MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016914	GCC	2	6	138302	138307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017316
3502	NC_016914	TA	3	6	138318	138323	50 %	50 %	0 %	0 %	379017316
3503	NC_016914	TGC	2	6	138482	138487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017316
3504	NC_016914	TCCG	2	8	138488	138495	0 %	25 %	25 %	50 %	379017316
3505	NC_016914	TCTT	2	8	138515	138522	0 %	75 %	0 %	25 %	379017316
3506	NC_016914	ATT	2	6	138580	138585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017316
3507	NC_016914	AT	3	6	138595	138600	50 %	50 %	0 %	0 %	379017316
3508	NC_016914	T	6	6	138641	138646	0 %	100 %	0 %	0 %	379017316
3509	NC_016914	TTTAGT	2	12	138660	138671	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379017316
3510	NC_016914	CCA	2	6	138675	138680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017316
3511	NC_016914	TATT	2	8	138683	138690	25 %	75 %	0 %	0 %	379017316
3512	NC_016914	ATG	2	6	138720	138725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017316
3513	NC_016914	TGC	2	6	138770	138775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017316
3514	NC_016914	CTC	2	6	138835	138840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017316
3515	NC_016914	ATT	2	6	138877	138882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017316
3516	NC_016914	TGG	2	6	138928	138933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017316
3517	NC_016914	AGA	2	6	139025	139030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017316
3518	NC_016914	TAA	2	6	139082	139087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017316
3519	NC_016914	GAT	2	6	139095	139100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017316
3520	NC_016914	AGT	2	6	139283	139288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017316
3521	NC_016914	GTTA	2	8	139358	139365	25 %	50 %	25 %	0 %	379017316
3522	NC_016914	TAG	2	6	139400	139405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017316
3523	NC_016914	AGCT	2	8	139408	139415	25 %	25 %	25 %	25 %	379017316
3524	NC_016914	TGC	2	6	139421	139426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017316
3525	NC_016914	TAA	2	6	139451	139456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017316
3526	NC_016914	GCAA	2	8	139472	139479	50 %	0 %	25 %	25 %	379017316
3527	NC_016914	TGC	2	6	139517	139522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017316
3528	NC_016914	G	6	6	139529	139534	0 %	0 %	100 %	0 %	379017316
3529	NC_016914	AGG	2	6	139553	139558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017316
3530	NC_016914	GGA	2	6	139587	139592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017316
3531	NC_016914	ATA	2	6	139633	139638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017316
3532	NC_016914	TCT	2	6	139677	139682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017316
3533	NC_016914	AGT	2	6	139710	139715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017316
3534	NC_016914	TGT	2	6	139730	139735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017316
3535	NC_016914	CTC	2	6	139738	139743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017316
3536	NC_016914	CAC	2	6	139765	139770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017316
3537	NC_016914	CAC	2	6	139807	139812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017316
3538	NC_016914	ATA	2	6	139834	139839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017316
3539	NC_016914	A	6	6	139851	139856	100 %	0 %	0 %	0 %	379017316
3540	NC_016914	ATA	2	6	139864	139869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017316
3541	NC_016914	TAG	2	6	140056	140061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017316
3542	NC_016914	GGA	3	9	140067	140075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017316
3543	NC_016914	AAG	2	6	140089	140094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017316
3544	NC_016914	GAG	2	6	140095	140100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017316
3545	NC_016914	ACG	2	6	140111	140116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017316
3546	NC_016914	GCG	2	6	140155	140160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017316
3547	NC_016914	A	8	8	140170	140177	100 %	0 %	0 %	0 %	379017316
3548	NC_016914	ATA	2	6	140179	140184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017316
3549	NC_016914	TAT	2	6	140220	140225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017317
3550	NC_016914	TAGC	2	8	140249	140256	25 %	25 %	25 %	25 %	379017317
3551	NC_016914	TA	3	6	140335	140340	50 %	50 %	0 %	0 %	379017317
3552	NC_016914	GTTTT	2	10	140403	140412	0 %	80 %	20 %	0 %	379017317
3553	NC_016914	GTA	3	9	140426	140434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017317
3554	NC_016914	ATA	2	6	140498	140503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017317
3555	NC_016914	A	6	6	140554	140559	100 %	0 %	0 %	0 %	379017317
3556	NC_016914	CCT	3	9	140647	140655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017317
3557	NC_016914	TTAA	2	8	140716	140723	50 %	50 %	0 %	0 %	379017317
3558	NC_016914	TAA	2	6	140763	140768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017317
3559	NC_016914	T	6	6	140773	140778	0 %	100 %	0 %	0 %	379017317
3560	NC_016914	TGC	2	6	140829	140834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017317
3561	NC_016914	T	6	6	140899	140904	0 %	100 %	0 %	0 %	379017317
3562	NC_016914	A	6	6	140945	140950	100 %	0 %	0 %	0 %	379017317
3563	NC_016914	TAA	2	6	140963	140968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017317
3564	NC_016914	TTG	2	6	140978	140983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017317
3565	NC_016914	GTG	2	6	141020	141025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017317
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3567	NC_016914	GAT	2	6	141102	141107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017317
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3569	NC_016914	GATT	2	8	141195	141202	25 %	50 %	25 %	0 %	379017317
3570	NC_016914	TTA	2	6	141213	141218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017317
3571	NC_016914	CTTGG	2	10	141220	141229	0 %	40 %	40 %	20 %	379017317
3572	NC_016914	TAA	2	6	141294	141299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017317
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3574	NC_016914	TTA	2	6	141416	141421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017317
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3579	NC_016914	ATTC	2	8	141537	141544	25 %	50 %	0 %	25 %	379017317
3580	NC_016914	GTAT	2	8	141595	141602	25 %	50 %	25 %	0 %	379017317
3581	NC_016914	TAA	2	6	141650	141655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017317
3582	NC_016914	TATG	2	8	141657	141664	25 %	50 %	25 %	0 %	379017317
3583	NC_016914	TGT	2	6	141873	141878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017317
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3585	NC_016914	ATT	2	6	142015	142020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017317
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3591	NC_016914	TAG	2	6	142223	142228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017318
3592	NC_016914	GCA	2	6	142252	142257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017318
3593	NC_016914	GCT	2	6	142292	142297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017318
3594	NC_016914	AGG	2	6	142323	142328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017318
3595	NC_016914	AAT	2	6	142338	142343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017318
3596	NC_016914	TAATGC	2	12	142359	142370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379017318
3597	NC_016914	TGT	2	6	142394	142399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017318
3598	NC_016914	TAG	2	6	142466	142471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017318
3599	NC_016914	GGTC	2	8	142500	142507	0 %	25 %	50 %	25 %	379017318
3600	NC_016914	TA	3	6	142528	142533	50 %	50 %	0 %	0 %	379017318
3601	NC_016914	AAT	2	6	142621	142626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017318
3602	NC_016914	TC	3	6	142634	142639	0 %	50 %	0 %	50 %	379017318
3603	NC_016914	TAA	2	6	142640	142645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017318
3604	NC_016914	A	6	6	142653	142658	100 %	0 %	0 %	0 %	379017318
3605	NC_016914	AATG	2	8	142660	142667	50 %	25 %	25 %	0 %	379017318
3606	NC_016914	ACT	2	6	142801	142806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017318
3607	NC_016914	TCT	2	6	142960	142965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017318
3608	NC_016914	GAT	2	6	143044	143049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017318
3609	NC_016914	ACA	2	6	143075	143080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017318
3610	NC_016914	ATT	2	6	143088	143093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017318
3611	NC_016914	TCC	2	6	143136	143141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017318
3612	NC_016914	AAAGAT	2	12	143182	143193	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379017318
3613	NC_016914	CGG	2	6	143270	143275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017318
3614	NC_016914	AGG	2	6	143283	143288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017318
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3616	NC_016914	ATGA	2	8	143317	143324	50 %	25 %	25 %	0 %	379017318
3617	NC_016914	TTG	2	6	143375	143380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017318
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3619	NC_016914	TA	3	6	143429	143434	50 %	50 %	0 %	0 %	379017318
3620	NC_016914	TA	4	8	143439	143446	50 %	50 %	0 %	0 %	379017318
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