MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 32014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_016913	CTA	2	6	216203	216208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016048
5503	NC_016913	TAT	2	6	216216	216221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016048
5504	NC_016913	T	6	6	216232	216237	0 %	100 %	0 %	0 %	379016048
5505	NC_016913	TA	3	6	216250	216255	50 %	50 %	0 %	0 %	379016048
5506	NC_016913	AT	3	6	216385	216390	50 %	50 %	0 %	0 %	379016048
5507	NC_016913	AT	3	6	216421	216426	50 %	50 %	0 %	0 %	379016048
5508	NC_016913	TAT	2	6	216608	216613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016049
5509	NC_016913	CCA	2	6	216678	216683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379016049
5510	NC_016913	T	8	8	216756	216763	0 %	100 %	0 %	0 %	379016049
5511	NC_016913	TAG	2	6	216795	216800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016049
5512	NC_016913	T	6	6	216860	216865	0 %	100 %	0 %	0 %	379016049
5513	NC_016913	T	6	6	216876	216881	0 %	100 %	0 %	0 %	379016049
5514	NC_016913	GATA	2	8	216886	216893	50 %	25 %	25 %	0 %	379016049
5515	NC_016913	CTTG	2	8	217024	217031	0 %	50 %	25 %	25 %	379016049
5516	NC_016913	ATT	2	6	217044	217049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016049
5517	NC_016913	ATT	2	6	217063	217068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016049
5518	NC_016913	AAT	2	6	217198	217203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016049
5519	NC_016913	A	6	6	217228	217233	100 %	0 %	0 %	0 %	379016049
5520	NC_016913	TGTT	2	8	217292	217299	0 %	75 %	25 %	0 %	379016049
5521	NC_016913	TCT	2	6	217308	217313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016050
5522	NC_016913	TAA	2	6	217372	217377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016050
5523	NC_016913	TAC	2	6	217432	217437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016050
5524	NC_016913	TAA	2	6	217448	217453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016050
5525	NC_016913	ACTC	2	8	217494	217501	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_016913	ATA	2	6	217534	217539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_016913	A	6	6	217581	217586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_016913	AAT	2	6	217620	217625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_016913	CTC	2	6	217637	217642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_016913	AGT	2	6	217645	217650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_016913	CTG	2	6	217662	217667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_016913	GCA	2	6	217735	217740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_016913	GTA	2	6	217777	217782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_016913	AGC	2	6	217794	217799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_016913	T	7	7	217847	217853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_016913	TTG	2	6	217883	217888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_016913	TTCG	2	8	217889	217896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5538	NC_016913	GCAC	2	8	217957	217964	25 %	0 %	25 %	50 %	379016051
5539	NC_016913	T	6	6	218003	218008	0 %	100 %	0 %	0 %	379016051
5540	NC_016913	GCA	2	6	218014	218019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016051
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5542	NC_016913	A	6	6	218035	218040	100 %	0 %	0 %	0 %	379016051
5543	NC_016913	TAT	2	6	218153	218158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
5544	NC_016913	GATA	2	8	218170	218177	50 %	25 %	25 %	0 %	379016051
5545	NC_016913	ATT	2	6	218215	218220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
5546	NC_016913	CTTT	2	8	218236	218243	0 %	75 %	0 %	25 %	379016051
5547	NC_016913	TGC	2	6	218329	218334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016051
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5549	NC_016913	TA	3	6	218343	218348	50 %	50 %	0 %	0 %	379016051
5550	NC_016913	GA	4	8	218351	218358	50 %	0 %	50 %	0 %	379016051
5551	NC_016913	TTAA	2	8	218404	218411	50 %	50 %	0 %	0 %	379016051
5552	NC_016913	TAT	2	6	218420	218425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
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5555	NC_016913	TAT	2	6	218456	218461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
5556	NC_016913	GCA	2	6	218497	218502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016051
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5559	NC_016913	GCA	2	6	218599	218604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016051
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5564	NC_016913	TAA	2	6	218819	218824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016051
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5570	NC_016913	TTA	2	6	219289	219294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_016913	ATT	2	6	219325	219330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_016913	GAG	2	6	219340	219345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_016913	ATG	2	6	219429	219434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5575	NC_016913	TAC	2	6	219461	219466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5582	NC_016913	TAT	2	6	219530	219535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_016913	TATT	2	8	219736	219743	25 %	75 %	0 %	0 %	379016052
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5592	NC_016913	AAT	2	6	219952	219957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016052
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5609	NC_016913	ATT	2	6	220565	220570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016052
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5622	NC_016913	ATTG	2	8	221101	221108	25 %	50 %	25 %	0 %	379016052
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