MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 3757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016914	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016914	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016914	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	379017171
4	NC_016914	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	379017171
5	NC_016914	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	379017172
6	NC_016914	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	379017172
7	NC_016914	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	379017172
8	NC_016914	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	379017172
9	NC_016914	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	379017172
10	NC_016914	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016914	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	379017174
12	NC_016914	ATTT	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	379017175
13	NC_016914	CTGT	2	8	8116	8123	0 %	50 %	25 %	25 %	379017176
14	NC_016914	CCTC	2	8	9845	9852	0 %	25 %	0 %	75 %	379017178
15	NC_016914	CAAT	2	8	9892	9899	50 %	25 %	0 %	25 %	379017178
16	NC_016914	ATTA	2	8	10889	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016914	ATTA	2	8	11103	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016914	ATCT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016914	TTTA	2	8	11714	11721	25 %	75 %	0 %	0 %	379017181
20	NC_016914	GATT	2	8	12158	12165	25 %	50 %	25 %	0 %	379017182
21	NC_016914	AAAT	2	8	12166	12173	75 %	25 %	0 %	0 %	379017182
22	NC_016914	AATT	2	8	12193	12200	50 %	50 %	0 %	0 %	379017182
23	NC_016914	TTAA	2	8	12374	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016914	ATGA	2	8	13071	13078	50 %	25 %	25 %	0 %	379017183
25	NC_016914	TAAA	2	8	14094	14101	75 %	25 %	0 %	0 %	379017184
26	NC_016914	TAAA	2	8	14253	14260	75 %	25 %	0 %	0 %	379017184
27	NC_016914	TCAT	2	8	14374	14381	25 %	50 %	0 %	25 %	379017184
28	NC_016914	CTTT	2	8	14508	14515	0 %	75 %	0 %	25 %	379017184
29	NC_016914	TTAG	2	8	14750	14757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016914	GCAA	2	8	14849	14856	50 %	0 %	25 %	25 %	379017185
31	NC_016914	TCTT	2	8	14926	14933	0 %	75 %	0 %	25 %	379017185
32	NC_016914	AGTA	2	8	15184	15191	50 %	25 %	25 %	0 %	379017186
33	NC_016914	GCTT	2	8	15710	15717	0 %	50 %	25 %	25 %	379017187
34	NC_016914	AATT	2	8	16059	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	379017187
35	NC_016914	TTGC	2	8	16332	16339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016914	AATA	2	8	16683	16690	75 %	25 %	0 %	0 %	379017188
37	NC_016914	TCTA	2	8	17150	17157	25 %	50 %	0 %	25 %	379017188
38	NC_016914	ACGT	2	8	17573	17580	25 %	25 %	25 %	25 %	379017188
39	NC_016914	CTTG	2	8	17688	17695	0 %	50 %	25 %	25 %	379017188
40	NC_016914	AGTA	2	8	18754	18761	50 %	25 %	25 %	0 %	379017190
41	NC_016914	ATTA	2	8	18779	18786	50 %	50 %	0 %	0 %	379017190
42	NC_016914	AATA	2	8	18823	18830	75 %	25 %	0 %	0 %	379017190
43	NC_016914	CTTT	2	8	18868	18875	0 %	75 %	0 %	25 %	379017190
44	NC_016914	TAAA	2	8	19059	19066	75 %	25 %	0 %	0 %	379017190
45	NC_016914	AGAT	2	8	19247	19254	50 %	25 %	25 %	0 %	379017190
46	NC_016914	TAAA	2	8	19412	19419	75 %	25 %	0 %	0 %	379017191
47	NC_016914	AGTA	2	8	19812	19819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016914	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016914	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016914	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016914	GTAA	2	8	21039	21046	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
52	NC_016914	AGAT	2	8	21293	21300	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
53	NC_016914	AGCA	2	8	21412	21419	50 %	0 %	25 %	25 %	379017193
54	NC_016914	AAAT	2	8	21455	21462	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
55	NC_016914	AATG	2	8	21656	21663	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
56	NC_016914	ATTA	2	8	21957	21964	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
57	NC_016914	ATAG	2	8	22005	22012	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
58	NC_016914	ATAG	2	8	22017	22024	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
59	NC_016914	CGTT	2	8	22435	22442	0 %	50 %	25 %	25 %	379017193
60	NC_016914	TAGT	2	8	22882	22889	25 %	50 %	25 %	0 %	379017193
61	NC_016914	AAGC	2	8	23622	23629	50 %	0 %	25 %	25 %	379017193
62	NC_016914	TAAA	2	8	23947	23954	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
63	NC_016914	AAGT	2	8	24457	24464	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
64	NC_016914	AAGT	2	8	24544	24551	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
65	NC_016914	AAGT	2	8	24631	24638	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
66	NC_016914	TTCA	2	8	25180	25187	25 %	50 %	0 %	25 %	379017193
67	NC_016914	AATA	2	8	25673	25680	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
68	NC_016914	TAAA	2	8	25819	25826	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
69	NC_016914	ACTA	2	8	25955	25962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016914	ATGT	2	8	26618	26625	25 %	50 %	25 %	0 %	379017195
71	NC_016914	TTAT	2	8	26672	26679	25 %	75 %	0 %	0 %	379017195
72	NC_016914	AGCA	2	8	26746	26753	50 %	0 %	25 %	25 %	379017195
73	NC_016914	TAAT	2	8	27547	27554	50 %	50 %	0 %	0 %	379017196
74	NC_016914	AAGA	2	8	27699	27706	75 %	0 %	25 %	0 %	379017196
75	NC_016914	AAAT	2	8	27791	27798	75 %	25 %	0 %	0 %	379017196
76	NC_016914	ATTA	2	8	27819	27826	50 %	50 %	0 %	0 %	379017196
77	NC_016914	TAAA	2	8	28666	28673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016914	AGGA	2	8	28724	28731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016914	TAAA	2	8	28756	28763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016914	GCTA	2	8	28766	28773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016914	TCTA	2	8	29515	29522	25 %	50 %	0 %	25 %	379017200
82	NC_016914	ATTT	2	8	29559	29566	25 %	75 %	0 %	0 %	379017200
83	NC_016914	TGTC	2	8	29623	29630	0 %	50 %	25 %	25 %	379017200
84	NC_016914	TAAT	2	8	30013	30020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016914	ATAC	2	8	30220	30227	50 %	25 %	0 %	25 %	379017202
86	NC_016914	ATAA	2	8	30644	30651	75 %	25 %	0 %	0 %	379017202
87	NC_016914	CACT	2	8	30738	30745	25 %	25 %	0 %	50 %	379017202
88	NC_016914	TATT	2	8	31562	31569	25 %	75 %	0 %	0 %	379017204
89	NC_016914	AATT	2	8	33196	33203	50 %	50 %	0 %	0 %	379017206
90	NC_016914	TACC	2	8	33286	33293	25 %	25 %	0 %	50 %	379017206
91	NC_016914	GTTA	2	8	33668	33675	25 %	50 %	25 %	0 %	379017206
92	NC_016914	AAAC	2	8	35091	35098	75 %	0 %	0 %	25 %	379017208
93	NC_016914	TTAG	2	8	35267	35274	25 %	50 %	25 %	0 %	379017208
94	NC_016914	TTGC	2	8	35562	35569	0 %	50 %	25 %	25 %	379017208
95	NC_016914	TTCC	2	8	35802	35809	0 %	50 %	0 %	50 %	379017208
96	NC_016914	TGTT	2	8	36270	36277	0 %	75 %	25 %	0 %	379017209
97	NC_016914	TTGT	2	8	36876	36883	0 %	75 %	25 %	0 %	379017210
98	NC_016914	TATT	2	8	36955	36962	25 %	75 %	0 %	0 %	379017210
99	NC_016914	GTAA	2	8	36966	36973	50 %	25 %	25 %	0 %	379017210
100	NC_016914	AATG	2	8	37738	37745	50 %	25 %	25 %	0 %	379017212
101	NC_016914	GTTT	2	8	38252	38259	0 %	75 %	25 %	0 %	379017212
102	NC_016914	ATAA	2	8	38747	38754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016914	AACA	2	8	38844	38851	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016914	TAAA	2	8	39946	39953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016914	CTTG	2	8	40788	40795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016914	CTGA	2	8	40796	40803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016914	ATTG	2	8	40974	40981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016914	TAAA	2	8	41130	41137	75 %	25 %	0 %	0 %	379017214
109	NC_016914	ATTT	2	8	41235	41242	25 %	75 %	0 %	0 %	379017214
110	NC_016914	ATTA	2	8	41401	41408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016914	ATTA	2	8	41458	41465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016914	TGCT	3	12	41581	41592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016914	GCTT	2	8	41708	41715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016914	TTTA	2	8	41748	41755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016914	ATTA	2	8	42189	42196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016914	TAAT	2	8	42482	42489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016914	ATTA	2	8	42552	42559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016914	AAAT	2	8	42655	42662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016914	GAAA	2	8	42866	42873	75 %	0 %	25 %	0 %	379017216
120	NC_016914	ATTT	2	8	42910	42917	25 %	75 %	0 %	0 %	379017216
121	NC_016914	ACAA	2	8	43177	43184	75 %	0 %	0 %	25 %	379017216
122	NC_016914	AAAT	2	8	43381	43388	75 %	25 %	0 %	0 %	379017217
123	NC_016914	TACC	2	8	44735	44742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016914	AAAC	2	8	44743	44750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016914	TAAT	2	8	44819	44826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016914	ATTT	2	8	44846	44853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016914	ATTA	2	8	44854	44861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016914	AAAT	2	8	44873	44880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016914	ATGA	2	8	45076	45083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016914	TAAC	2	8	45266	45273	50 %	25 %	0 %	25 %	379017219
131	NC_016914	ATTC	2	8	45695	45702	25 %	50 %	0 %	25 %	379017220
132	NC_016914	ATGT	2	8	46051	46058	25 %	50 %	25 %	0 %	379017221
133	NC_016914	ATTT	2	8	46210	46217	25 %	75 %	0 %	0 %	379017221
134	NC_016914	TTAC	2	8	46289	46296	25 %	50 %	0 %	25 %	379017221
135	NC_016914	ATCA	2	8	46966	46973	50 %	25 %	0 %	25 %	379017222
136	NC_016914	TGCC	2	8	47276	47283	0 %	25 %	25 %	50 %	379017222
137	NC_016914	TATC	2	8	47835	47842	25 %	50 %	0 %	25 %	379017222
138	NC_016914	TTAA	2	8	47858	47865	50 %	50 %	0 %	0 %	379017222
139	NC_016914	AGTA	2	8	48964	48971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016914	ATAC	2	8	49182	49189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016914	TTGC	2	8	49327	49334	0 %	50 %	25 %	25 %	379017224
142	NC_016914	TGTT	2	8	49696	49703	0 %	75 %	25 %	0 %	379017225
143	NC_016914	AAGT	2	8	49733	49740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016914	CTTG	2	8	50200	50207	0 %	50 %	25 %	25 %	379017226
145	NC_016914	ATCT	2	8	50779	50786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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