MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 19408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016913	GTG	2	6	13	18	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016913	AAT	2	6	49	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016913	CAG	2	6	203	208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016913	GTG	2	6	229	234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016913	AAT	2	6	265	270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016913	CAG	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016913	GTG	2	6	445	450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016913	AAT	2	6	481	486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016913	GGA	2	6	589	594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016913	AAT	2	6	607	612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016913	TGG	3	9	660	668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016913	TTA	2	6	681	686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016913	AAT	2	6	712	717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016913	ATA	2	6	920	925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016913	TAT	2	6	926	931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016913	AGC	2	6	933	938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016913	TAG	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016913	TGA	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016913	TGG	2	6	984	989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016913	TAA	2	6	1056	1061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016913	TTA	2	6	1136	1141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016913	AAT	2	6	1144	1149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016913	TAG	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016913	AAT	2	6	1225	1230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016913	TGG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016913	ACA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016913	CTA	2	6	1550	1555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016913	ATG	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016913	CGG	2	6	1695	1700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016913	TAA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016913	GCA	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016913	GGT	2	6	1900	1905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016913	TAC	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016913	CTA	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016913	TAC	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016913	TAC	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016913	AGC	2	6	2310	2315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016913	GGT	2	6	2323	2328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016913	GTA	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016913	TTG	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016913	CTA	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016913	AAT	2	6	2416	2421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016913	CAG	2	6	2462	2467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016913	TAA	2	6	2511	2516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016913	AGA	2	6	2571	2576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016913	TGC	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016913	GGA	2	6	2673	2678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016913	TGT	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016913	TAA	2	6	2808	2813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016913	TCT	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016913	TGA	2	6	2910	2915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016913	AGA	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016913	TGG	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016913	GAT	2	6	3049	3054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016913	TAA	2	6	3108	3113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016913	ATA	2	6	3218	3223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016913	AAG	2	6	3228	3233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016913	ATG	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016913	TAC	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016913	CTC	2	6	3617	3622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016913	ATG	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016913	GAG	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016913	ATA	2	6	3984	3989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015836
64	NC_016913	GAA	3	9	4083	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015836
65	NC_016913	GCG	2	6	4092	4097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379015836
66	NC_016913	GAA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015836
67	NC_016913	ATT	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
68	NC_016913	TTA	2	6	4288	4293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
69	NC_016913	TGA	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015836
70	NC_016913	GAA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015836
71	NC_016913	TTA	2	6	4430	4435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
72	NC_016913	TTG	2	6	4467	4472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015836
73	NC_016913	TAG	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015836
74	NC_016913	ATA	2	6	4641	4646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015836
75	NC_016913	GTT	2	6	4735	4740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015836
76	NC_016913	TTA	2	6	4814	4819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
77	NC_016913	AAT	2	6	4975	4980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015836
78	NC_016913	ATA	2	6	4995	5000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015836
79	NC_016913	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
80	NC_016913	TAC	2	6	5332	5337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015836
81	NC_016913	TGA	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015836
82	NC_016913	TGA	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015836
83	NC_016913	ATT	2	6	5507	5512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
84	NC_016913	GCT	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016913	TAG	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
86	NC_016913	ACC	2	6	6000	6005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015837
87	NC_016913	AGC	2	6	6084	6089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015837
88	NC_016913	GAT	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
89	NC_016913	CAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015837
90	NC_016913	CAT	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015837
91	NC_016913	GCA	2	6	6391	6396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015837
92	NC_016913	TAA	2	6	6450	6455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015837
93	NC_016913	ATG	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
94	NC_016913	GAA	2	6	6636	6641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015837
95	NC_016913	TGA	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
96	NC_016913	CAA	2	6	6739	6744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015837
97	NC_016913	GTT	2	6	6782	6787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015837
98	NC_016913	AGT	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
99	NC_016913	AAT	2	6	6843	6848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015837
100	NC_016913	TAT	2	6	6894	6899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015837
101	NC_016913	AAG	2	6	6935	6940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015837
102	NC_016913	CAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015837
103	NC_016913	ATT	2	6	7010	7015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015837
104	NC_016913	GTA	2	6	7046	7051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
105	NC_016913	GTT	3	9	7206	7214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016913	AAT	2	6	7270	7275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016913	CTA	2	6	7331	7336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015838
108	NC_016913	AAT	2	6	7405	7410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015838
109	NC_016913	TAT	2	6	7469	7474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016913	GAC	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016913	TGG	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015839
112	NC_016913	ATT	2	6	7637	7642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015839
113	NC_016913	TAA	3	9	7665	7673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015839
114	NC_016913	TAG	2	6	7676	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015839
115	NC_016913	GAA	2	6	7714	7719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015839
116	NC_016913	GTT	2	6	7749	7754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016913	TAA	2	6	7909	7914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015840
118	NC_016913	ATT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015840
119	NC_016913	AAG	2	6	8062	8067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015840
120	NC_016913	GAA	2	6	8138	8143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015840
121	NC_016913	TTA	2	6	8196	8201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015840
122	NC_016913	GAG	2	6	8214	8219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015840
123	NC_016913	GTA	2	6	8244	8249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015840
124	NC_016913	ATA	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015840
125	NC_016913	ATT	2	6	8348	8353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015840
126	NC_016913	TAA	2	6	8367	8372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015840
127	NC_016913	GCT	2	6	8393	8398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015840
128	NC_016913	ATT	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015840
129	NC_016913	AGA	2	6	8434	8439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015840
130	NC_016913	GAG	2	6	8498	8503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016913	TGA	2	6	8576	8581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015841
132	NC_016913	TGC	2	6	8614	8619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015841
133	NC_016913	TAG	2	6	8625	8630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015841
134	NC_016913	ATT	2	6	8650	8655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015841
135	NC_016913	TAT	2	6	8851	8856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016913	ATT	2	6	8862	8867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016913	TAA	2	6	8954	8959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016913	AAT	2	6	8974	8979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016913	TAA	2	6	9030	9035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015842
140	NC_016913	TAA	2	6	9097	9102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015842
141	NC_016913	ATT	2	6	9132	9137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015842
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153	NC_016913	TAT	2	6	9998	10003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016913	ATA	2	6	10057	10062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_016913	TAA	2	6	17013	17018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_016913	TAC	2	6	17020	17025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_016913	ACT	2	6	17130	17135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_016913	TTA	2	6	17140	17145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_016913	GCC	2	6	17199	17204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_016913	ACG	2	6	17256	17261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015854
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276	NC_016913	ATA	2	6	17286	17291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015854
277	NC_016913	ACT	2	6	17297	17302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015854
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280	NC_016913	AGG	2	6	17377	17382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015854
281	NC_016913	GGT	2	6	17405	17410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015854
282	NC_016913	GGA	2	6	17516	17521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016913	TAC	2	6	17539	17544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_016913	GCT	2	6	17624	17629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_016913	GTG	2	6	17640	17645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_016913	GTA	2	6	17880	17885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_016913	TGC	2	6	17968	17973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_016913	ATA	2	6	17979	17984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_016913	CAG	2	6	18060	18065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_016913	GGT	2	6	18104	18109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_016913	TAA	2	6	18136	18141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_016913	ATA	2	6	18261	18266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_016913	TTA	2	6	18284	18289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_016913	TAC	2	6	18329	18334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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311	NC_016913	ATA	2	6	19463	19468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_016913	ATT	2	6	19475	19480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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