MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016914	ATT	2	6	159207	159212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017328
4003	NC_016914	T	7	7	159220	159226	0 %	100 %	0 %	0 %	379017328
4004	NC_016914	AT	3	6	159322	159327	50 %	50 %	0 %	0 %	379017328
4005	NC_016914	ATTG	2	8	159364	159371	25 %	50 %	25 %	0 %	379017328
4006	NC_016914	ATG	2	6	159372	159377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017328
4007	NC_016914	AT	4	8	159380	159387	50 %	50 %	0 %	0 %	379017328
4008	NC_016914	A	7	7	159395	159401	100 %	0 %	0 %	0 %	379017328
4009	NC_016914	TA	3	6	159425	159430	50 %	50 %	0 %	0 %	379017328
4010	NC_016914	TA	4	8	159523	159530	50 %	50 %	0 %	0 %	379017328
4011	NC_016914	GATA	2	8	159533	159540	50 %	25 %	25 %	0 %	379017328
4012	NC_016914	T	6	6	159555	159560	0 %	100 %	0 %	0 %	379017328
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4014	NC_016914	TAG	2	6	159616	159621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017328
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4016	NC_016914	CAA	2	6	159684	159689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017328
4017	NC_016914	TGG	2	6	159698	159703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017328
4018	NC_016914	TTA	2	6	159720	159725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017328
4019	NC_016914	GAT	2	6	159919	159924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017329
4020	NC_016914	TTTA	2	8	159987	159994	25 %	75 %	0 %	0 %	379017329
4021	NC_016914	ACTT	2	8	160083	160090	25 %	50 %	0 %	25 %	379017329
4022	NC_016914	A	6	6	160092	160097	100 %	0 %	0 %	0 %	379017329
4023	NC_016914	TA	3	6	160099	160104	50 %	50 %	0 %	0 %	379017329
4024	NC_016914	GAA	2	6	160120	160125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017329
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4032	NC_016914	GTAAAA	2	12	160390	160401	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379017329
4033	NC_016914	AACA	2	8	160409	160416	75 %	0 %	0 %	25 %	379017329
4034	NC_016914	AAG	2	6	160436	160441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017329
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4055	NC_016914	TAG	2	6	161313	161318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017330
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4058	NC_016914	ATTT	2	8	161430	161437	25 %	75 %	0 %	0 %	379017330
4059	NC_016914	AAT	2	6	161468	161473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017330
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4061	NC_016914	ATA	2	6	161587	161592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016914	AAT	2	6	161614	161619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016914	ATA	2	6	161624	161629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017331
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4103	NC_016914	T	8	8	163163	163170	0 %	100 %	0 %	0 %	379017334
4104	NC_016914	AT	3	6	163177	163182	50 %	50 %	0 %	0 %	379017334
4105	NC_016914	CAATAT	2	12	163268	163279	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379017334
4106	NC_016914	TTA	2	6	163358	163363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016914	AT	4	8	163368	163375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016914	TAA	2	6	163423	163428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017335
4109	NC_016914	TTC	2	6	163472	163477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017335
4110	NC_016914	TCT	2	6	163513	163518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017335
4111	NC_016914	CTA	2	6	163522	163527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017335
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4113	NC_016914	TGG	2	6	163568	163573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017335
4114	NC_016914	AT	3	6	163579	163584	50 %	50 %	0 %	0 %	379017335
4115	NC_016914	GCT	2	6	163605	163610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017335
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4118	NC_016914	TA	3	6	163673	163678	50 %	50 %	0 %	0 %	379017335
4119	NC_016914	TTCG	2	8	163697	163704	0 %	50 %	25 %	25 %	379017335
4120	NC_016914	TAA	2	6	163707	163712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017335
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4123	NC_016914	TAA	2	6	163741	163746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017335
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4125	NC_016914	CTA	2	6	163773	163778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017335
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4130	NC_016914	TAA	2	6	163823	163828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017335
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4247	NC_016914	AGTA	2	8	168409	168416	50 %	25 %	25 %	0 %	379017339
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