MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016913	A	6	6	159657	159662	100 %	0 %	0 %	0 %	379016004
4002	NC_016913	AGA	2	6	159686	159691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016004
4003	NC_016913	ATA	2	6	159739	159744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016004
4004	NC_016913	A	7	7	159812	159818	100 %	0 %	0 %	0 %	379016004
4005	NC_016913	ATA	2	6	159838	159843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016004
4006	NC_016913	ATT	2	6	159861	159866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016004
4007	NC_016913	GTA	2	6	159898	159903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016004
4008	NC_016913	AAG	2	6	159919	159924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016004
4009	NC_016913	TAT	2	6	160050	160055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016913	TCT	2	6	160090	160095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_016913	ATTA	2	8	160156	160163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016913	A	6	6	160177	160182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016913	T	6	6	160204	160209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016913	AATT	2	8	160225	160232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016913	AGG	2	6	160294	160299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016913	GATTT	2	10	160301	160310	20 %	60 %	20 %	0 %	379016005
4017	NC_016913	ATT	2	6	160316	160321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016005
4018	NC_016913	AGA	2	6	160333	160338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016005
4019	NC_016913	TAAA	2	8	160341	160348	75 %	25 %	0 %	0 %	379016005
4020	NC_016913	AT	4	8	160367	160374	50 %	50 %	0 %	0 %	379016005
4021	NC_016913	A	6	6	160402	160407	100 %	0 %	0 %	0 %	379016005
4022	NC_016913	AGGA	2	8	160415	160422	50 %	0 %	50 %	0 %	379016005
4023	NC_016913	TA	3	6	160536	160541	50 %	50 %	0 %	0 %	379016005
4024	NC_016913	ATA	2	6	160590	160595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016005
4025	NC_016913	AAG	2	6	160639	160644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016005
4026	NC_016913	AGC	2	6	160678	160683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016005
4027	NC_016913	AGA	2	6	160699	160704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016005
4028	NC_016913	ACG	2	6	160851	160856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016005
4029	NC_016913	CTG	2	6	160878	160883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016005
4030	NC_016913	A	6	6	160996	161001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016913	TTA	2	6	161016	161021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016913	T	8	8	161027	161034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016913	TTA	2	6	161103	161108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016913	A	7	7	161118	161124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016913	TA	3	6	161144	161149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016913	AT	3	6	161152	161157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016913	A	7	7	161325	161331	100 %	0 %	0 %	0 %	379016006
4038	NC_016913	TAG	2	6	161372	161377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016006
4039	NC_016913	TGC	2	6	161403	161408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4040	NC_016913	CAG	2	6	161413	161418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4041	NC_016913	AAC	2	6	161424	161429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016006
4042	NC_016913	GCT	2	6	161437	161442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4043	NC_016913	TTA	2	6	161513	161518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016006
4044	NC_016913	TGCTAA	2	12	161520	161531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379016006
4045	NC_016913	TGT	2	6	161576	161581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016006
4046	NC_016913	CAGTGA	2	12	161603	161614	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379016006
4047	NC_016913	TAC	2	6	161622	161627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4048	NC_016913	TCA	2	6	161636	161641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4049	NC_016913	TGT	2	6	161646	161651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016006
4050	NC_016913	GCT	3	9	161734	161742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4051	NC_016913	A	6	6	161745	161750	100 %	0 %	0 %	0 %	379016006
4052	NC_016913	TGT	3	9	161760	161768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016006
4053	NC_016913	TAA	2	6	161775	161780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4054	NC_016913	TGC	2	6	161784	161789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4055	NC_016913	AAT	2	6	161797	161802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4056	NC_016913	GAA	2	6	161819	161824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016006
4057	NC_016913	ATTTA	2	10	161856	161865	40 %	60 %	0 %	0 %	379016006
4058	NC_016913	CTC	2	6	161888	161893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379016006
4059	NC_016913	TAA	2	6	162045	162050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4060	NC_016913	GGT	2	6	162076	162081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016006
4061	NC_016913	ACT	2	6	162082	162087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4062	NC_016913	TAT	2	6	162125	162130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016006
4063	NC_016913	TAAG	2	8	162131	162138	50 %	25 %	25 %	0 %	379016006
4064	NC_016913	TGC	3	9	162141	162149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4065	NC_016913	GCT	2	6	162250	162255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4066	NC_016913	TAA	2	6	162273	162278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4067	NC_016913	TGT	2	6	162303	162308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016006
4068	NC_016913	CAA	2	6	162332	162337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016006
4069	NC_016913	TAC	2	6	162435	162440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4070	NC_016913	CAG	2	6	162452	162457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4071	NC_016913	GCA	2	6	162517	162522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4072	NC_016913	ATA	2	6	162668	162673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4073	NC_016913	TGC	2	6	162726	162731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4074	NC_016913	GGT	2	6	162820	162825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016006
4075	NC_016913	TGC	3	9	162897	162905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4076	NC_016913	A	7	7	162937	162943	100 %	0 %	0 %	0 %	379016006
4077	NC_016913	TGG	2	6	162954	162959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016006
4078	NC_016913	TGG	3	9	162978	162986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016006
4079	NC_016913	GATT	2	8	162990	162997	25 %	50 %	25 %	0 %	379016006
4080	NC_016913	GGT	2	6	163009	163014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016006
4081	NC_016913	ATTAA	2	10	163018	163027	60 %	40 %	0 %	0 %	379016006
4082	NC_016913	ATA	2	6	163040	163045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4083	NC_016913	TTGATT	2	12	163052	163063	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379016006
4084	NC_016913	TAGCTA	2	12	163064	163075	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379016006
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4087	NC_016913	AGTT	2	8	163238	163245	25 %	50 %	25 %	0 %	379016006
4088	NC_016913	TAA	2	6	163289	163294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4089	NC_016913	TGC	2	6	163308	163313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
4090	NC_016913	ATA	2	6	163327	163332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4091	NC_016913	TGT	2	6	163341	163346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016006
4092	NC_016913	AAT	2	6	163348	163353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4093	NC_016913	AATT	2	8	163410	163417	50 %	50 %	0 %	0 %	379016006
4094	NC_016913	CTA	2	6	163481	163486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4095	NC_016913	TAC	3	9	163491	163499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4096	NC_016913	TAA	2	6	163578	163583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4097	NC_016913	TAC	2	6	163611	163616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
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4099	NC_016913	TAG	2	6	163736	163741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016006
4100	NC_016913	AAAC	2	8	163776	163783	75 %	0 %	0 %	25 %	379016006
4101	NC_016913	ATC	2	6	163868	163873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4102	NC_016913	CATTC	2	10	163944	163953	20 %	40 %	0 %	40 %	379016006
4103	NC_016913	ATG	2	6	163955	163960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016006
4104	NC_016913	TAA	2	6	164001	164006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4105	NC_016913	GTT	2	6	164038	164043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016006
4106	NC_016913	ATA	2	6	164093	164098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4107	NC_016913	TAGGTC	2	12	164102	164113	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379016006
4108	NC_016913	CTA	2	6	164144	164149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4109	NC_016913	AAT	2	6	164179	164184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4110	NC_016913	GGT	2	6	164206	164211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016006
4111	NC_016913	CAAG	2	8	164271	164278	50 %	0 %	25 %	25 %	379016006
4112	NC_016913	TAC	2	6	164286	164291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4113	NC_016913	AAC	2	6	164299	164304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016006
4114	NC_016913	ATT	2	6	164314	164319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016006
4115	NC_016913	CAA	2	6	164330	164335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016006
4116	NC_016913	TAC	2	6	164355	164360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4117	NC_016913	TAACGG	2	12	164412	164423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379016006
4118	NC_016913	TAC	2	6	164475	164480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
4119	NC_016913	TAA	2	6	164487	164492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
4120	NC_016913	TCG	2	6	164522	164527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
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4122	NC_016913	GGC	2	6	164674	164679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379016006
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