MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016911	T	7	7	199267	199273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016911	ATT	2	6	199274	199279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016911	T	6	6	199278	199283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016911	ATG	2	6	199316	199321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016911	A	6	6	199471	199476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016911	TCT	2	6	199528	199533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723575
5007	NC_016911	TAAAG	2	10	199585	199594	60 %	20 %	20 %	0 %	378723575
5008	NC_016911	ATA	2	6	199601	199606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723575
5009	NC_016911	AG	3	6	199709	199714	50 %	0 %	50 %	0 %	378723575
5010	NC_016911	AAAG	2	8	199721	199728	75 %	0 %	25 %	0 %	378723575
5011	NC_016911	A	6	6	199792	199797	100 %	0 %	0 %	0 %	378723575
5012	NC_016911	AAAG	2	8	199873	199880	75 %	0 %	25 %	0 %	378723575
5013	NC_016911	ATA	2	6	199959	199964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723575
5014	NC_016911	GCT	2	6	200105	200110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723575
5015	NC_016911	TA	3	6	200145	200150	50 %	50 %	0 %	0 %	378723575
5016	NC_016911	T	6	6	200192	200197	0 %	100 %	0 %	0 %	378723575
5017	NC_016911	GGC	2	6	200200	200205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723575
5018	NC_016911	ATA	2	6	200260	200265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016911	T	6	6	200287	200292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016911	ATTA	2	8	200301	200308	50 %	50 %	0 %	0 %	378723576
5021	NC_016911	ATT	2	6	200427	200432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723576
5022	NC_016911	CCA	2	6	200478	200483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723576
5023	NC_016911	CTT	2	6	200514	200519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723576
5024	NC_016911	T	6	6	200555	200560	0 %	100 %	0 %	0 %	378723576
5025	NC_016911	AGCA	2	8	200576	200583	50 %	0 %	25 %	25 %	378723576
5026	NC_016911	CAG	2	6	200587	200592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723576
5027	NC_016911	T	6	6	200609	200614	0 %	100 %	0 %	0 %	378723576
5028	NC_016911	ATC	2	6	200651	200656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723576
5029	NC_016911	CTT	2	6	200671	200676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723576
5030	NC_016911	TAT	2	6	200809	200814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723576
5031	NC_016911	TAAT	3	12	200826	200837	50 %	50 %	0 %	0 %	378723576
5032	NC_016911	GAT	2	6	200867	200872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723576
5033	NC_016911	ATC	2	6	200903	200908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723576
5034	NC_016911	ATT	2	6	200912	200917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723576
5035	NC_016911	TGC	2	6	200933	200938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723576
5036	NC_016911	TC	3	6	200966	200971	0 %	50 %	0 %	50 %	378723576
5037	NC_016911	TAA	2	6	201044	201049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_016911	AGTA	2	8	201056	201063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016911	TTA	2	6	201147	201152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016911	ACG	2	6	201154	201159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_016911	T	6	6	201215	201220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016911	TAA	2	6	201230	201235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016911	A	6	6	201266	201271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016911	GCA	2	6	201283	201288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_016911	A	6	6	201288	201293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016911	ATA	2	6	201332	201337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723577
5047	NC_016911	TATT	2	8	201365	201372	25 %	75 %	0 %	0 %	378723577
5048	NC_016911	AAG	2	6	201410	201415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723577
5049	NC_016911	TTA	2	6	201421	201426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
5050	NC_016911	TTA	2	6	201452	201457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
5051	NC_016911	TTA	2	6	201472	201477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
5052	NC_016911	TTA	2	6	201505	201510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
5053	NC_016911	T	6	6	201584	201589	0 %	100 %	0 %	0 %	378723577
5054	NC_016911	TTA	2	6	201616	201621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
5055	NC_016911	ATA	2	6	201629	201634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723577
5056	NC_016911	CGG	2	6	201639	201644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723577
5057	NC_016911	TGT	2	6	201705	201710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723577
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5059	NC_016911	T	7	7	201812	201818	0 %	100 %	0 %	0 %	378723578
5060	NC_016911	ATTA	2	8	201845	201852	50 %	50 %	0 %	0 %	378723578
5061	NC_016911	TTC	2	6	201896	201901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723578
5062	NC_016911	ATT	2	6	201926	201931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723578
5063	NC_016911	T	6	6	201941	201946	0 %	100 %	0 %	0 %	378723578
5064	NC_016911	ATA	2	6	201966	201971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723578
5065	NC_016911	TTC	2	6	201995	202000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723578
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5068	NC_016911	TAT	2	6	202135	202140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723578
5069	NC_016911	TA	3	6	202150	202155	50 %	50 %	0 %	0 %	378723578
5070	NC_016911	AT	3	6	202197	202202	50 %	50 %	0 %	0 %	378723578
5071	NC_016911	T	6	6	202293	202298	0 %	100 %	0 %	0 %	378723578
5072	NC_016911	T	6	6	202307	202312	0 %	100 %	0 %	0 %	378723578
5073	NC_016911	ATA	2	6	202338	202343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723578
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5075	NC_016911	TC	3	6	202363	202368	0 %	50 %	0 %	50 %	378723578
5076	NC_016911	AGG	2	6	202388	202393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723578
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5079	NC_016911	T	8	8	202436	202443	0 %	100 %	0 %	0 %	378723578
5080	NC_016911	AAT	2	6	202496	202501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_016911	TTG	2	6	202548	202553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_016911	GTA	2	6	202589	202594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_016911	CAA	2	6	202678	202683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_016911	GCT	2	6	202692	202697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5091	NC_016911	TTTA	2	8	203113	203120	25 %	75 %	0 %	0 %	378723579
5092	NC_016911	AAT	2	6	203129	203134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723579
5093	NC_016911	CATT	2	8	203171	203178	25 %	50 %	0 %	25 %	378723579
5094	NC_016911	TGC	2	6	203179	203184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723579
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5096	NC_016911	CAT	2	6	203232	203237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723579
5097	NC_016911	TCA	2	6	203324	203329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723579
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5099	NC_016911	CTT	3	9	203382	203390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723579
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5101	NC_016911	ATT	2	6	203447	203452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723579
5102	NC_016911	CAAG	2	8	203466	203473	50 %	0 %	25 %	25 %	378723579
5103	NC_016911	ATG	2	6	203510	203515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723579
5104	NC_016911	GAATT	2	10	203520	203529	40 %	40 %	20 %	0 %	378723579
5105	NC_016911	CGC	2	6	203565	203570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723579
5106	NC_016911	T	6	6	203663	203668	0 %	100 %	0 %	0 %	378723579
5107	NC_016911	GCT	2	6	203678	203683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723579
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5109	NC_016911	TGAT	2	8	203770	203777	25 %	50 %	25 %	0 %	378723579
5110	NC_016911	AAT	2	6	203934	203939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723579
5111	NC_016911	ATTT	3	12	203961	203972	25 %	75 %	0 %	0 %	378723579
5112	NC_016911	AAGCCC	2	12	203980	203991	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378723579
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5115	NC_016911	TAC	2	6	204099	204104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723579
5116	NC_016911	A	6	6	204111	204116	100 %	0 %	0 %	0 %	378723579
5117	NC_016911	AT	3	6	204191	204196	50 %	50 %	0 %	0 %	378723579
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5119	NC_016911	TAAA	2	8	204386	204393	75 %	25 %	0 %	0 %	378723580
5120	NC_016911	ATA	2	6	204406	204411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723580
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5122	NC_016911	ATT	2	6	204495	204500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723580
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5126	NC_016911	ATA	2	6	204589	204594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723580
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