MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 32309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016915	TTG	2	6	178279	178284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016915	CGT	2	6	178295	178300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_016915	AGC	2	6	178308	178313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_016915	ATA	2	6	178341	178346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_016915	A	6	6	178346	178351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_016915	T	7	7	178368	178374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_016915	TTGT	2	8	178380	178387	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_016915	ATG	2	6	178412	178417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_016915	GCT	2	6	178530	178535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018680
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4511	NC_016915	GCA	2	6	178593	178598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018680
4512	NC_016915	ATG	2	6	178615	178620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018680
4513	NC_016915	TAG	2	6	178679	178684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018680
4514	NC_016915	TAAAA	2	10	178694	178703	80 %	20 %	0 %	0 %	379018680
4515	NC_016915	CTC	2	6	178705	178710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018680
4516	NC_016915	CTT	2	6	178714	178719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018680
4517	NC_016915	CTA	2	6	178762	178767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018680
4518	NC_016915	A	6	6	178767	178772	100 %	0 %	0 %	0 %	379018680
4519	NC_016915	GTA	2	6	178779	178784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018680
4520	NC_016915	GAT	2	6	178800	178805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018680
4521	NC_016915	A	6	6	178847	178852	100 %	0 %	0 %	0 %	379018680
4522	NC_016915	AGC	2	6	178859	178864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018680
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4524	NC_016915	TGC	2	6	178886	178891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018680
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4527	NC_016915	AAGA	2	8	178937	178944	75 %	0 %	25 %	0 %	379018681
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4530	NC_016915	TA	3	6	179013	179018	50 %	50 %	0 %	0 %	379018681
4531	NC_016915	CAT	2	6	179052	179057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018681
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4535	NC_016915	TAG	2	6	179235	179240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018681
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4539	NC_016915	A	6	6	179512	179517	100 %	0 %	0 %	0 %	379018681
4540	NC_016915	TCT	2	6	179597	179602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018681
4541	NC_016915	GTA	2	6	179667	179672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016915	TAA	3	9	179676	179684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016915	A	7	7	179683	179689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_016915	AT	3	6	179722	179727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_016915	TAT	2	6	179735	179740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_016915	ATT	2	6	179827	179832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018682
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4552	NC_016915	TAG	2	6	180083	180088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018682
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4554	NC_016915	TTA	2	6	180172	180177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018682
4555	NC_016915	TAA	2	6	180328	180333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_016915	T	6	6	180336	180341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_016915	ATT	2	6	180349	180354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4559	NC_016915	TTAA	2	8	180396	180403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_016915	GTA	2	6	180420	180425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4562	NC_016915	A	7	7	180438	180444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_016915	A	6	6	180454	180459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_016915	GAA	2	6	180483	180488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018683
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4596	NC_016915	TATTT	2	10	181473	181482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_016915	ATAA	2	8	181550	181557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_016915	TA	3	6	181567	181572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_016915	ATT	2	6	181606	181611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4601	NC_016915	GAGAG	2	10	181652	181661	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4603	NC_016915	A	7	7	181676	181682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_016915	TGA	2	6	181685	181690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4611	NC_016915	TAG	2	6	181873	181878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018684
4612	NC_016915	TTGA	2	8	181893	181900	25 %	50 %	25 %	0 %	379018684
4613	NC_016915	A	7	7	181906	181912	100 %	0 %	0 %	0 %	379018684
4614	NC_016915	GAAA	2	8	181956	181963	75 %	0 %	25 %	0 %	379018684
4615	NC_016915	A	6	6	181961	181966	100 %	0 %	0 %	0 %	379018684
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4752	NC_016915	ATG	2	6	188283	188288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018685
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5000	NC_016915	GCA	2	6	198806	198811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018691

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