MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 32298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016914	T	6	6	199040	199045	0 %	100 %	0 %	0 %	379017362
5002	NC_016914	ATT	2	6	199046	199051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017362
5003	NC_016914	AT	3	6	199106	199111	50 %	50 %	0 %	0 %	379017362
5004	NC_016914	CAG	2	6	199119	199124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017362
5005	NC_016914	TAA	3	9	199243	199251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017362
5006	NC_016914	TTG	2	6	199255	199260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017362
5007	NC_016914	GTT	2	6	199318	199323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016914	TCA	2	6	199340	199345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_016914	T	7	7	199406	199412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016914	ATT	2	6	199413	199418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016914	T	6	6	199417	199422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016914	ATG	2	6	199455	199460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016914	A	6	6	199610	199615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016914	TCT	2	6	199667	199672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017363
5015	NC_016914	TAAAG	2	10	199724	199733	60 %	20 %	20 %	0 %	379017363
5016	NC_016914	ATA	2	6	199740	199745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017363
5017	NC_016914	AG	3	6	199848	199853	50 %	0 %	50 %	0 %	379017363
5018	NC_016914	AAAG	2	8	199860	199867	75 %	0 %	25 %	0 %	379017363
5019	NC_016914	A	6	6	199931	199936	100 %	0 %	0 %	0 %	379017363
5020	NC_016914	AAAG	2	8	200012	200019	75 %	0 %	25 %	0 %	379017363
5021	NC_016914	ATA	2	6	200098	200103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017363
5022	NC_016914	GCT	2	6	200244	200249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017363
5023	NC_016914	TA	3	6	200284	200289	50 %	50 %	0 %	0 %	379017363
5024	NC_016914	T	6	6	200331	200336	0 %	100 %	0 %	0 %	379017363
5025	NC_016914	GGC	2	6	200339	200344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017363
5026	NC_016914	ATA	2	6	200399	200404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016914	T	6	6	200426	200431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016914	ATTA	2	8	200440	200447	50 %	50 %	0 %	0 %	379017364
5029	NC_016914	ATT	2	6	200566	200571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017364
5030	NC_016914	CCA	2	6	200617	200622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017364
5031	NC_016914	CTT	2	6	200653	200658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017364
5032	NC_016914	T	6	6	200694	200699	0 %	100 %	0 %	0 %	379017364
5033	NC_016914	AGCA	2	8	200715	200722	50 %	0 %	25 %	25 %	379017364
5034	NC_016914	CAG	2	6	200726	200731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017364
5035	NC_016914	T	6	6	200748	200753	0 %	100 %	0 %	0 %	379017364
5036	NC_016914	ATC	2	6	200790	200795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017364
5037	NC_016914	CTT	2	6	200810	200815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017364
5038	NC_016914	TAT	2	6	200948	200953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017364
5039	NC_016914	TAAT	3	12	200965	200976	50 %	50 %	0 %	0 %	379017364
5040	NC_016914	GAT	2	6	201006	201011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017364
5041	NC_016914	ATC	2	6	201042	201047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017364
5042	NC_016914	ATT	2	6	201051	201056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017364
5043	NC_016914	TGC	2	6	201072	201077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017364
5044	NC_016914	TC	3	6	201105	201110	0 %	50 %	0 %	50 %	379017364
5045	NC_016914	TAA	2	6	201183	201188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016914	AGTA	2	8	201195	201202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_016914	TTA	2	6	201286	201291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016914	ACG	2	6	201293	201298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_016914	T	6	6	201354	201359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016914	TAA	2	6	201369	201374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016914	A	6	6	201405	201410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016914	GCA	2	6	201422	201427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_016914	A	6	6	201427	201432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016914	ATA	2	6	201471	201476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017365
5055	NC_016914	TATT	2	8	201504	201511	25 %	75 %	0 %	0 %	379017365
5056	NC_016914	AAG	2	6	201549	201554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017365
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5058	NC_016914	TTA	2	6	201591	201596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017365
5059	NC_016914	TTA	2	6	201611	201616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017365
5060	NC_016914	TTA	2	6	201644	201649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017365
5061	NC_016914	T	6	6	201723	201728	0 %	100 %	0 %	0 %	379017365
5062	NC_016914	TTA	2	6	201755	201760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017365
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5064	NC_016914	CGG	2	6	201778	201783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017365
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5067	NC_016914	T	7	7	201951	201957	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
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5078	NC_016914	AT	3	6	202336	202341	50 %	50 %	0 %	0 %	379017366
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5080	NC_016914	T	6	6	202446	202451	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
5081	NC_016914	ATA	2	6	202477	202482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017366
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5083	NC_016914	TC	3	6	202502	202507	0 %	50 %	0 %	50 %	379017366
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5087	NC_016914	T	8	8	202575	202582	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
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5089	NC_016914	TTG	2	6	202687	202692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_016914	GTA	2	6	202728	202733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_016914	CAA	2	6	202817	202822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_016914	GCT	2	6	202831	202836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5094	NC_016914	AAT	2	6	202983	202988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017367
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5097	NC_016914	ATT	2	6	203103	203108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017367
5098	NC_016914	CATT	2	8	203229	203236	25 %	50 %	0 %	25 %	379017367
5099	NC_016914	TTTA	2	8	203252	203259	25 %	75 %	0 %	0 %	379017367
5100	NC_016914	AAT	2	6	203268	203273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017367
5101	NC_016914	CATT	2	8	203310	203317	25 %	50 %	0 %	25 %	379017367
5102	NC_016914	TGC	2	6	203318	203323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017367
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5105	NC_016914	TCA	2	6	203463	203468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017367
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5107	NC_016914	CTT	3	9	203521	203529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017367
5108	NC_016914	CGC	2	6	203551	203556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017367
5109	NC_016914	ATT	2	6	203586	203591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017367
5110	NC_016914	CAAG	2	8	203605	203612	50 %	0 %	25 %	25 %	379017367
5111	NC_016914	ATG	2	6	203649	203654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017367
5112	NC_016914	GAATT	2	10	203659	203668	40 %	40 %	20 %	0 %	379017367
5113	NC_016914	CGC	2	6	203704	203709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017367
5114	NC_016914	T	6	6	203802	203807	0 %	100 %	0 %	0 %	379017367
5115	NC_016914	GCT	2	6	203817	203822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017367
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5117	NC_016914	TGAT	2	8	203909	203916	25 %	50 %	25 %	0 %	379017367
5118	NC_016914	AAT	2	6	204073	204078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017367
5119	NC_016914	ATTT	3	12	204100	204111	25 %	75 %	0 %	0 %	379017367
5120	NC_016914	AAGCCC	2	12	204119	204130	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379017367
5121	NC_016914	TGC	2	6	204188	204193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017367
5122	NC_016914	TGC	2	6	204224	204229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017367
5123	NC_016914	TAC	2	6	204238	204243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017367
5124	NC_016914	A	6	6	204250	204255	100 %	0 %	0 %	0 %	379017367
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5126	NC_016914	CAG	2	6	204477	204482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017368
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