MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016914	ATA	2	6	58421	58426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017232
1502	NC_016914	AT	3	6	58508	58513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016914	ATTAT	2	10	58538	58547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016914	AACG	2	8	58646	58653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_016914	TAA	2	6	58658	58663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016914	CT	3	6	58686	58691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_016914	TAT	2	6	58759	58764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017233
1508	NC_016914	A	7	7	58798	58804	100 %	0 %	0 %	0 %	379017233
1509	NC_016914	TAA	2	6	58901	58906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017233
1510	NC_016914	TAT	2	6	58907	58912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017233
1511	NC_016914	CTA	2	6	58958	58963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_016914	AAG	2	6	58975	58980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016914	A	8	8	58988	58995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016914	GTTA	2	8	59018	59025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016914	TTA	2	6	59033	59038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016914	TAA	2	6	59063	59068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016914	AGC	2	6	59080	59085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_016914	A	7	7	59091	59097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016914	TTA	2	6	59129	59134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016914	CT	4	8	59147	59154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_016914	T	6	6	59184	59189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016914	T	7	7	59191	59197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016914	TCA	2	6	59227	59232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_016914	TTAA	2	8	59248	59255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016914	AAT	2	6	59265	59270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016914	TTA	2	6	59292	59297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016914	ATA	2	6	59336	59341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016914	T	6	6	59343	59348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016914	ATA	2	6	59353	59358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016914	TTG	2	6	59406	59411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016914	TA	3	6	59420	59425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016914	TAT	2	6	59451	59456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017234
1533	NC_016914	TGA	2	6	59496	59501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017234
1534	NC_016914	ATT	2	6	59512	59517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017234
1535	NC_016914	ATA	2	6	59522	59527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017234
1536	NC_016914	A	7	7	59541	59547	100 %	0 %	0 %	0 %	379017234
1537	NC_016914	TAA	2	6	59586	59591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017234
1538	NC_016914	A	6	6	59593	59598	100 %	0 %	0 %	0 %	379017234
1539	NC_016914	ATT	3	9	59603	59611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017234
1540	NC_016914	T	6	6	59610	59615	0 %	100 %	0 %	0 %	379017234
1541	NC_016914	AGA	2	6	59643	59648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017234
1542	NC_016914	AGAA	2	8	59652	59659	75 %	0 %	25 %	0 %	379017234
1543	NC_016914	TAG	2	6	59715	59720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017234
1544	NC_016914	A	6	6	59739	59744	100 %	0 %	0 %	0 %	379017234
1545	NC_016914	TAA	2	6	59784	59789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017234
1546	NC_016914	TAA	2	6	59829	59834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017235
1547	NC_016914	GCT	2	6	59848	59853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017235
1548	NC_016914	A	6	6	59878	59883	100 %	0 %	0 %	0 %	379017235
1549	NC_016914	T	6	6	59887	59892	0 %	100 %	0 %	0 %	379017235
1550	NC_016914	AGA	2	6	59893	59898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017235
1551	NC_016914	TAA	2	6	59963	59968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017235
1552	NC_016914	AAAG	2	8	60032	60039	75 %	0 %	25 %	0 %	379017235
1553	NC_016914	AAT	2	6	60043	60048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017235
1554	NC_016914	TTA	2	6	60076	60081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017235
1555	NC_016914	TAAA	2	8	60099	60106	75 %	25 %	0 %	0 %	379017235
1556	NC_016914	ATA	2	6	60110	60115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016914	TAA	2	6	60130	60135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017236
1558	NC_016914	TAA	2	6	60242	60247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017236
1559	NC_016914	AGA	2	6	60302	60307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017236
1560	NC_016914	A	6	6	60313	60318	100 %	0 %	0 %	0 %	379017236
1561	NC_016914	TTA	2	6	60328	60333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017236
1562	NC_016914	CAA	2	6	60339	60344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017236
1563	NC_016914	TCGGT	2	10	60385	60394	0 %	40 %	40 %	20 %	379017236
1564	NC_016914	TAA	2	6	60398	60403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017236
1565	NC_016914	AT	3	6	60430	60435	50 %	50 %	0 %	0 %	379017236
1566	NC_016914	TTG	2	6	60547	60552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017236
1567	NC_016914	ATCAGA	2	12	60557	60568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379017236
1568	NC_016914	ATT	2	6	60577	60582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017236
1569	NC_016914	AGA	2	6	60608	60613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017236
1570	NC_016914	T	8	8	60634	60641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016914	ATC	2	6	60642	60647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_016914	T	6	6	60659	60664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016914	TTG	2	6	60688	60693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016914	T	6	6	60798	60803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016914	CAA	2	6	60843	60848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016914	TAC	2	6	60873	60878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_016914	ACAA	2	8	60908	60915	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_016914	AAT	2	6	60964	60969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017237
1579	NC_016914	TGG	2	6	61014	61019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017237
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1581	NC_016914	ATA	2	6	61070	61075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017237
1582	NC_016914	ATT	2	6	61080	61085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017237
1583	NC_016914	AAT	2	6	61201	61206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017237
1584	NC_016914	AAGA	2	8	61220	61227	75 %	0 %	25 %	0 %	379017237
1585	NC_016914	TGA	2	6	61250	61255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017237
1586	NC_016914	AT	3	6	61277	61282	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
1587	NC_016914	GAT	2	6	61309	61314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017237
1588	NC_016914	TAG	2	6	61368	61373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017237
1589	NC_016914	TAA	2	6	61392	61397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017237
1590	NC_016914	TA	3	6	61418	61423	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
1591	NC_016914	TAG	2	6	61442	61447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017237
1592	NC_016914	AGTC	2	8	61455	61462	25 %	25 %	25 %	25 %	379017237
1593	NC_016914	ATA	2	6	61463	61468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017237
1594	NC_016914	TTA	2	6	61520	61525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017237
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1597	NC_016914	CAA	2	6	61720	61725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017237
1598	NC_016914	CAA	2	6	61734	61739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017237
1599	NC_016914	GCTTT	2	10	61811	61820	0 %	60 %	20 %	20 %	379017237
1600	NC_016914	TAAT	2	8	61871	61878	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
1601	NC_016914	T	6	6	61878	61883	0 %	100 %	0 %	0 %	379017237
1602	NC_016914	ATA	2	6	61888	61893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017237
1603	NC_016914	AGC	2	6	61911	61916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017237
1604	NC_016914	ATTA	2	8	61947	61954	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
1605	NC_016914	TA	3	6	62022	62027	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
1606	NC_016914	A	6	6	62041	62046	100 %	0 %	0 %	0 %	379017237
1607	NC_016914	ATA	2	6	62090	62095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017237
1608	NC_016914	A	6	6	62109	62114	100 %	0 %	0 %	0 %	379017237
1609	NC_016914	AAG	2	6	62117	62122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017237
1610	NC_016914	ATA	2	6	62167	62172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017237
1611	NC_016914	ATCT	2	8	62204	62211	25 %	50 %	0 %	25 %	379017237
1612	NC_016914	AT	3	6	62285	62290	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
1613	NC_016914	TAAA	2	8	62395	62402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016914	ATTT	2	8	62416	62423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016914	CT	3	6	62430	62435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_016914	TTA	2	6	62452	62457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016914	AAT	2	6	62473	62478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017238
1618	NC_016914	TGG	2	6	62562	62567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017238
1619	NC_016914	ATA	2	6	62573	62578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017238
1620	NC_016914	T	6	6	62592	62597	0 %	100 %	0 %	0 %	379017238
1621	NC_016914	TGA	2	6	62607	62612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017238
1622	NC_016914	AGT	2	6	62748	62753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017238
1623	NC_016914	GAAT	2	8	62768	62775	50 %	25 %	25 %	0 %	379017238
1624	NC_016914	T	7	7	62834	62840	0 %	100 %	0 %	0 %	379017238
1625	NC_016914	AGA	2	6	62961	62966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017238
1626	NC_016914	TAG	2	6	62978	62983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017238
1627	NC_016914	T	6	6	62985	62990	0 %	100 %	0 %	0 %	379017238
1628	NC_016914	CAAG	2	8	62999	63006	50 %	0 %	25 %	25 %	379017238
1629	NC_016914	TGG	2	6	63018	63023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017238
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1631	NC_016914	TCC	2	6	63054	63059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017238
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