915	AGTA	2	8	201288	201295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016915	TTA	2	6	201379	201384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_016915	ACG	2	6	201386	201391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_016915	ATTG	2	8	201432	201439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016915	T	6	6	201454	201459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016915	TAA	2	6	201469	201474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_016915	A	6	6	201505	201510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016915	GCA	2	6	201522	201527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_016915	A	6	6	201527	201532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016915	ATA	2	6	201571	201576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018694
5063	NC_016915	TATT	2	8	201604	201611	25 %	75 %	0 %	0 %	379018694
5064	NC_016915	AGC	2	6	201650	201655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018694
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5073	NC_016915	CGTT	2	8	201927	201934	0 %	50 %	25 %	25 %	379018694
5074	NC_016915	TGT	2	6	201944	201949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018694
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5077	NC_016915	ATTA	2	8	202084	202091	50 %	50 %	0 %	0 %	379018695
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5089	NC_016915	T	6	6	202546	202551	0 %	100 %	0 %	0 %	379018695
5090	NC_016915	ATA	2	6	202577	202582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018695
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5093	NC_016915	AGG	2	6	202627	202632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018695
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5095	NC_016915	T	8	8	202675	202682	0 %	100 %	0 %	0 %	379018695
5096	NC_016915	AAT	2	6	202735	202740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_016915	TTG	2	6	202787	202792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_016915	GTA	2	6	202828	202833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_016915	CAA	2	6	202917	202922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_016915	GCT	2	6	202931	202936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5102	NC_016915	AAT	2	6	203083	203088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018696
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5105	NC_016915	CATT	2	8	203329	203336	25 %	50 %	0 %	25 %	379018696
5106	NC_016915	TTTA	2	8	203352	203359	25 %	75 %	0 %	0 %	379018696
5107	NC_016915	AAT	2	6	203368	203373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018696
5108	NC_016915	CATT	2	8	203410	203417	25 %	50 %	0 %	25 %	379018696
5109	NC_016915	TGC	2	6	203418	203423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018696
5110	NC_016915	CTA	2	6	203456	203461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018696
5111	NC_016915	CAT	2	6	203471	203476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018696
5112	NC_016915	TCA	2	6	203563	203568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018696
5113	NC_016915	TAA	2	6	203583	203588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018696
5114	NC_016915	CTT	3	9	203621	203629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018696
5115	NC_016915	CGC	2	6	203651	203656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018696
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5117	NC_016915	CAAG	2	8	203705	203712	50 %	0 %	25 %	25 %	379018696
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5120	NC_016915	CGC	2	6	203804	203809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018696
5121	NC_016915	T	6	6	203902	203907	0 %	100 %	0 %	0 %	379018696
5122	NC_016915	GCT	2	6	203917	203922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018696
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5124	NC_016915	TGAT	2	8	204009	204016	25 %	50 %	25 %	0 %	379018696
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5126	NC_016915	ATTT	3	12	204200	204211	25 %	75 %	0 %	0 %	379018696
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5253	NC_016915	TAT	2	6	209323	209328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018703
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5378	NC_016915	CCTTG	2	10	214243	214252	0 %	40 %	20 %	40 %	379018707
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