MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016911	GATA	2	8	159394	159401	50 %	25 %	25 %	0 %	378723540
4003	NC_016911	T	6	6	159416	159421	0 %	100 %	0 %	0 %	378723540
4004	NC_016911	ATA	2	6	159455	159460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723540
4005	NC_016911	TAG	2	6	159477	159482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723540
4006	NC_016911	ATTT	2	8	159531	159538	25 %	75 %	0 %	0 %	378723540
4007	NC_016911	CAA	2	6	159545	159550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723540
4008	NC_016911	TGG	2	6	159559	159564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723540
4009	NC_016911	TTA	2	6	159581	159586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723540
4010	NC_016911	GAT	2	6	159780	159785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723541
4011	NC_016911	TTTA	2	8	159848	159855	25 %	75 %	0 %	0 %	378723541
4012	NC_016911	ACTT	2	8	159944	159951	25 %	50 %	0 %	25 %	378723541
4013	NC_016911	A	6	6	159953	159958	100 %	0 %	0 %	0 %	378723541
4014	NC_016911	TA	3	6	159960	159965	50 %	50 %	0 %	0 %	378723541
4015	NC_016911	GAA	2	6	159981	159986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723541
4016	NC_016911	GGCG	2	8	159993	160000	0 %	0 %	75 %	25 %	378723541
4017	NC_016911	TAA	2	6	160010	160015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723541
4018	NC_016911	TA	3	6	160049	160054	50 %	50 %	0 %	0 %	378723541
4019	NC_016911	AAC	2	6	160073	160078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723541
4020	NC_016911	ATC	2	6	160180	160185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723541
4021	NC_016911	ACCT	2	8	160186	160193	25 %	25 %	0 %	50 %	378723541
4022	NC_016911	AT	3	6	160194	160199	50 %	50 %	0 %	0 %	378723541
4023	NC_016911	GTAAAA	2	12	160251	160262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378723541
4024	NC_016911	AACA	2	8	160270	160277	75 %	0 %	0 %	25 %	378723541
4025	NC_016911	AAG	2	6	160297	160302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723541
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4028	NC_016911	GCC	2	6	160411	160416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723542
4029	NC_016911	GAAGT	2	10	160465	160474	40 %	20 %	40 %	0 %	378723542
4030	NC_016911	TTA	2	6	160546	160551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723542
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4032	NC_016911	ACT	2	6	160600	160605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723542
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4034	NC_016911	TAT	2	6	160623	160628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723542
4035	NC_016911	ATT	2	6	160756	160761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723542
4036	NC_016911	TGA	2	6	160779	160784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723542
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4038	NC_016911	ATT	2	6	160825	160830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723542
4039	NC_016911	T	6	6	160890	160895	0 %	100 %	0 %	0 %	378723542
4040	NC_016911	GCTT	2	8	160916	160923	0 %	50 %	25 %	25 %	378723542
4041	NC_016911	AT	3	6	160971	160976	50 %	50 %	0 %	0 %	378723542
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4046	NC_016911	TAG	2	6	161174	161179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723542
4047	NC_016911	AG	4	8	161185	161192	50 %	0 %	50 %	0 %	378723542
4048	NC_016911	T	6	6	161272	161277	0 %	100 %	0 %	0 %	378723542
4049	NC_016911	ATTT	2	8	161291	161298	25 %	75 %	0 %	0 %	378723542
4050	NC_016911	AAT	2	6	161329	161334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723542
4051	NC_016911	TTG	2	6	161392	161397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016911	ATA	2	6	161448	161453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016911	AAT	2	6	161475	161480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016911	ATA	2	6	161485	161490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723543
4055	NC_016911	AGT	2	6	161529	161534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723543
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4094	NC_016911	T	8	8	163024	163031	0 %	100 %	0 %	0 %	378723546
4095	NC_016911	AT	3	6	163038	163043	50 %	50 %	0 %	0 %	378723546
4096	NC_016911	CAATAT	2	12	163129	163140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378723546
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4098	NC_016911	AT	4	8	163229	163236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016911	TAA	2	6	163284	163289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723547
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4104	NC_016911	TGG	2	6	163429	163434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723547
4105	NC_016911	AT	3	6	163440	163445	50 %	50 %	0 %	0 %	378723547
4106	NC_016911	GCT	2	6	163466	163471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723547
4107	NC_016911	ATTGAG	2	12	163481	163492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723547
4108	NC_016911	TA	3	6	163507	163512	50 %	50 %	0 %	0 %	378723547
4109	NC_016911	TA	3	6	163534	163539	50 %	50 %	0 %	0 %	378723547
4110	NC_016911	TTCG	2	8	163558	163565	0 %	50 %	25 %	25 %	378723547
4111	NC_016911	TAA	2	6	163568	163573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723547
4112	NC_016911	GGA	2	6	163582	163587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723547
4113	NC_016911	ATT	2	6	163594	163599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723547
4114	NC_016911	TAA	2	6	163602	163607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723547
4115	NC_016911	TG	3	6	163620	163625	0 %	50 %	50 %	0 %	378723547
4116	NC_016911	CTA	2	6	163634	163639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723547
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4119	NC_016911	T	6	6	163659	163664	0 %	100 %	0 %	0 %	378723547
4120	NC_016911	TA	3	6	163671	163676	50 %	50 %	0 %	0 %	378723547
4121	NC_016911	TAA	2	6	163684	163689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723547
4122	NC_016911	CTTCAT	2	12	163707	163718	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378723547
4123	NC_016911	AAATT	2	10	163721	163730	60 %	40 %	0 %	0 %	378723547
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4125	NC_016911	ATT	2	6	163735	163740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723547
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4164	NC_016911	AT	4	8	165321	165328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_016911	ATA	2	6	165348	165353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4239	NC_016911	G	6	6	168350	168355	0 %	0 %	100 %	0 %	378723551
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4247	NC_016911	AAGA	2	8	168604	168611	75 %	0 %	25 %	0 %	378723551
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