MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016914	AAT	2	6	117235	117240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016914	A	6	6	117274	117279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016914	ACTC	2	8	117289	117296	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_016914	CAAA	2	8	117311	117318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_016914	CTAT	2	8	117382	117389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_016914	TAA	2	6	117390	117395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016914	T	6	6	117407	117412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_016914	TAA	2	6	117419	117424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016914	TGC	2	6	117520	117525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017289
3010	NC_016914	TGC	2	6	117535	117540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017289
3011	NC_016914	ATG	2	6	117579	117584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017289
3012	NC_016914	TTA	2	6	117600	117605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017289
3013	NC_016914	TA	3	6	117752	117757	50 %	50 %	0 %	0 %	379017289
3014	NC_016914	A	7	7	117889	117895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016914	GTC	2	6	117968	117973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_016914	CTA	2	6	118030	118035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_016914	GTT	2	6	118044	118049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016914	TAT	2	6	118088	118093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016914	TAC	2	6	118189	118194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_016914	AGA	2	6	118195	118200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016914	T	6	6	118276	118281	0 %	100 %	0 %	0 %	379017290
3022	NC_016914	AGT	2	6	118410	118415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016914	TAT	2	6	118419	118424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016914	TAA	2	6	118589	118594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017291
3025	NC_016914	ATT	2	6	118635	118640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017291
3026	NC_016914	TTAGT	2	10	118658	118667	20 %	60 %	20 %	0 %	379017291
3027	NC_016914	GCT	2	6	118699	118704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017291
3028	NC_016914	ATA	2	6	118762	118767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017291
3029	NC_016914	TGC	2	6	118782	118787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017291
3030	NC_016914	CCG	2	6	118822	118827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017291
3031	NC_016914	A	7	7	118850	118856	100 %	0 %	0 %	0 %	379017291
3032	NC_016914	TA	3	6	118884	118889	50 %	50 %	0 %	0 %	379017291
3033	NC_016914	ATC	2	6	118893	118898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017291
3034	NC_016914	TAGCGG	2	12	118928	118939	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379017291
3035	NC_016914	ATA	2	6	119005	119010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017291
3036	NC_016914	CTT	2	6	119138	119143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017291
3037	NC_016914	A	6	6	119280	119285	100 %	0 %	0 %	0 %	379017291
3038	NC_016914	TAG	2	6	119340	119345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017291
3039	NC_016914	ATA	2	6	119452	119457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017291
3040	NC_016914	TATC	2	8	119459	119466	25 %	50 %	0 %	25 %	379017291
3041	NC_016914	AAG	2	6	119534	119539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017291
3042	NC_016914	AACG	2	8	119549	119556	50 %	0 %	25 %	25 %	379017291
3043	NC_016914	TAT	2	6	119576	119581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017291
3044	NC_016914	TGCT	2	8	119615	119622	0 %	50 %	25 %	25 %	379017291
3045	NC_016914	TTA	2	6	119755	119760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017291
3046	NC_016914	TCT	2	6	119839	119844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017291
3047	NC_016914	TAA	2	6	119853	119858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017291
3048	NC_016914	TAA	2	6	119889	119894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017291
3049	NC_016914	ATA	2	6	119910	119915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017291
3050	NC_016914	TAA	2	6	119916	119921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017291
3051	NC_016914	CAT	2	6	119922	119927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017291
3052	NC_016914	TAT	2	6	120050	120055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017292
3053	NC_016914	TAA	2	6	120109	120114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017292
3054	NC_016914	TA	3	6	120163	120168	50 %	50 %	0 %	0 %	379017292
3055	NC_016914	TAT	2	6	120197	120202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017292
3056	NC_016914	TAG	2	6	120262	120267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017292
3057	NC_016914	CTA	2	6	120271	120276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017292
3058	NC_016914	CTA	2	6	120298	120303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017292
3059	NC_016914	AAGTA	2	10	120481	120490	60 %	20 %	20 %	0 %	379017292
3060	NC_016914	TATT	2	8	120540	120547	25 %	75 %	0 %	0 %	379017292
3061	NC_016914	T	6	6	120549	120554	0 %	100 %	0 %	0 %	379017292
3062	NC_016914	T	6	6	120560	120565	0 %	100 %	0 %	0 %	379017292
3063	NC_016914	ATT	2	6	120579	120584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017292
3064	NC_016914	T	7	7	120583	120589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016914	AAGT	2	8	120639	120646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016914	GCT	2	6	120694	120699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_016914	ATG	2	6	120704	120709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_016914	TC	3	6	120755	120760	0 %	50 %	0 %	50 %	379017293
3069	NC_016914	TAC	2	6	120848	120853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017293
3070	NC_016914	CTT	2	6	120865	120870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017293
3071	NC_016914	AAT	2	6	120905	120910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017293
3072	NC_016914	T	7	7	121035	121041	0 %	100 %	0 %	0 %	379017293
3073	NC_016914	TA	3	6	121064	121069	50 %	50 %	0 %	0 %	379017293
3074	NC_016914	AGC	2	6	121097	121102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017293
3075	NC_016914	AAT	2	6	121145	121150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017293
3076	NC_016914	T	6	6	121251	121256	0 %	100 %	0 %	0 %	379017293
3077	NC_016914	ATC	2	6	121295	121300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017293
3078	NC_016914	ATC	2	6	121322	121327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017293
3079	NC_016914	TTC	2	6	121382	121387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017293
3080	NC_016914	TAA	3	9	121426	121434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017293
3081	NC_016914	AAT	2	6	121577	121582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017293
3082	NC_016914	TA	4	8	121621	121628	50 %	50 %	0 %	0 %	379017293
3083	NC_016914	CCG	2	6	121638	121643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017293
3084	NC_016914	TAT	2	6	121652	121657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017293
3085	NC_016914	TCA	2	6	121659	121664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017293
3086	NC_016914	TAT	2	6	121678	121683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017293
3087	NC_016914	TTGC	2	8	121708	121715	0 %	50 %	25 %	25 %	379017293
3088	NC_016914	CGC	2	6	121778	121783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017293
3089	NC_016914	ATA	2	6	121836	121841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017293
3090	NC_016914	T	6	6	121853	121858	0 %	100 %	0 %	0 %	379017293
3091	NC_016914	T	7	7	121870	121876	0 %	100 %	0 %	0 %	379017293
3092	NC_016914	AAT	2	6	121925	121930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017293
3093	NC_016914	TA	3	6	121969	121974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016914	AT	3	6	122000	122005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016914	ATA	2	6	122047	122052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016914	CTT	2	6	122095	122100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_016914	T	6	6	122106	122111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016914	T	7	7	122135	122141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_016914	T	6	6	122151	122156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_016914	TCC	2	6	122170	122175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_016914	CTCAAT	2	12	122193	122204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_016914	T	7	7	122254	122260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_016914	ATTCG	2	10	122261	122270	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3104	NC_016914	AGATT	2	10	122279	122288	40 %	40 %	20 %	0 %	379017294
3105	NC_016914	TTC	3	9	122320	122328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017294
3106	NC_016914	AAT	2	6	122338	122343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017294
3107	NC_016914	TTCT	2	8	122354	122361	0 %	75 %	0 %	25 %	379017294
3108	NC_016914	TAA	2	6	122364	122369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017294
3109	NC_016914	T	6	6	122417	122422	0 %	100 %	0 %	0 %	379017294
3110	NC_016914	CTAC	2	8	122455	122462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_016914	TAA	2	6	122468	122473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_016914	ATT	3	9	122515	122523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016914	TAT	2	6	122552	122557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016914	TAAAA	2	10	122596	122605	80 %	20 %	0 %	0 %	379017295
3115	NC_016914	ATT	2	6	122619	122624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017295
3116	NC_016914	TAA	2	6	122634	122639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017295
3117	NC_016914	TTA	2	6	122652	122657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017295
3118	NC_016914	TA	3	6	122684	122689	50 %	50 %	0 %	0 %	379017295
3119	NC_016914	CT	3	6	122708	122713	0 %	50 %	0 %	50 %	379017295
3120	NC_016914	TA	3	6	122754	122759	50 %	50 %	0 %	0 %	379017295
3121	NC_016914	ATG	2	6	122772	122777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017295
3122	NC_016914	T	6	6	122807	122812	0 %	100 %	0 %	0 %	379017295
3123	NC_016914	T	6	6	122857	122862	0 %	100 %	0 %	0 %	379017295
3124	NC_016914	A	6	6	122863	122868	100 %	0 %	0 %	0 %	379017295
3125	NC_016914	T	6	6	122935	122940	0 %	100 %	0 %	0 %	379017295
3126	NC_016914	CTA	2	6	123018	123023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017295
3127	NC_016914	TAA	2	6	123028	123033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017295
3128	NC_016914	AT	3	6	123263	123268	50 %	50 %	0 %	0 %	379017295
3129	NC_016914	AAAAC	2	10	123292	123301	80 %	0 %	0 %	20 %	379017295
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3131	NC_016914	ATT	2	6	123317	123322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017295
3132	NC_016914	TTTAA	2	10	123368	123377	40 %	60 %	0 %	0 %	379017295
3133	NC_016914	TAA	2	6	123391	123396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017295
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3145	NC_016914	TAT	2	6	123613	123618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017296
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3232	NC_016914	A	7	7	127324	127330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_016914	A	6	6	127333	127338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_016914	TTAAA	2	10	127418	127427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_016914	A	6	6	127431	127436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_016914	TCGG	2	8	127463	127470	0 %	25 %	50 %	25 %	379017302
3237	NC_016914	GTAG	2	8	127499	127506	25 %	25 %	50 %	0 %	379017302
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3244	NC_016914	GTA	3	9	127709	127717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017302
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3248	NC_016914	TAA	2	6	127884	127889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017302
3249	NC_016914	TAT	2	6	127894	127899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017302
3250	NC_016914	CTTGT	2	10	127908	127917	0 %	60 %	20 %	20 %	379017302
3251	NC_016914	TA	3	6	127965	127970	50 %	50 %	0 %	0 %	379017302
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3373	NC_016914	T	7	7	132419	132425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3374	NC_016914	ATT	2	6	132426	132431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3378	NC_016914	ATT	2	6	132526	132531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3379	NC_016914	AGC	2	6	132541	132546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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