MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016914	ATC	2	6	218944	218949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017382
5502	NC_016914	TA	3	6	218974	218979	50 %	50 %	0 %	0 %	379017382
5503	NC_016914	T	6	6	219066	219071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_016914	A	6	6	219074	219079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_016914	GTCAA	2	10	219081	219090	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5506	NC_016914	TAT	2	6	219100	219105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016914	TAAA	2	8	219106	219113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_016914	AATTA	2	10	219171	219180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_016914	ATT	2	6	219200	219205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017383
5510	NC_016914	TAA	2	6	219227	219232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017383
5511	NC_016914	AAAAGC	2	12	219260	219271	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379017383
5512	NC_016914	T	6	6	219309	219314	0 %	100 %	0 %	0 %	379017383
5513	NC_016914	AGTA	2	8	219320	219327	50 %	25 %	25 %	0 %	379017383
5514	NC_016914	GTTT	2	8	219328	219335	0 %	75 %	25 %	0 %	379017383
5515	NC_016914	TAG	2	6	219341	219346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017383
5516	NC_016914	TAA	2	6	219367	219372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017383
5517	NC_016914	AT	3	6	219557	219562	50 %	50 %	0 %	0 %	379017383
5518	NC_016914	ATA	2	6	219582	219587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017383
5519	NC_016914	TGG	2	6	219653	219658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017383
5520	NC_016914	TAG	2	6	219667	219672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017383
5521	NC_016914	AAAT	2	8	219728	219735	75 %	25 %	0 %	0 %	379017383
5522	NC_016914	TTC	2	6	219754	219759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017383
5523	NC_016914	TAT	2	6	219773	219778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017383
5524	NC_016914	CAG	2	6	219780	219785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017383
5525	NC_016914	AG	3	6	219850	219855	50 %	0 %	50 %	0 %	379017383
5526	NC_016914	AGC	2	6	219878	219883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017383
5527	NC_016914	AAGT	2	8	219902	219909	50 %	25 %	25 %	0 %	379017383
5528	NC_016914	AAAT	2	8	219982	219989	75 %	25 %	0 %	0 %	379017383
5529	NC_016914	GAA	2	6	219999	220004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017383
5530	NC_016914	GAA	2	6	220032	220037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017383
5531	NC_016914	AAG	2	6	220039	220044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017383
5532	NC_016914	TAA	2	6	220067	220072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017383
5533	NC_016914	GGA	2	6	220110	220115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017383
5534	NC_016914	TA	3	6	220116	220121	50 %	50 %	0 %	0 %	379017383
5535	NC_016914	TTTA	3	12	220191	220202	25 %	75 %	0 %	0 %	379017384
5536	NC_016914	T	7	7	220240	220246	0 %	100 %	0 %	0 %	379017384
5537	NC_016914	AT	3	6	220409	220414	50 %	50 %	0 %	0 %	379017384
5538	NC_016914	CAT	2	6	220417	220422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017384
5539	NC_016914	ATT	2	6	220505	220510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017384
5540	NC_016914	AAT	2	6	220517	220522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017384
5541	NC_016914	GT	3	6	220617	220622	0 %	50 %	50 %	0 %	379017384
5542	NC_016914	AAGGC	2	10	220625	220634	40 %	0 %	40 %	20 %	379017384
5543	NC_016914	TGC	2	6	220661	220666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017385
5544	NC_016914	TTTCTT	2	12	220710	220721	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379017385
5545	NC_016914	TTTTCT	2	12	220730	220741	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379017385
5546	NC_016914	AT	3	6	220743	220748	50 %	50 %	0 %	0 %	379017385
5547	NC_016914	TCA	2	6	220806	220811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017385
5548	NC_016914	TGC	2	6	220842	220847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017385
5549	NC_016914	CT	3	6	220870	220875	0 %	50 %	0 %	50 %	379017385
5550	NC_016914	TAT	2	6	220899	220904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017385
5551	NC_016914	T	6	6	220906	220911	0 %	100 %	0 %	0 %	379017385
5552	NC_016914	AT	3	6	220929	220934	50 %	50 %	0 %	0 %	379017386
5553	NC_016914	ATC	2	6	221000	221005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017386
5554	NC_016914	ATG	2	6	221045	221050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017386
5555	NC_016914	A	6	6	221145	221150	100 %	0 %	0 %	0 %	379017386
5556	NC_016914	TAA	2	6	221189	221194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017386
5557	NC_016914	AATA	2	8	221217	221224	75 %	25 %	0 %	0 %	379017386
5558	NC_016914	ATT	2	6	221251	221256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017386
5559	NC_016914	GGT	2	6	221270	221275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017386
5560	NC_016914	A	6	6	221394	221399	100 %	0 %	0 %	0 %	379017386
5561	NC_016914	AAT	3	9	221401	221409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017386
5562	NC_016914	AGA	2	6	221439	221444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017386
5563	NC_016914	TCA	2	6	221464	221469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017386
5564	NC_016914	TAT	2	6	221493	221498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017386
5565	NC_016914	GGAG	2	8	221508	221515	25 %	0 %	75 %	0 %	379017386
5566	NC_016914	ATG	2	6	221525	221530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017386
5567	NC_016914	CTT	2	6	221539	221544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017386
5568	NC_016914	AT	3	6	221585	221590	50 %	50 %	0 %	0 %	379017386
5569	NC_016914	CAG	2	6	221603	221608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017386
5570	NC_016914	GTT	2	6	221634	221639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017386
5571	NC_016914	GCT	2	6	221729	221734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_016914	TA	3	6	221837	221842	50 %	50 %	0 %	0 %	379017387
5573	NC_016914	AAT	2	6	221855	221860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017387
5574	NC_016914	AAATTA	2	12	221889	221900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017387
5575	NC_016914	AAT	2	6	221901	221906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017387
5576	NC_016914	AGA	2	6	221936	221941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017387
5577	NC_016914	TAA	2	6	221942	221947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017387
5578	NC_016914	AGT	2	6	221954	221959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017387
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5580	NC_016914	TATT	2	8	221980	221987	25 %	75 %	0 %	0 %	379017387
5581	NC_016914	TTG	2	6	222026	222031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_016914	TG	3	6	222030	222035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_016914	TAT	2	6	222101	222106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_016914	CAA	2	6	222172	222177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_016914	AAT	2	6	222189	222194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_016914	CTA	2	6	222219	222224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_016914	TAT	2	6	222230	222235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_016914	TTA	2	6	222244	222249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017388
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5590	NC_016914	AT	3	6	222268	222273	50 %	50 %	0 %	0 %	379017388
5591	NC_016914	TCC	2	6	222316	222321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017388
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5594	NC_016914	AGT	2	6	222409	222414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017388
5595	NC_016914	TAT	2	6	222451	222456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017388
5596	NC_016914	CTT	2	6	222459	222464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017388
5597	NC_016914	CTA	2	6	222504	222509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017388
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5599	NC_016914	TAAT	2	8	222528	222535	50 %	50 %	0 %	0 %	379017388
5600	NC_016914	TAA	2	6	222546	222551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017388
5601	NC_016914	AG	3	6	222594	222599	50 %	0 %	50 %	0 %	379017388
5602	NC_016914	ACC	2	6	222607	222612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017388
5603	NC_016914	TAA	2	6	222643	222648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017388
5604	NC_016914	CT	3	6	222739	222744	0 %	50 %	0 %	50 %	379017388
5605	NC_016914	TA	3	6	222763	222768	50 %	50 %	0 %	0 %	379017388
5606	NC_016914	CAT	2	6	222831	222836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017388
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5608	NC_016914	ATT	2	6	222886	222891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017388
5609	NC_016914	T	6	6	222918	222923	0 %	100 %	0 %	0 %	379017388
5610	NC_016914	ATT	3	9	222958	222966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017388
5611	NC_016914	T	6	6	222965	222970	0 %	100 %	0 %	0 %	379017388
5612	NC_016914	TTG	2	6	223075	223080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017388
5613	NC_016914	TTG	2	6	223243	223248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017388
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5616	NC_016914	GAAT	2	8	223443	223450	50 %	25 %	25 %	0 %	379017388
5617	NC_016914	AT	3	6	223500	223505	50 %	50 %	0 %	0 %	379017388
5618	NC_016914	T	6	6	223524	223529	0 %	100 %	0 %	0 %	379017388
5619	NC_016914	CTT	2	6	223533	223538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017388
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5625	NC_016914	TAA	2	6	223650	223655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017388
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