MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016913	AAT	2	6	21258	21263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015859
502	NC_016913	GTTAA	2	10	21327	21336	40 %	40 %	20 %	0 %	379015859
503	NC_016913	A	6	6	21335	21340	100 %	0 %	0 %	0 %	379015859
504	NC_016913	A	6	6	21344	21349	100 %	0 %	0 %	0 %	379015859
505	NC_016913	AG	3	6	21354	21359	50 %	0 %	50 %	0 %	379015859
506	NC_016913	TAT	2	6	21383	21388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015859
507	NC_016913	A	6	6	21434	21439	100 %	0 %	0 %	0 %	379015859
508	NC_016913	TA	3	6	21498	21503	50 %	50 %	0 %	0 %	379015859
509	NC_016913	A	7	7	21509	21515	100 %	0 %	0 %	0 %	379015859
510	NC_016913	TTA	2	6	21557	21562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015860
511	NC_016913	ATT	2	6	21568	21573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015860
512	NC_016913	CAA	3	9	21584	21592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015860
513	NC_016913	ATA	2	6	21602	21607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015860
514	NC_016913	A	6	6	21607	21612	100 %	0 %	0 %	0 %	379015860
515	NC_016913	ACT	2	6	21673	21678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015860
516	NC_016913	A	6	6	21706	21711	100 %	0 %	0 %	0 %	379015860
517	NC_016913	GGT	2	6	21778	21783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015860
518	NC_016913	AGT	2	6	21819	21824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015860
519	NC_016913	A	6	6	21919	21924	100 %	0 %	0 %	0 %	379015860
520	NC_016913	ATG	2	6	22001	22006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015860
521	NC_016913	CTT	2	6	22028	22033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_016913	CCT	2	6	22040	22045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_016913	AAG	2	6	22160	22165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016913	ATA	2	6	22176	22181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016913	TAA	2	6	22219	22224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016913	ATT	2	6	22243	22248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016913	ATG	2	6	22275	22280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016913	A	6	6	22289	22294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016913	TAA	2	6	22317	22322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016913	CT	3	6	22333	22338	0 %	50 %	0 %	50 %	379015861
531	NC_016913	TA	3	6	22379	22384	50 %	50 %	0 %	0 %	379015861
532	NC_016913	ACT	2	6	22385	22390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015861
533	NC_016913	AAG	2	6	22420	22425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015861
534	NC_016913	TA	3	6	22466	22471	50 %	50 %	0 %	0 %	379015861
535	NC_016913	TTA	2	6	22528	22533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015861
536	NC_016913	AAG	2	6	22553	22558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015861
537	NC_016913	GTA	2	6	22586	22591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015861
538	NC_016913	TGA	2	6	22624	22629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015861
539	NC_016913	ATC	2	6	22647	22652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015861
540	NC_016913	AAAG	2	8	22658	22665	75 %	0 %	25 %	0 %	379015861
541	NC_016913	ATAA	2	8	22674	22681	75 %	25 %	0 %	0 %	379015861
542	NC_016913	TATT	2	8	22704	22711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016913	A	7	7	22727	22733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016913	GAT	2	6	22744	22749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016913	TTA	2	6	22768	22773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015862
546	NC_016913	CAAGAA	2	12	22786	22797	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379015862
547	NC_016913	ATG	2	6	22877	22882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015862
548	NC_016913	ATT	2	6	22883	22888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015862
549	NC_016913	TA	3	6	22905	22910	50 %	50 %	0 %	0 %	379015862
550	NC_016913	GAA	2	6	22930	22935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016913	AT	3	6	23034	23039	50 %	50 %	0 %	0 %	379015863
552	NC_016913	AGA	2	6	23052	23057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015863
553	NC_016913	A	6	6	23061	23066	100 %	0 %	0 %	0 %	379015863
554	NC_016913	ACC	2	6	23109	23114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_016913	GCA	2	6	23162	23167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016913	A	6	6	23291	23296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016913	ATA	2	6	23334	23339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016913	AT	3	6	23343	23348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016913	AAT	2	6	23367	23372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016913	ATT	2	6	23386	23391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016913	A	7	7	23481	23487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016913	TA	3	6	23500	23505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016913	T	6	6	23573	23578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016913	ACT	2	6	23589	23594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016913	GTA	2	6	23609	23614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016913	TCA	2	6	23638	23643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_016913	TTA	2	6	23672	23677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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570	NC_016913	A	7	7	23787	23793	100 %	0 %	0 %	0 %	379015864
571	NC_016913	CTT	2	6	23804	23809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015864
572	NC_016913	GCT	2	6	23866	23871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015864
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574	NC_016913	GCGA	2	8	24000	24007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
575	NC_016913	ATA	2	6	24036	24041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_016913	TAAT	2	8	25247	25254	50 %	50 %	0 %	0 %	379015865
601	NC_016913	AG	3	6	25458	25463	50 %	0 %	50 %	0 %	379015865
602	NC_016913	ACA	2	6	25476	25481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015865
603	NC_016913	GTA	2	6	25526	25531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015865
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610	NC_016913	TAG	2	6	25757	25762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015866
611	NC_016913	TA	3	6	25780	25785	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
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614	NC_016913	TATT	2	8	25857	25864	25 %	75 %	0 %	0 %	379015866
615	NC_016913	GGA	2	6	25884	25889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015866
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621	NC_016913	CTAA	2	8	26110	26117	50 %	25 %	0 %	25 %	379015866
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623	NC_016913	TTCT	2	8	26153	26160	0 %	75 %	0 %	25 %	379015866
624	NC_016913	T	6	6	26221	26226	0 %	100 %	0 %	0 %	379015866
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628	NC_016913	GA	3	6	26353	26358	50 %	0 %	50 %	0 %	379015866
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630	NC_016913	TA	3	6	26419	26424	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
631	NC_016913	TGC	2	6	26433	26438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015866
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