MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016911	TGC	2	6	239557	239562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723618
6002	NC_016911	TTGCT	2	10	239585	239594	0 %	60 %	20 %	20 %	378723618
6003	NC_016911	CGAA	2	8	239689	239696	50 %	0 %	25 %	25 %	378723618
6004	NC_016911	TCA	2	6	239736	239741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723618
6005	NC_016911	CTA	2	6	239794	239799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723618
6006	NC_016911	TTAG	2	8	239802	239809	25 %	50 %	25 %	0 %	378723618
6007	NC_016911	ATG	2	6	239861	239866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723618
6008	NC_016911	CAC	2	6	239911	239916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723618
6009	NC_016911	TGTA	2	8	239951	239958	25 %	50 %	25 %	0 %	378723618
6010	NC_016911	CTTCTA	2	12	239974	239985	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378723618
6011	NC_016911	T	7	7	240004	240010	0 %	100 %	0 %	0 %	378723618
6012	NC_016911	AGA	2	6	240017	240022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723618
6013	NC_016911	TTA	2	6	240045	240050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723618
6014	NC_016911	TA	3	6	240049	240054	50 %	50 %	0 %	0 %	378723618
6015	NC_016911	T	6	6	240060	240065	0 %	100 %	0 %	0 %	378723618
6016	NC_016911	TCT	2	6	240195	240200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723618
6017	NC_016911	T	6	6	240249	240254	0 %	100 %	0 %	0 %	378723618
6018	NC_016911	AGA	2	6	240359	240364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723618
6019	NC_016911	ATT	3	9	240368	240376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723618
6020	NC_016911	T	7	7	240386	240392	0 %	100 %	0 %	0 %	378723618
6021	NC_016911	TCA	2	6	240396	240401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723618
6022	NC_016911	ATT	2	6	240408	240413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723618
6023	NC_016911	TAT	3	9	240439	240447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723618
6024	NC_016911	A	6	6	240461	240466	100 %	0 %	0 %	0 %	378723618
6025	NC_016911	TA	3	6	240514	240519	50 %	50 %	0 %	0 %	378723618
6026	NC_016911	CAA	2	6	240526	240531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723618
6027	NC_016911	AAAT	2	8	240548	240555	75 %	25 %	0 %	0 %	378723618
6028	NC_016911	T	7	7	240562	240568	0 %	100 %	0 %	0 %	378723618
6029	NC_016911	TCT	2	6	240573	240578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723618
6030	NC_016911	ATT	2	6	240584	240589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016911	GTT	2	6	240604	240609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016911	TTC	2	6	240661	240666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_016911	TTA	2	6	240713	240718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016911	TA	3	6	240746	240751	50 %	50 %	0 %	0 %	378723619
6035	NC_016911	T	6	6	240766	240771	0 %	100 %	0 %	0 %	378723619
6036	NC_016911	TAA	2	6	240791	240796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723619
6037	NC_016911	T	6	6	240807	240812	0 %	100 %	0 %	0 %	378723619
6038	NC_016911	ATT	2	6	240848	240853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723619
6039	NC_016911	AT	3	6	240877	240882	50 %	50 %	0 %	0 %	378723619
6040	NC_016911	T	6	6	240914	240919	0 %	100 %	0 %	0 %	378723619
6041	NC_016911	TA	3	6	241204	241209	50 %	50 %	0 %	0 %	378723619
6042	NC_016911	TGC	2	6	241214	241219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723619
6043	NC_016911	TTC	2	6	241226	241231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723619
6044	NC_016911	CTAC	2	8	241293	241300	25 %	25 %	0 %	50 %	378723619
6045	NC_016911	ATAA	2	8	241311	241318	75 %	25 %	0 %	0 %	378723619
6046	NC_016911	AAT	2	6	241421	241426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723619
6047	NC_016911	TAG	2	6	241465	241470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723619
6048	NC_016911	TTCT	2	8	241619	241626	0 %	75 %	0 %	25 %	378723619
6049	NC_016911	TTTA	2	8	241649	241656	25 %	75 %	0 %	0 %	378723619
6050	NC_016911	T	6	6	241673	241678	0 %	100 %	0 %	0 %	378723619
6051	NC_016911	A	6	6	241687	241692	100 %	0 %	0 %	0 %	378723619
6052	NC_016911	CTT	2	6	241789	241794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723619
6053	NC_016911	TAG	3	9	241882	241890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723619
6054	NC_016911	CTA	2	6	241894	241899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723619
6055	NC_016911	GCT	2	6	241912	241917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723619
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6057	NC_016911	TC	3	6	241954	241959	0 %	50 %	0 %	50 %	378723619
6058	NC_016911	TCA	2	6	241980	241985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723619
6059	NC_016911	TTC	2	6	241997	242002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723619
6060	NC_016911	ATT	2	6	242150	242155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723619
6061	NC_016911	GTT	3	9	242198	242206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723619
6062	NC_016911	TAT	2	6	242218	242223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016911	CAA	2	6	242284	242289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723620
6064	NC_016911	TGC	2	6	242296	242301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723620
6065	NC_016911	TCC	2	6	242351	242356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723620
6066	NC_016911	TTTC	2	8	242397	242404	0 %	75 %	0 %	25 %	378723620
6067	NC_016911	TAA	2	6	242469	242474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723620
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6069	NC_016911	T	7	7	242500	242506	0 %	100 %	0 %	0 %	378723620
6070	NC_016911	TCA	2	6	242558	242563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723620
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6072	NC_016911	CAAA	2	8	242592	242599	75 %	0 %	0 %	25 %	378723620
6073	NC_016911	CCG	2	6	242636	242641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723620
6074	NC_016911	TGC	2	6	242659	242664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723620
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6076	NC_016911	TAG	2	6	242682	242687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723620
6077	NC_016911	ATCTCA	2	12	242741	242752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723620
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6083	NC_016911	AGT	2	6	242873	242878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723620
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6089	NC_016911	TTC	2	6	243031	243036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723620
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6096	NC_016911	TTA	2	6	243212	243217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723620
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6105	NC_016911	TGC	2	6	243563	243568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723620
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6110	NC_016911	T	6	6	243686	243691	0 %	100 %	0 %	0 %	378723620
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6120	NC_016911	TGG	2	6	243927	243932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723621
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