MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 3753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016911	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016911	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016911	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	378723381
4	NC_016911	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	378723381
5	NC_016911	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	378723382
6	NC_016911	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	378723382
7	NC_016911	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	378723382
8	NC_016911	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	378723382
9	NC_016911	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	378723382
10	NC_016911	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016911	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	378723384
12	NC_016911	ATTT	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	378723385
13	NC_016911	CTGT	2	8	8116	8123	0 %	50 %	25 %	25 %	378723386
14	NC_016911	CCTC	2	8	9845	9852	0 %	25 %	0 %	75 %	378723388
15	NC_016911	CAAT	2	8	9892	9899	50 %	25 %	0 %	25 %	378723388
16	NC_016911	ATTA	2	8	10889	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016911	ATTA	2	8	11103	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016911	ATCT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016911	TTTA	2	8	11714	11721	25 %	75 %	0 %	0 %	378723391
20	NC_016911	GATT	2	8	12158	12165	25 %	50 %	25 %	0 %	378723392
21	NC_016911	AAAT	2	8	12166	12173	75 %	25 %	0 %	0 %	378723392
22	NC_016911	AATT	2	8	12193	12200	50 %	50 %	0 %	0 %	378723392
23	NC_016911	TTAA	2	8	12374	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016911	ATGA	2	8	13071	13078	50 %	25 %	25 %	0 %	378723393
25	NC_016911	TAAA	2	8	14094	14101	75 %	25 %	0 %	0 %	378723394
26	NC_016911	TAAA	2	8	14253	14260	75 %	25 %	0 %	0 %	378723394
27	NC_016911	TCAT	2	8	14374	14381	25 %	50 %	0 %	25 %	378723394
28	NC_016911	CTTT	2	8	14508	14515	0 %	75 %	0 %	25 %	378723394
29	NC_016911	TTAG	2	8	14750	14757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016911	GCAA	2	8	14849	14856	50 %	0 %	25 %	25 %	378723395
31	NC_016911	TCTT	2	8	14926	14933	0 %	75 %	0 %	25 %	378723395
32	NC_016911	AGTA	2	8	15184	15191	50 %	25 %	25 %	0 %	378723396
33	NC_016911	GCTT	2	8	15710	15717	0 %	50 %	25 %	25 %	378723397
34	NC_016911	AATT	2	8	16059	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	378723397
35	NC_016911	TTGC	2	8	16332	16339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016911	AATA	2	8	16682	16689	75 %	25 %	0 %	0 %	378723398
37	NC_016911	TCTA	2	8	17149	17156	25 %	50 %	0 %	25 %	378723398
38	NC_016911	ACGT	2	8	17572	17579	25 %	25 %	25 %	25 %	378723398
39	NC_016911	CTTG	2	8	17687	17694	0 %	50 %	25 %	25 %	378723398
40	NC_016911	AGTA	2	8	18753	18760	50 %	25 %	25 %	0 %	378723400
41	NC_016911	ATTA	2	8	18778	18785	50 %	50 %	0 %	0 %	378723400
42	NC_016911	AATA	2	8	18822	18829	75 %	25 %	0 %	0 %	378723400
43	NC_016911	CTTT	2	8	18867	18874	0 %	75 %	0 %	25 %	378723400
44	NC_016911	TAAA	2	8	19058	19065	75 %	25 %	0 %	0 %	378723400
45	NC_016911	AGAT	2	8	19246	19253	50 %	25 %	25 %	0 %	378723400
46	NC_016911	TAAA	2	8	19411	19418	75 %	25 %	0 %	0 %	378723401
47	NC_016911	AGTA	2	8	19811	19818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016911	AAAC	2	8	19861	19868	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016911	TAAA	2	8	19936	19943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016911	TTAT	2	8	20134	20141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016911	GTAA	2	8	21038	21045	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
52	NC_016911	AGAT	2	8	21292	21299	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
53	NC_016911	AGCA	2	8	21411	21418	50 %	0 %	25 %	25 %	378723403
54	NC_016911	AAAT	2	8	21454	21461	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
55	NC_016911	AATG	2	8	21655	21662	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
56	NC_016911	ATTA	2	8	21956	21963	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
57	NC_016911	ATAG	2	8	22004	22011	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
58	NC_016911	ATAG	2	8	22016	22023	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
59	NC_016911	CGTT	2	8	22434	22441	0 %	50 %	25 %	25 %	378723403
60	NC_016911	TAGT	2	8	22881	22888	25 %	50 %	25 %	0 %	378723403
61	NC_016911	AAGC	2	8	23621	23628	50 %	0 %	25 %	25 %	378723403
62	NC_016911	TAAA	2	8	23946	23953	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
63	NC_016911	AAGT	2	8	24456	24463	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
64	NC_016911	AAGT	2	8	24543	24550	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
65	NC_016911	TTCA	2	8	25092	25099	25 %	50 %	0 %	25 %	378723403
66	NC_016911	AATA	2	8	25585	25592	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
67	NC_016911	TAAA	2	8	25731	25738	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
68	NC_016911	ACTA	2	8	25867	25874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016911	ATGT	2	8	26530	26537	25 %	50 %	25 %	0 %	378723405
70	NC_016911	TTAT	2	8	26584	26591	25 %	75 %	0 %	0 %	378723405
71	NC_016911	AGCA	2	8	26658	26665	50 %	0 %	25 %	25 %	378723405
72	NC_016911	TAAT	2	8	27459	27466	50 %	50 %	0 %	0 %	378723406
73	NC_016911	AAGA	2	8	27611	27618	75 %	0 %	25 %	0 %	378723406
74	NC_016911	AAAT	2	8	27703	27710	75 %	25 %	0 %	0 %	378723406
75	NC_016911	ATTA	2	8	27731	27738	50 %	50 %	0 %	0 %	378723406
76	NC_016911	TAAA	2	8	28578	28585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016911	AGGA	2	8	28636	28643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016911	TAAA	2	8	28668	28675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016911	GCTA	2	8	28678	28685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016911	TCTA	2	8	29427	29434	25 %	50 %	0 %	25 %	378723410
81	NC_016911	ATTT	2	8	29471	29478	25 %	75 %	0 %	0 %	378723410
82	NC_016911	TGTC	2	8	29535	29542	0 %	50 %	25 %	25 %	378723410
83	NC_016911	TAAT	2	8	29925	29932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016911	ATAC	2	8	30132	30139	50 %	25 %	0 %	25 %	378723412
85	NC_016911	ATAA	2	8	30556	30563	75 %	25 %	0 %	0 %	378723412
86	NC_016911	CACT	2	8	30650	30657	25 %	25 %	0 %	50 %	378723412
87	NC_016911	TATT	2	8	31474	31481	25 %	75 %	0 %	0 %	378723414
88	NC_016911	AATT	2	8	33108	33115	50 %	50 %	0 %	0 %	378723416
89	NC_016911	TACC	2	8	33198	33205	25 %	25 %	0 %	50 %	378723416
90	NC_016911	GTTA	2	8	33580	33587	25 %	50 %	25 %	0 %	378723416
91	NC_016911	AAAC	2	8	35003	35010	75 %	0 %	0 %	25 %	378723418
92	NC_016911	TTAG	2	8	35179	35186	25 %	50 %	25 %	0 %	378723418
93	NC_016911	TTGC	2	8	35474	35481	0 %	50 %	25 %	25 %	378723418
94	NC_016911	TTCC	2	8	35714	35721	0 %	50 %	0 %	50 %	378723418
95	NC_016911	TGTT	2	8	36182	36189	0 %	75 %	25 %	0 %	378723419
96	NC_016911	TTGT	2	8	36788	36795	0 %	75 %	25 %	0 %	378723420
97	NC_016911	TATT	2	8	36867	36874	25 %	75 %	0 %	0 %	378723420
98	NC_016911	GTAA	2	8	36878	36885	50 %	25 %	25 %	0 %	378723420
99	NC_016911	AATG	2	8	37650	37657	50 %	25 %	25 %	0 %	378723422
100	NC_016911	GTTT	2	8	38164	38171	0 %	75 %	25 %	0 %	378723422
101	NC_016911	ATAA	2	8	38659	38666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016911	AACA	2	8	38756	38763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016911	TAAA	2	8	39858	39865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016911	CTTG	2	8	40700	40707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016911	CTGA	2	8	40708	40715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016911	ATTG	2	8	40886	40893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016911	TAAA	2	8	41042	41049	75 %	25 %	0 %	0 %	378723424
108	NC_016911	ATTT	2	8	41147	41154	25 %	75 %	0 %	0 %	378723424
109	NC_016911	ATTA	2	8	41313	41320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016911	ATTA	2	8	41370	41377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016911	TGCT	3	12	41493	41504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016911	GCTT	2	8	41620	41627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016911	TTTA	2	8	41660	41667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016911	ATTA	2	8	42101	42108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016911	TAAT	2	8	42394	42401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016911	ATTA	2	8	42464	42471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016911	AAAT	2	8	42567	42574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016911	GAAA	2	8	42778	42785	75 %	0 %	25 %	0 %	378723426
119	NC_016911	ATTT	2	8	42822	42829	25 %	75 %	0 %	0 %	378723426
120	NC_016911	ACAA	2	8	43089	43096	75 %	0 %	0 %	25 %	378723426
121	NC_016911	AAAT	2	8	43293	43300	75 %	25 %	0 %	0 %	378723427
122	NC_016911	TACC	2	8	44647	44654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016911	AAAC	2	8	44655	44662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016911	TAAT	2	8	44731	44738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016911	ATTT	2	8	44758	44765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016911	ATTA	2	8	44766	44773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016911	AAAT	2	8	44785	44792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016911	ATGA	2	8	44988	44995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016911	TAAC	2	8	45178	45185	50 %	25 %	0 %	25 %	378723429
130	NC_016911	ATTC	2	8	45607	45614	25 %	50 %	0 %	25 %	378723430
131	NC_016911	ATGT	2	8	45963	45970	25 %	50 %	25 %	0 %	378723431
132	NC_016911	ATTT	2	8	46122	46129	25 %	75 %	0 %	0 %	378723431
133	NC_016911	TTAC	2	8	46201	46208	25 %	50 %	0 %	25 %	378723431
134	NC_016911	ATCA	2	8	46878	46885	50 %	25 %	0 %	25 %	378723432
135	NC_016911	TGCC	2	8	47188	47195	0 %	25 %	25 %	50 %	378723432
136	NC_016911	TATC	2	8	47747	47754	25 %	50 %	0 %	25 %	378723432
137	NC_016911	TTAA	2	8	47770	47777	50 %	50 %	0 %	0 %	378723432
138	NC_016911	AGTA	2	8	48876	48883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016911	ATAC	2	8	49094	49101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016911	TTGC	2	8	49239	49246	0 %	50 %	25 %	25 %	378723434
141	NC_016911	TGTT	2	8	49608	49615	0 %	75 %	25 %	0 %	378723435
142	NC_016911	AAGT	2	8	49645	49652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016911	CTTG	2	8	50112	50119	0 %	50 %	25 %	25 %	378723436
144	NC_016911	ATCT	2	8	50691	50698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016911	TGCT	2	8	50864	50871	0 %	50 %	25 %	25 %	378723438
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