MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016913	GGT	2	6	120732	120737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015958
3002	NC_016913	AGC	2	6	120884	120889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015958
3003	NC_016913	ATG	2	6	120961	120966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016913	CA	3	6	120977	120982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_016913	A	7	7	120991	120997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016913	ATGA	2	8	121005	121012	50 %	25 %	25 %	0 %	379015959
3007	NC_016913	TAA	3	9	121020	121028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015959
3008	NC_016913	ATA	2	6	121060	121065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015959
3009	NC_016913	AGT	2	6	121087	121092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015959
3010	NC_016913	CTG	2	6	121130	121135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015959
3011	NC_016913	A	7	7	121254	121260	100 %	0 %	0 %	0 %	379015959
3012	NC_016913	TTA	2	6	121333	121338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015959
3013	NC_016913	GCG	2	6	121376	121381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379015959
3014	NC_016913	TAAA	2	8	121448	121455	75 %	25 %	0 %	0 %	379015959
3015	NC_016913	ATG	2	6	121475	121480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015959
3016	NC_016913	TTG	2	6	121631	121636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015959
3017	NC_016913	CTA	2	6	121685	121690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015959
3018	NC_016913	GGT	2	6	121717	121722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015959
3019	NC_016913	AAAT	2	8	121757	121764	75 %	25 %	0 %	0 %	379015959
3020	NC_016913	ATT	2	6	121770	121775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015959
3021	NC_016913	GGT	2	6	121789	121794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015959
3022	NC_016913	ATA	2	6	121807	121812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015959
3023	NC_016913	T	6	6	121830	121835	0 %	100 %	0 %	0 %	379015959
3024	NC_016913	CAG	2	6	121870	121875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015959
3025	NC_016913	TAA	2	6	121877	121882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015959
3026	NC_016913	AAGA	2	8	121913	121920	75 %	0 %	25 %	0 %	379015959
3027	NC_016913	GATAT	2	10	121922	121931	40 %	40 %	20 %	0 %	379015959
3028	NC_016913	GGT	2	6	121939	121944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015959
3029	NC_016913	TAA	2	6	122037	122042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015959
3030	NC_016913	TGA	2	6	122058	122063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015959
3031	NC_016913	TAC	2	6	122112	122117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015959
3032	NC_016913	A	6	6	122184	122189	100 %	0 %	0 %	0 %	379015959
3033	NC_016913	ATA	2	6	122198	122203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015959
3034	NC_016913	AGC	2	6	122213	122218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015959
3035	NC_016913	ATT	2	6	122250	122255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015959
3036	NC_016913	TAAA	2	8	122274	122281	75 %	25 %	0 %	0 %	379015960
3037	NC_016913	TAAAAG	2	12	122295	122306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379015960
3038	NC_016913	TAA	2	6	122343	122348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015960
3039	NC_016913	TG	3	6	122368	122373	0 %	50 %	50 %	0 %	379015960
3040	NC_016913	GCT	2	6	122381	122386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015960
3041	NC_016913	A	7	7	122413	122419	100 %	0 %	0 %	0 %	379015960
3042	NC_016913	TGA	2	6	122430	122435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015960
3043	NC_016913	GTA	2	6	122561	122566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015960
3044	NC_016913	TGA	2	6	122584	122589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015960
3045	NC_016913	ATC	2	6	122644	122649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015960
3046	NC_016913	TAC	2	6	122656	122661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015960
3047	NC_016913	T	6	6	122683	122688	0 %	100 %	0 %	0 %	379015960
3048	NC_016913	AAGAA	2	10	122689	122698	80 %	0 %	20 %	0 %	379015960
3049	NC_016913	AGC	2	6	122701	122706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015960
3050	NC_016913	ATA	2	6	122711	122716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015960
3051	NC_016913	ATA	2	6	122823	122828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015960
3052	NC_016913	A	6	6	122831	122836	100 %	0 %	0 %	0 %	379015960
3053	NC_016913	ATG	2	6	122867	122872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015960
3054	NC_016913	GAA	2	6	122885	122890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015960
3055	NC_016913	AGT	2	6	122899	122904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015960
3056	NC_016913	GAT	2	6	122915	122920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015960
3057	NC_016913	TTC	2	6	123085	123090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015960
3058	NC_016913	CAA	2	6	123134	123139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015960
3059	NC_016913	TG	3	6	123173	123178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016913	TAT	2	6	123194	123199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016913	AAT	2	6	123217	123222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016913	TA	4	8	123240	123247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016913	AC	3	6	123264	123269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_016913	AGA	2	6	123291	123296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016913	TAT	2	6	123326	123331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016913	TAAT	2	8	123401	123408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016913	GAG	2	6	123457	123462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015961
3068	NC_016913	TGG	2	6	123524	123529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016913	AAT	2	6	123578	123583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016913	A	6	6	123680	123685	100 %	0 %	0 %	0 %	379015962
3071	NC_016913	AAT	2	6	123706	123711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015962
3072	NC_016913	TATT	2	8	123816	123823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016913	ACA	2	6	123866	123871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015963
3074	NC_016913	ATAA	2	8	123892	123899	75 %	25 %	0 %	0 %	379015963
3075	NC_016913	A	7	7	123910	123916	100 %	0 %	0 %	0 %	379015963
3076	NC_016913	TAAAA	2	10	123954	123963	80 %	20 %	0 %	0 %	379015963
3077	NC_016913	TGC	2	6	123993	123998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015963
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3079	NC_016913	CTA	2	6	124043	124048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015963
3080	NC_016913	TTCT	2	8	124052	124059	0 %	75 %	0 %	25 %	379015963
3081	NC_016913	AT	3	6	124165	124170	50 %	50 %	0 %	0 %	379015963
3082	NC_016913	ATC	2	6	124256	124261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015963
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3084	NC_016913	TTA	2	6	124335	124340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015963
3085	NC_016913	TAAA	2	8	124343	124350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_016913	A	7	7	124348	124354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_016913	A	7	7	124372	124378	100 %	0 %	0 %	0 %	379015964
3088	NC_016913	A	8	8	124391	124398	100 %	0 %	0 %	0 %	379015964
3089	NC_016913	ATA	2	6	124404	124409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015964
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3091	NC_016913	A	6	6	124447	124452	100 %	0 %	0 %	0 %	379015964
3092	NC_016913	T	7	7	124453	124459	0 %	100 %	0 %	0 %	379015964
3093	NC_016913	AAAAAC	2	12	124462	124473	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	379015964
3094	NC_016913	T	7	7	124483	124489	0 %	100 %	0 %	0 %	379015964
3095	NC_016913	A	6	6	124521	124526	100 %	0 %	0 %	0 %	379015964
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3097	NC_016913	AGA	2	6	124642	124647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015964
3098	NC_016913	TA	3	6	124693	124698	50 %	50 %	0 %	0 %	379015964
3099	NC_016913	GTA	2	6	124718	124723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015964
3100	NC_016913	TTCA	2	8	124727	124734	25 %	50 %	0 %	25 %	379015964
3101	NC_016913	ATTT	2	8	124743	124750	25 %	75 %	0 %	0 %	379015964
3102	NC_016913	A	6	6	124783	124788	100 %	0 %	0 %	0 %	379015964
3103	NC_016913	ATT	2	6	124828	124833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015964
3104	NC_016913	CGT	2	6	124853	124858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015964
3105	NC_016913	GA	3	6	124859	124864	50 %	0 %	50 %	0 %	379015964
3106	NC_016913	GTT	2	6	124880	124885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015964
3107	NC_016913	AGA	2	6	124933	124938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015964
3108	NC_016913	TAG	2	6	124941	124946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015964
3109	NC_016913	GAT	2	6	124955	124960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015964
3110	NC_016913	TTA	2	6	124998	125003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015964
3111	NC_016913	CAA	2	6	125010	125015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015964
3112	NC_016913	AGA	2	6	125050	125055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015964
3113	NC_016913	AAT	2	6	125056	125061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015964
3114	NC_016913	ATG	2	6	125085	125090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015964
3115	NC_016913	AGT	2	6	125129	125134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015964
3116	NC_016913	ATTGAA	2	12	125174	125185	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379015964
3117	NC_016913	CTC	2	6	125199	125204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379015964
3118	NC_016913	A	6	6	125233	125238	100 %	0 %	0 %	0 %	379015964
3119	NC_016913	GT	3	6	125275	125280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016913	TAT	3	9	125305	125313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015965
3121	NC_016913	ATC	2	6	125338	125343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015965
3122	NC_016913	CTA	2	6	125405	125410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015965
3123	NC_016913	CAC	2	6	125417	125422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015965
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3125	NC_016913	TAC	2	6	125493	125498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015965
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3235	NC_016913	AAG	2	6	129725	129730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3240	NC_016913	AGA	2	6	129893	129898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_016913	ATG	2	6	129963	129968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_016913	TACA	2	8	130201	130208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3249	NC_016913	CAT	2	6	130273	130278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_016913	TAA	2	6	130280	130285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_016913	AT	3	6	130300	130305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_016913	TA	3	6	130321	130326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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