MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016911	ATT	2	6	219061	219066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723595
5502	NC_016911	TAA	2	6	219088	219093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723595
5503	NC_016911	AAAAGC	2	12	219121	219132	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378723595
5504	NC_016911	T	6	6	219170	219175	0 %	100 %	0 %	0 %	378723595
5505	NC_016911	AGTA	2	8	219181	219188	50 %	25 %	25 %	0 %	378723595
5506	NC_016911	GTTT	2	8	219189	219196	0 %	75 %	25 %	0 %	378723595
5507	NC_016911	TAG	2	6	219202	219207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723595
5508	NC_016911	TAA	2	6	219228	219233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723595
5509	NC_016911	AT	3	6	219418	219423	50 %	50 %	0 %	0 %	378723595
5510	NC_016911	ATA	2	6	219443	219448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723595
5511	NC_016911	TGG	2	6	219514	219519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723595
5512	NC_016911	TAG	2	6	219528	219533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723595
5513	NC_016911	AAAT	2	8	219589	219596	75 %	25 %	0 %	0 %	378723595
5514	NC_016911	TTC	2	6	219615	219620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723595
5515	NC_016911	TAT	2	6	219634	219639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723595
5516	NC_016911	CAG	2	6	219641	219646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723595
5517	NC_016911	AG	3	6	219711	219716	50 %	0 %	50 %	0 %	378723595
5518	NC_016911	AGC	2	6	219739	219744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723595
5519	NC_016911	AAGT	2	8	219763	219770	50 %	25 %	25 %	0 %	378723595
5520	NC_016911	AAAT	2	8	219843	219850	75 %	25 %	0 %	0 %	378723595
5521	NC_016911	GAA	2	6	219860	219865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723595
5522	NC_016911	GAA	2	6	219893	219898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723595
5523	NC_016911	AAG	2	6	219900	219905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723595
5524	NC_016911	TAA	2	6	219928	219933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723595
5525	NC_016911	GGA	2	6	219971	219976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723595
5526	NC_016911	TA	3	6	219977	219982	50 %	50 %	0 %	0 %	378723595
5527	NC_016911	TTTA	3	12	220052	220063	25 %	75 %	0 %	0 %	378723596
5528	NC_016911	T	7	7	220101	220107	0 %	100 %	0 %	0 %	378723596
5529	NC_016911	AT	3	6	220270	220275	50 %	50 %	0 %	0 %	378723596
5530	NC_016911	CAT	2	6	220278	220283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723596
5531	NC_016911	ATT	2	6	220366	220371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723596
5532	NC_016911	AAT	2	6	220378	220383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723596
5533	NC_016911	GT	3	6	220478	220483	0 %	50 %	50 %	0 %	378723596
5534	NC_016911	AAGGC	2	10	220486	220495	40 %	0 %	40 %	20 %	378723596
5535	NC_016911	TGC	2	6	220522	220527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723597
5536	NC_016911	TTTCTT	2	12	220571	220582	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378723597
5537	NC_016911	TTTTCT	2	12	220591	220602	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378723597
5538	NC_016911	AT	3	6	220604	220609	50 %	50 %	0 %	0 %	378723597
5539	NC_016911	TCA	2	6	220667	220672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723597
5540	NC_016911	TGC	2	6	220703	220708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723597
5541	NC_016911	CT	3	6	220731	220736	0 %	50 %	0 %	50 %	378723597
5542	NC_016911	TAT	2	6	220760	220765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723597
5543	NC_016911	T	6	6	220767	220772	0 %	100 %	0 %	0 %	378723597
5544	NC_016911	AT	3	6	220790	220795	50 %	50 %	0 %	0 %	378723598
5545	NC_016911	ATC	2	6	220861	220866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723598
5546	NC_016911	ATG	2	6	220906	220911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723598
5547	NC_016911	A	6	6	221006	221011	100 %	0 %	0 %	0 %	378723598
5548	NC_016911	TAA	2	6	221050	221055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723598
5549	NC_016911	AATA	2	8	221078	221085	75 %	25 %	0 %	0 %	378723598
5550	NC_016911	ATT	2	6	221112	221117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723598
5551	NC_016911	GGT	2	6	221131	221136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723598
5552	NC_016911	A	6	6	221255	221260	100 %	0 %	0 %	0 %	378723598
5553	NC_016911	AAT	3	9	221262	221270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723598
5554	NC_016911	AGA	2	6	221300	221305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723598
5555	NC_016911	TCA	2	6	221325	221330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723598
5556	NC_016911	TAT	2	6	221354	221359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723598
5557	NC_016911	GGAG	2	8	221369	221376	25 %	0 %	75 %	0 %	378723598
5558	NC_016911	ATG	2	6	221386	221391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723598
5559	NC_016911	CTT	2	6	221400	221405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723598
5560	NC_016911	AT	3	6	221446	221451	50 %	50 %	0 %	0 %	378723598
5561	NC_016911	CAG	2	6	221464	221469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723598
5562	NC_016911	GTT	2	6	221495	221500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723598
5563	NC_016911	GCT	2	6	221590	221595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_016911	TA	3	6	221698	221703	50 %	50 %	0 %	0 %	378723599
5565	NC_016911	AAT	2	6	221716	221721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723599
5566	NC_016911	AAATTA	2	12	221750	221761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723599
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5570	NC_016911	AGT	2	6	221815	221820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723599
5571	NC_016911	ATT	2	6	221830	221835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723599
5572	NC_016911	TATT	2	8	221841	221848	25 %	75 %	0 %	0 %	378723599
5573	NC_016911	TTG	2	6	221887	221892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_016911	TG	3	6	221891	221896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_016911	TAT	2	6	221962	221967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_016911	CAA	2	6	222033	222038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_016911	AAT	2	6	222050	222055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_016911	CTA	2	6	222080	222085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_016911	TAT	2	6	222091	222096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_016911	TTA	2	6	222105	222110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723600
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5583	NC_016911	TCC	2	6	222177	222182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723600
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5589	NC_016911	CTA	2	6	222365	222370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723600
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5591	NC_016911	TAAT	2	8	222389	222396	50 %	50 %	0 %	0 %	378723600
5592	NC_016911	TAA	2	6	222407	222412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723600
5593	NC_016911	AG	3	6	222455	222460	50 %	0 %	50 %	0 %	378723600
5594	NC_016911	ACC	2	6	222468	222473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723600
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5596	NC_016911	CT	3	6	222600	222605	0 %	50 %	0 %	50 %	378723600
5597	NC_016911	TA	3	6	222624	222629	50 %	50 %	0 %	0 %	378723600
5598	NC_016911	CAT	2	6	222692	222697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723600
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5602	NC_016911	ATT	3	9	222819	222827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723600
5603	NC_016911	T	6	6	222826	222831	0 %	100 %	0 %	0 %	378723600
5604	NC_016911	TTG	2	6	222936	222941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723600
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5608	NC_016911	GAAT	2	8	223304	223311	50 %	25 %	25 %	0 %	378723600
5609	NC_016911	AT	3	6	223361	223366	50 %	50 %	0 %	0 %	378723600
5610	NC_016911	T	6	6	223385	223390	0 %	100 %	0 %	0 %	378723600
5611	NC_016911	CTT	2	6	223394	223399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723600
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5621	NC_016911	TAT	2	6	223655	223660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723600
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5624	NC_016911	CAA	2	6	223706	223711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723600
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5655	NC_016911	T	6	6	225286	225291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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