MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016914	AATTA	2	10	98419	98428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016914	AAT	2	6	98463	98468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017275
2503	NC_016914	AACT	2	8	98516	98523	50 %	25 %	0 %	25 %	379017275
2504	NC_016914	TGG	2	6	98592	98597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017275
2505	NC_016914	TGC	2	6	98667	98672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017275
2506	NC_016914	GAT	2	6	98752	98757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017275
2507	NC_016914	AG	3	6	98779	98784	50 %	0 %	50 %	0 %	379017275
2508	NC_016914	AATT	2	8	98786	98793	50 %	50 %	0 %	0 %	379017275
2509	NC_016914	GCA	2	6	98833	98838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017275
2510	NC_016914	A	6	6	98902	98907	100 %	0 %	0 %	0 %	379017275
2511	NC_016914	TA	3	6	98999	99004	50 %	50 %	0 %	0 %	379017275
2512	NC_016914	TGA	2	6	99012	99017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017275
2513	NC_016914	ATT	2	6	99031	99036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017275
2514	NC_016914	TATT	2	8	99041	99048	25 %	75 %	0 %	0 %	379017275
2515	NC_016914	TGC	2	6	99075	99080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017275
2516	NC_016914	CGG	2	6	99081	99086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017275
2517	NC_016914	ATG	2	6	99137	99142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017275
2518	NC_016914	ACA	2	6	99147	99152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017275
2519	NC_016914	TAAT	2	8	99178	99185	50 %	50 %	0 %	0 %	379017275
2520	NC_016914	CTT	2	6	99197	99202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017276
2521	NC_016914	A	7	7	99211	99217	100 %	0 %	0 %	0 %	379017276
2522	NC_016914	ATG	2	6	99236	99241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017276
2523	NC_016914	TAT	2	6	99248	99253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017276
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2525	NC_016914	AATA	2	8	99291	99298	75 %	25 %	0 %	0 %	379017276
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2527	NC_016914	TAA	2	6	99357	99362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017276
2528	NC_016914	TA	3	6	99397	99402	50 %	50 %	0 %	0 %	379017276
2529	NC_016914	TAG	2	6	99422	99427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017276
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2531	NC_016914	TGT	2	6	99471	99476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017276
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2533	NC_016914	AC	3	6	99529	99534	50 %	0 %	0 %	50 %	379017276
2534	NC_016914	GAT	2	6	99607	99612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017276
2535	NC_016914	AAT	2	6	99628	99633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017276
2536	NC_016914	ATA	2	6	99647	99652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017276
2537	NC_016914	AGA	3	9	99681	99689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017276
2538	NC_016914	TCAAA	2	10	99707	99716	60 %	20 %	0 %	20 %	379017276
2539	NC_016914	A	6	6	99771	99776	100 %	0 %	0 %	0 %	379017276
2540	NC_016914	TTTC	2	8	99892	99899	0 %	75 %	0 %	25 %	379017276
2541	NC_016914	TA	3	6	99904	99909	50 %	50 %	0 %	0 %	379017276
2542	NC_016914	GGA	2	6	99925	99930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017276
2543	NC_016914	TTA	2	6	99992	99997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017276
2544	NC_016914	AAT	2	6	100001	100006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017276
2545	NC_016914	T	7	7	100138	100144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_016914	TCCA	2	8	100191	100198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_016914	AAT	2	6	100274	100279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_016914	AAGC	2	8	100286	100293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2549	NC_016914	CTA	2	6	100363	100368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017277
2550	NC_016914	TAG	2	6	100477	100482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017277
2551	NC_016914	TTAAT	2	10	100489	100498	40 %	60 %	0 %	0 %	379017277
2552	NC_016914	AT	3	6	100541	100546	50 %	50 %	0 %	0 %	379017277
2553	NC_016914	T	9	9	100595	100603	0 %	100 %	0 %	0 %	379017277
2554	NC_016914	TCA	2	6	100612	100617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017277
2555	NC_016914	TCA	2	6	100620	100625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017277
2556	NC_016914	AAG	2	6	100813	100818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017277
2557	NC_016914	T	6	6	100867	100872	0 %	100 %	0 %	0 %	379017277
2558	NC_016914	T	6	6	100891	100896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_016914	ACT	2	6	100971	100976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017278
2560	NC_016914	TAT	2	6	101005	101010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017278
2561	NC_016914	T	6	6	101028	101033	0 %	100 %	0 %	0 %	379017278
2562	NC_016914	TAA	2	6	101065	101070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017278
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2565	NC_016914	AT	3	6	101338	101343	50 %	50 %	0 %	0 %	379017278
2566	NC_016914	GAT	2	6	101412	101417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017278
2567	NC_016914	AGT	2	6	101424	101429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017278
2568	NC_016914	TCG	2	6	101472	101477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017278
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2570	NC_016914	TA	3	6	101564	101569	50 %	50 %	0 %	0 %	379017278
2571	NC_016914	CTA	2	6	101586	101591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017278
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2573	NC_016914	CTG	2	6	101647	101652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017278
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2577	NC_016914	ATT	2	6	101817	101822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017278
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2579	NC_016914	AT	4	8	101836	101843	50 %	50 %	0 %	0 %	379017278
2580	NC_016914	GCA	2	6	102042	102047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017278
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2588	NC_016914	TAT	2	6	102352	102357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_016914	A	8	8	102398	102405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_016914	A	7	7	102407	102413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_016914	CCTATA	2	12	102486	102497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017279
2592	NC_016914	CTA	2	6	102547	102552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017279
2593	NC_016914	ACCTAT	2	12	102719	102730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017279
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2595	NC_016914	GTTT	2	8	102802	102809	0 %	75 %	25 %	0 %	379017279
2596	NC_016914	T	6	6	102807	102812	0 %	100 %	0 %	0 %	379017279
2597	NC_016914	ATT	2	6	102917	102922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017279
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2599	NC_016914	T	6	6	102960	102965	0 %	100 %	0 %	0 %	379017279
2600	NC_016914	GAG	2	6	102991	102996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017279
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2602	NC_016914	CCT	2	6	103041	103046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017279
2603	NC_016914	AAACT	2	10	103060	103069	60 %	20 %	0 %	20 %	379017279
2604	NC_016914	CAT	3	9	103120	103128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017279
2605	NC_016914	TGG	2	6	103159	103164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017279
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2607	NC_016914	T	6	6	103187	103192	0 %	100 %	0 %	0 %	379017279
2608	NC_016914	TAT	3	9	103245	103253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_016914	TA	3	6	103268	103273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_016914	ATT	2	6	103345	103350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_016914	AATG	2	8	103361	103368	50 %	25 %	25 %	0 %	379017280
2612	NC_016914	GGTT	2	8	103398	103405	0 %	50 %	50 %	0 %	379017280
2613	NC_016914	TTAGT	2	10	103411	103420	20 %	60 %	20 %	0 %	379017280
2614	NC_016914	AGT	3	9	103422	103430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017280
2615	NC_016914	ATG	2	6	103435	103440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017280
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2617	NC_016914	CTT	2	6	103496	103501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017280
2618	NC_016914	TAC	2	6	103519	103524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017280
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2622	NC_016914	AT	3	6	103579	103584	50 %	50 %	0 %	0 %	379017280
2623	NC_016914	TTA	3	9	103593	103601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017280
2624	NC_016914	CTT	2	6	103615	103620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017280
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