MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016911	AT	3	6	19829	19834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016911	AAAC	2	8	19861	19868	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_016911	A	6	6	19871	19876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016911	A	7	7	19879	19885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016911	TTG	2	6	19886	19891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016911	AAT	2	6	19926	19931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016911	TAAA	2	8	19936	19943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016911	ATT	2	6	19968	19973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016911	AT	3	6	20114	20119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016911	TTAT	2	8	20134	20141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016911	TTTAA	2	10	20161	20170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016911	AAC	2	6	20202	20207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723403
513	NC_016911	A	7	7	20215	20221	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
514	NC_016911	AAG	2	6	20301	20306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
515	NC_016911	TAA	2	6	20326	20331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
516	NC_016911	TTG	2	6	20333	20338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723403
517	NC_016911	GCA	2	6	20386	20391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723403
518	NC_016911	GTA	2	6	20535	20540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723403
519	NC_016911	A	6	6	20607	20612	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
520	NC_016911	TAA	2	6	20679	20684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
521	NC_016911	TAC	2	6	20749	20754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723403
522	NC_016911	TAC	2	6	20776	20781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723403
523	NC_016911	CAT	2	6	20796	20801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723403
524	NC_016911	ACC	2	6	20869	20874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723403
525	NC_016911	GCA	2	6	20891	20896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723403
526	NC_016911	CAA	2	6	20927	20932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723403
527	NC_016911	TCC	2	6	20971	20976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723403
528	NC_016911	A	7	7	21004	21010	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
529	NC_016911	GTAA	2	8	21038	21045	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
530	NC_016911	GAT	2	6	21064	21069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723403
531	NC_016911	A	6	6	21119	21124	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
532	NC_016911	A	6	6	21171	21176	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
533	NC_016911	TCAAG	2	10	21189	21198	40 %	20 %	20 %	20 %	378723403
534	NC_016911	ATAAA	2	10	21243	21252	80 %	20 %	0 %	0 %	378723403
535	NC_016911	AGAT	2	8	21292	21299	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
536	NC_016911	A	6	6	21315	21320	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
537	NC_016911	AGCA	2	8	21411	21418	50 %	0 %	25 %	25 %	378723403
538	NC_016911	TAA	2	6	21448	21453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
539	NC_016911	AAAT	2	8	21454	21461	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
540	NC_016911	AGAAA	2	10	21505	21514	80 %	0 %	20 %	0 %	378723403
541	NC_016911	A	6	6	21512	21517	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
542	NC_016911	AAG	2	6	21519	21524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
543	NC_016911	GCT	2	6	21599	21604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723403
544	NC_016911	AGA	2	6	21613	21618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
545	NC_016911	AATG	2	8	21655	21662	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
546	NC_016911	TTA	2	6	21704	21709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723403
547	NC_016911	TGT	2	6	21715	21720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723403
548	NC_016911	AAAGC	2	10	21761	21770	60 %	0 %	20 %	20 %	378723403
549	NC_016911	AAC	2	6	21813	21818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723403
550	NC_016911	CAG	2	6	21857	21862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723403
551	NC_016911	ATTA	2	8	21956	21963	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
552	NC_016911	GAATA	2	10	21967	21976	60 %	20 %	20 %	0 %	378723403
553	NC_016911	ATAG	2	8	22004	22011	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
554	NC_016911	ATAG	2	8	22016	22023	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
555	NC_016911	TAT	2	6	22245	22250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723403
556	NC_016911	ATC	2	6	22279	22284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723403
557	NC_016911	GAA	2	6	22292	22297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
558	NC_016911	ACA	2	6	22347	22352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723403
559	NC_016911	TTC	2	6	22375	22380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723403
560	NC_016911	TAA	2	6	22393	22398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
561	NC_016911	ATTTAG	2	12	22413	22424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378723403
562	NC_016911	CGTT	2	8	22434	22441	0 %	50 %	25 %	25 %	378723403
563	NC_016911	TAA	2	6	22488	22493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
564	NC_016911	AAT	2	6	22541	22546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
565	NC_016911	ACA	2	6	22570	22575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723403
566	NC_016911	A	6	6	22587	22592	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
567	NC_016911	GAT	2	6	22619	22624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723403
568	NC_016911	GAA	2	6	22667	22672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
569	NC_016911	A	6	6	22697	22702	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
570	NC_016911	TAATA	2	10	22708	22717	60 %	40 %	0 %	0 %	378723403
571	NC_016911	AG	3	6	22719	22724	50 %	0 %	50 %	0 %	378723403
572	NC_016911	CA	3	6	22751	22756	50 %	0 %	0 %	50 %	378723403
573	NC_016911	ATT	2	6	22758	22763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723403
574	NC_016911	CAAAG	2	10	22800	22809	60 %	0 %	20 %	20 %	378723403
575	NC_016911	TAGT	2	8	22881	22888	25 %	50 %	25 %	0 %	378723403
576	NC_016911	A	6	6	22897	22902	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
577	NC_016911	AAC	2	6	22954	22959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723403
578	NC_016911	TTAGT	2	10	22983	22992	20 %	60 %	20 %	0 %	378723403
579	NC_016911	TC	3	6	23034	23039	0 %	50 %	0 %	50 %	378723403
580	NC_016911	CAG	2	6	23048	23053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723403
581	NC_016911	A	8	8	23103	23110	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
582	NC_016911	AGCAG	2	10	23126	23135	40 %	0 %	40 %	20 %	378723403
583	NC_016911	ATA	2	6	23148	23153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
584	NC_016911	A	6	6	23236	23241	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
585	NC_016911	TA	3	6	23277	23282	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
586	NC_016911	CAA	2	6	23297	23302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723403
587	NC_016911	TAA	2	6	23328	23333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
588	NC_016911	CTA	2	6	23409	23414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723403
589	NC_016911	TA	3	6	23413	23418	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
590	NC_016911	TGA	2	6	23431	23436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723403
591	NC_016911	AT	3	6	23456	23461	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
592	NC_016911	ATT	2	6	23527	23532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723403
593	NC_016911	ATTTAG	2	12	23565	23576	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378723403
594	NC_016911	AAGC	2	8	23621	23628	50 %	0 %	25 %	25 %	378723403
595	NC_016911	TGA	2	6	23812	23817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723403
596	NC_016911	GTG	2	6	23835	23840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723403
597	NC_016911	TAAA	2	8	23946	23953	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
598	NC_016911	ATG	2	6	24060	24065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723403
599	NC_016911	AGT	2	6	24071	24076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723403
600	NC_016911	TGT	2	6	24082	24087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723403
601	NC_016911	TAA	2	6	24118	24123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
602	NC_016911	TA	3	6	24140	24145	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
603	NC_016911	AGA	2	6	24175	24180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
604	NC_016911	AAG	2	6	24225	24230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
605	NC_016911	TA	3	6	24239	24244	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
606	NC_016911	A	6	6	24279	24284	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
607	NC_016911	TAA	2	6	24294	24299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
608	NC_016911	ATG	2	6	24318	24323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723403
609	NC_016911	A	6	6	24324	24329	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
610	NC_016911	TTC	2	6	24331	24336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723403
611	NC_016911	GAA	2	6	24347	24352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
612	NC_016911	TACCT	2	10	24418	24427	20 %	40 %	0 %	40 %	378723403
613	NC_016911	GAA	2	6	24437	24442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
614	NC_016911	AAG	2	6	24444	24449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
615	NC_016911	AAGT	2	8	24456	24463	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
616	NC_016911	TACCT	2	10	24505	24514	20 %	40 %	0 %	40 %	378723403
617	NC_016911	GAA	2	6	24524	24529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
618	NC_016911	AAG	2	6	24531	24536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
619	NC_016911	AAGT	2	8	24543	24550	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
620	NC_016911	GCATTA	2	12	24596	24607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378723403
621	NC_016911	GAA	2	6	24659	24664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
622	NC_016911	GAA	3	9	24689	24697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723403
623	NC_016911	TCCGAT	2	12	24713	24724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378723403
624	NC_016911	A	7	7	24781	24787	100 %	0 %	0 %	0 %	378723403
625	NC_016911	AAATGC	2	12	24789	24800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378723403
626	NC_016911	GTT	2	6	24839	24844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723403
627	NC_016911	ATA	2	6	24858	24863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
628	NC_016911	TAA	2	6	24895	24900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
629	NC_016911	TGA	2	6	24919	24924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723403
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631	NC_016911	TAA	2	6	24976	24981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723403
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