MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016911	CCA	2	6	138536	138541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723528
3502	NC_016911	TATT	2	8	138544	138551	25 %	75 %	0 %	0 %	378723528
3503	NC_016911	ATG	2	6	138581	138586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723528
3504	NC_016911	TGC	2	6	138631	138636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723528
3505	NC_016911	CTC	2	6	138696	138701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723528
3506	NC_016911	ATT	2	6	138738	138743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723528
3507	NC_016911	TGG	2	6	138789	138794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723528
3508	NC_016911	AGA	2	6	138886	138891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723528
3509	NC_016911	TAA	2	6	138943	138948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723528
3510	NC_016911	GAT	2	6	138956	138961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723528
3511	NC_016911	AGT	2	6	139144	139149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723528
3512	NC_016911	GTTA	2	8	139219	139226	25 %	50 %	25 %	0 %	378723528
3513	NC_016911	TAG	2	6	139261	139266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723528
3514	NC_016911	AGCT	2	8	139269	139276	25 %	25 %	25 %	25 %	378723528
3515	NC_016911	TGC	2	6	139282	139287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723528
3516	NC_016911	TAA	2	6	139312	139317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723528
3517	NC_016911	GCAA	2	8	139333	139340	50 %	0 %	25 %	25 %	378723528
3518	NC_016911	TGC	2	6	139378	139383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723528
3519	NC_016911	G	6	6	139390	139395	0 %	0 %	100 %	0 %	378723528
3520	NC_016911	AGG	2	6	139414	139419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723528
3521	NC_016911	GGA	2	6	139448	139453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723528
3522	NC_016911	ATA	2	6	139494	139499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723528
3523	NC_016911	TCT	2	6	139538	139543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723528
3524	NC_016911	AGT	2	6	139571	139576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723528
3525	NC_016911	TGT	2	6	139591	139596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723528
3526	NC_016911	CTC	2	6	139599	139604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723528
3527	NC_016911	CAC	2	6	139626	139631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723528
3528	NC_016911	CAC	2	6	139668	139673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723528
3529	NC_016911	ATA	2	6	139695	139700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723528
3530	NC_016911	A	6	6	139712	139717	100 %	0 %	0 %	0 %	378723528
3531	NC_016911	ATA	2	6	139725	139730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723528
3532	NC_016911	TAG	2	6	139917	139922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723528
3533	NC_016911	GGA	3	9	139928	139936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723528
3534	NC_016911	AAG	2	6	139950	139955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723528
3535	NC_016911	GAG	2	6	139956	139961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723528
3536	NC_016911	ACG	2	6	139972	139977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723528
3537	NC_016911	GCG	2	6	140016	140021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723528
3538	NC_016911	A	8	8	140031	140038	100 %	0 %	0 %	0 %	378723528
3539	NC_016911	ATA	2	6	140040	140045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723528
3540	NC_016911	TAT	2	6	140081	140086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723529
3541	NC_016911	TAGC	2	8	140110	140117	25 %	25 %	25 %	25 %	378723529
3542	NC_016911	TA	3	6	140196	140201	50 %	50 %	0 %	0 %	378723529
3543	NC_016911	GTTTT	2	10	140264	140273	0 %	80 %	20 %	0 %	378723529
3544	NC_016911	GTA	3	9	140287	140295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723529
3545	NC_016911	ATA	2	6	140359	140364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723529
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3547	NC_016911	CCT	3	9	140508	140516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723529
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3549	NC_016911	TAA	2	6	140624	140629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723529
3550	NC_016911	T	6	6	140634	140639	0 %	100 %	0 %	0 %	378723529
3551	NC_016911	TGC	2	6	140690	140695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723529
3552	NC_016911	T	6	6	140760	140765	0 %	100 %	0 %	0 %	378723529
3553	NC_016911	A	6	6	140806	140811	100 %	0 %	0 %	0 %	378723529
3554	NC_016911	TAA	2	6	140824	140829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723529
3555	NC_016911	TTG	2	6	140839	140844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723529
3556	NC_016911	GTG	2	6	140881	140886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723529
3557	NC_016911	AGC	2	6	140942	140947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723529
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3559	NC_016911	GCA	2	6	140976	140981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723529
3560	NC_016911	GATT	2	8	141056	141063	25 %	50 %	25 %	0 %	378723529
3561	NC_016911	TTA	2	6	141074	141079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723529
3562	NC_016911	CTTGG	2	10	141081	141090	0 %	40 %	40 %	20 %	378723529
3563	NC_016911	TAA	2	6	141155	141160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723529
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3565	NC_016911	TTA	2	6	141277	141282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723529
3566	NC_016911	GCA	2	6	141288	141293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723529
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3570	NC_016911	ATTC	2	8	141398	141405	25 %	50 %	0 %	25 %	378723529
3571	NC_016911	GTAT	2	8	141456	141463	25 %	50 %	25 %	0 %	378723529
3572	NC_016911	TAA	2	6	141511	141516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723529
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3574	NC_016911	TGT	2	6	141734	141739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723529
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3578	NC_016911	AGC	2	6	141899	141904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723529
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3583	NC_016911	GCA	2	6	142113	142118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723530
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3587	NC_016911	TAATGC	2	12	142220	142231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378723530
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3589	NC_016911	TAG	2	6	142327	142332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723530
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3591	NC_016911	TA	3	6	142389	142394	50 %	50 %	0 %	0 %	378723530
3592	NC_016911	AAT	2	6	142482	142487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723530
3593	NC_016911	TC	3	6	142495	142500	0 %	50 %	0 %	50 %	378723530
3594	NC_016911	TAA	2	6	142501	142506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723530
3595	NC_016911	A	6	6	142514	142519	100 %	0 %	0 %	0 %	378723530
3596	NC_016911	AATG	2	8	142521	142528	50 %	25 %	25 %	0 %	378723530
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3602	NC_016911	TCC	2	6	142997	143002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723530
3603	NC_016911	AAAGAT	2	12	143043	143054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378723530
3604	NC_016911	CGG	2	6	143131	143136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723530
3605	NC_016911	AGG	2	6	143144	143149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723530
3606	NC_016911	AT	3	6	143169	143174	50 %	50 %	0 %	0 %	378723530
3607	NC_016911	ATGA	2	8	143178	143185	50 %	25 %	25 %	0 %	378723530
3608	NC_016911	TTG	2	6	143236	143241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723530
3609	NC_016911	TAAAGA	2	12	143267	143278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378723530
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3611	NC_016911	TA	4	8	143300	143307	50 %	50 %	0 %	0 %	378723530
3612	NC_016911	TAG	2	6	143378	143383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723530
3613	NC_016911	GGA	2	6	143394	143399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723530
3614	NC_016911	TGA	2	6	143465	143470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723530
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3617	NC_016911	TAA	2	6	143633	143638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723530
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3620	NC_016911	TGA	2	6	143869	143874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723530
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