MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016911	AGT	2	6	40296	40301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016911	AGC	2	6	40392	40397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016911	TTG	2	6	40433	40438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016911	TTG	2	6	40464	40469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016911	TA	3	6	40496	40501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016911	TAA	2	6	40560	40565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016911	AT	3	6	40620	40625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016911	CTTG	2	8	40700	40707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_016911	CTGA	2	8	40708	40715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_016911	TAT	2	6	40745	40750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016911	AAT	2	6	40801	40806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016911	T	6	6	40864	40869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016911	TA	5	10	40874	40883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016911	ATTG	2	8	40886	40893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016911	ATCTTT	2	12	40972	40983	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1016	NC_016911	TAA	2	6	41008	41013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016911	CTTTT	2	10	41014	41023	0 %	80 %	0 %	20 %	378723424
1018	NC_016911	TAAA	2	8	41042	41049	75 %	25 %	0 %	0 %	378723424
1019	NC_016911	T	6	6	41091	41096	0 %	100 %	0 %	0 %	378723424
1020	NC_016911	AGA	2	6	41134	41139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723424
1021	NC_016911	ATTT	2	8	41147	41154	25 %	75 %	0 %	0 %	378723424
1022	NC_016911	T	6	6	41187	41192	0 %	100 %	0 %	0 %	378723424
1023	NC_016911	TCT	2	6	41230	41235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723424
1024	NC_016911	TAA	2	6	41245	41250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723424
1025	NC_016911	ATTA	2	8	41313	41320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016911	TA	3	6	41326	41331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016911	CTT	2	6	41363	41368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_016911	ATTA	2	8	41370	41377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016911	AT	3	6	41395	41400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016911	TTATT	2	10	41423	41432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016911	ATC	2	6	41457	41462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_016911	TGCT	3	12	41493	41504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_016911	TTTTA	2	10	41527	41536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016911	TCA	2	6	41585	41590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016911	ATT	2	6	41614	41619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016911	GCTT	2	8	41620	41627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_016911	ACT	2	6	41640	41645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016911	TTTA	2	8	41660	41667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016911	T	6	6	41761	41766	0 %	100 %	0 %	0 %	378723425
1040	NC_016911	TAG	2	6	41783	41788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723425
1041	NC_016911	T	6	6	41804	41809	0 %	100 %	0 %	0 %	378723425
1042	NC_016911	TAG	2	6	41828	41833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723425
1043	NC_016911	AGC	2	6	41850	41855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723425
1044	NC_016911	T	6	6	41893	41898	0 %	100 %	0 %	0 %	378723425
1045	NC_016911	T	7	7	41939	41945	0 %	100 %	0 %	0 %	378723425
1046	NC_016911	TCT	2	6	42024	42029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_016911	TTA	2	6	42057	42062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016911	AAT	2	6	42071	42076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016911	ATTA	2	8	42101	42108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016911	TCT	2	6	42173	42178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_016911	T	6	6	42178	42183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016911	CAT	2	6	42187	42192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_016911	ATT	2	6	42229	42234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016911	AGTTG	2	10	42275	42284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016911	TTG	3	9	42287	42295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016911	CTA	2	6	42322	42327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_016911	T	6	6	42344	42349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016911	TAAT	2	8	42394	42401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016911	GTT	2	6	42412	42417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016911	T	6	6	42416	42421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016911	TAA	2	6	42425	42430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016911	A	6	6	42440	42445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016911	TAA	2	6	42458	42463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016911	ATTA	2	8	42464	42471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016911	GAT	2	6	42525	42530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016911	AT	3	6	42540	42545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016911	TAT	2	6	42561	42566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016911	AAAT	2	8	42567	42574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016911	TAA	2	6	42577	42582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016911	ATA	2	6	42601	42606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723426
1071	NC_016911	TAT	2	6	42620	42625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723426
1072	NC_016911	ATA	2	6	42660	42665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723426
1073	NC_016911	TTC	2	6	42683	42688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723426
1074	NC_016911	TAG	2	6	42725	42730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723426
1075	NC_016911	AAG	2	6	42772	42777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723426
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1077	NC_016911	ATTT	2	8	42822	42829	25 %	75 %	0 %	0 %	378723426
1078	NC_016911	TAC	2	6	42833	42838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723426
1079	NC_016911	AGA	2	6	42875	42880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723426
1080	NC_016911	TAT	2	6	42881	42886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723426
1081	NC_016911	GAA	2	6	42896	42901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723426
1082	NC_016911	AGT	2	6	42920	42925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723426
1083	NC_016911	TTA	2	6	42928	42933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723426
1084	NC_016911	A	7	7	42968	42974	100 %	0 %	0 %	0 %	378723426
1085	NC_016911	A	6	6	42982	42987	100 %	0 %	0 %	0 %	378723426
1086	NC_016911	GAT	2	6	42990	42995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723426
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1088	NC_016911	ACAA	2	8	43089	43096	75 %	0 %	0 %	25 %	378723426
1089	NC_016911	ACA	2	6	43106	43111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723426
1090	NC_016911	ATT	2	6	43159	43164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723426
1091	NC_016911	TGA	2	6	43219	43224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723427
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1097	NC_016911	TAT	2	6	43488	43493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723427
1098	NC_016911	GAA	2	6	43506	43511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723427
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1100	NC_016911	AT	3	6	43546	43551	50 %	50 %	0 %	0 %	378723427
1101	NC_016911	GTT	2	6	43568	43573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723427
1102	NC_016911	T	6	6	43583	43588	0 %	100 %	0 %	0 %	378723427
1103	NC_016911	A	6	6	43594	43599	100 %	0 %	0 %	0 %	378723427
1104	NC_016911	CTT	2	6	43653	43658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723427
1105	NC_016911	GT	3	6	43661	43666	0 %	50 %	50 %	0 %	378723427
1106	NC_016911	TA	3	6	43786	43791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016911	AT	3	6	43792	43797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016911	ATT	2	6	43812	43817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016911	AAT	2	6	43832	43837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723428
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1111	NC_016911	TAT	2	6	43868	43873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723428
1112	NC_016911	TTA	2	6	43939	43944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723428
1113	NC_016911	T	6	6	43964	43969	0 %	100 %	0 %	0 %	378723428
1114	NC_016911	AT	3	6	43976	43981	50 %	50 %	0 %	0 %	378723428
1115	NC_016911	AT	3	6	44000	44005	50 %	50 %	0 %	0 %	378723428
1116	NC_016911	ATT	2	6	44028	44033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723428
1117	NC_016911	TTA	2	6	44145	44150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723428
1118	NC_016911	TAC	2	6	44168	44173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723428
1119	NC_016911	T	6	6	44190	44195	0 %	100 %	0 %	0 %	378723428
1120	NC_016911	GTA	2	6	44253	44258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723428
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1122	NC_016911	ATT	2	6	44311	44316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723428
1123	NC_016911	AAT	2	6	44400	44405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723428
1124	NC_016911	CT	3	6	44414	44419	0 %	50 %	0 %	50 %	378723428
1125	NC_016911	GAT	2	6	44442	44447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723428
1126	NC_016911	GAT	2	6	44493	44498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723428
1127	NC_016911	ATT	2	6	44541	44546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016911	GAC	2	6	44595	44600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016911	TACC	2	8	44647	44654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_016911	AAAC	2	8	44655	44662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_016911	TAAT	2	8	44731	44738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016911	ATTT	2	8	44758	44765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016911	ATTA	2	8	44766	44773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016911	CGT	2	6	44779	44784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_016911	AAAT	2	8	44785	44792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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