MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 32287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016911	CTA	2	6	178532	178537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723562
4502	NC_016911	A	6	6	178537	178542	100 %	0 %	0 %	0 %	378723562
4503	NC_016911	GTA	2	6	178549	178554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723562
4504	NC_016911	GAT	2	6	178570	178575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723562
4505	NC_016911	A	6	6	178617	178622	100 %	0 %	0 %	0 %	378723562
4506	NC_016911	AGC	2	6	178629	178634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723562
4507	NC_016911	ATT	2	6	178642	178647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723562
4508	NC_016911	TGC	2	6	178656	178661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723562
4509	NC_016911	AGT	2	6	178677	178682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723562
4510	NC_016911	AATT	2	8	178687	178694	50 %	50 %	0 %	0 %	378723562
4511	NC_016911	AAGA	2	8	178707	178714	75 %	0 %	25 %	0 %	378723563
4512	NC_016911	GCG	2	6	178732	178737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723563
4513	NC_016911	A	7	7	178740	178746	100 %	0 %	0 %	0 %	378723563
4514	NC_016911	TA	3	6	178783	178788	50 %	50 %	0 %	0 %	378723563
4515	NC_016911	CAT	2	6	178822	178827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723563
4516	NC_016911	GTG	2	6	178903	178908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723563
4517	NC_016911	AGA	2	6	178964	178969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723563
4518	NC_016911	AGA	3	9	178973	178981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723563
4519	NC_016911	TAG	2	6	179005	179010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723563
4520	NC_016911	CAA	2	6	179014	179019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723563
4521	NC_016911	ATT	2	6	179022	179027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723563
4522	NC_016911	AATT	2	8	179048	179055	50 %	50 %	0 %	0 %	378723563
4523	NC_016911	TG	3	6	179060	179065	0 %	50 %	50 %	0 %	378723563
4524	NC_016911	A	6	6	179282	179287	100 %	0 %	0 %	0 %	378723563
4525	NC_016911	TCT	2	6	179367	179372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723563
4526	NC_016911	GTA	2	6	179437	179442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016911	TAA	3	9	179446	179454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_016911	A	7	7	179453	179459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_016911	AT	3	6	179492	179497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_016911	TAT	2	6	179505	179510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_016911	ATT	2	6	179597	179602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723564
4532	NC_016911	AGTG	2	8	179632	179639	25 %	25 %	50 %	0 %	378723564
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4534	NC_016911	AGT	2	6	179680	179685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723564
4535	NC_016911	ATTT	2	8	179742	179749	25 %	75 %	0 %	0 %	378723564
4536	NC_016911	TAG	2	6	179802	179807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723564
4537	NC_016911	TAG	2	6	179853	179858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723564
4538	NC_016911	ATT	2	6	179933	179938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723564
4539	NC_016911	TTA	2	6	179942	179947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723564
4540	NC_016911	TAA	2	6	180098	180103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_016911	T	6	6	180106	180111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016911	ATT	2	6	180119	180124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016911	A	6	6	180133	180138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_016911	TTAA	2	8	180166	180173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_016911	GTA	2	6	180190	180195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_016911	TC	3	6	180197	180202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_016911	A	7	7	180208	180214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_016911	A	6	6	180224	180229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_016911	GAA	2	6	180253	180258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723565
4550	NC_016911	ATC	2	6	180264	180269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723565
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4553	NC_016911	GCA	2	6	180331	180336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723565
4554	NC_016911	CTGTAG	2	12	180341	180352	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378723565
4555	NC_016911	GCA	2	6	180364	180369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723565
4556	NC_016911	GCG	2	6	180376	180381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723565
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4558	NC_016911	AGT	2	6	180414	180419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723565
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4560	NC_016911	TGA	2	6	180510	180515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723565
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4562	NC_016911	GCT	2	6	180583	180588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723565
4563	NC_016911	ATT	2	6	180612	180617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723565
4564	NC_016911	ATT	2	6	180648	180653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_016911	TAA	2	6	180682	180687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_016911	TTG	2	6	180693	180698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_016911	GTT	3	9	180704	180712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_016911	TCAA	2	8	180737	180744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4570	NC_016911	T	7	7	180766	180772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_016911	CTT	2	6	180827	180832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_016911	AAG	2	6	180889	180894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_016911	T	7	7	180919	180925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_016911	AAT	2	6	180968	180973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_016911	ATT	2	6	181006	181011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_016911	A	7	7	181095	181101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_016911	TAT	2	6	181102	181107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_016911	CAA	2	6	181117	181122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_016911	AAATC	2	10	181134	181143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4580	NC_016911	TTTAA	2	10	181202	181211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016911	TATTT	2	10	181240	181249	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016911	ATAA	2	8	181317	181324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_016911	TA	3	6	181334	181339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_016911	ATT	2	6	181373	181378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_016911	TAA	2	6	181406	181411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_016911	TTA	2	6	181430	181435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_016911	A	8	8	181443	181450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_016911	TGA	2	6	181453	181458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016911	ATT	2	6	181487	181492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_016911	TCAG	2	8	181543	181550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4592	NC_016911	ATA	2	6	181602	181607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723566
4593	NC_016911	GAA	2	6	181608	181613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723566
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4595	NC_016911	TAG	2	6	181641	181646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723566
4596	NC_016911	TTGA	2	8	181661	181668	25 %	50 %	25 %	0 %	378723566
4597	NC_016911	A	7	7	181674	181680	100 %	0 %	0 %	0 %	378723566
4598	NC_016911	GAAA	2	8	181724	181731	75 %	0 %	25 %	0 %	378723566
4599	NC_016911	A	6	6	181729	181734	100 %	0 %	0 %	0 %	378723566
4600	NC_016911	TCC	2	6	181781	181786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723566
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4603	NC_016911	AAG	2	6	181858	181863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723566
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4605	NC_016911	AAG	2	6	181962	181967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723566
4606	NC_016911	TA	3	6	181968	181973	50 %	50 %	0 %	0 %	378723566
4607	NC_016911	TAT	2	6	182011	182016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723566
4608	NC_016911	AGT	2	6	182032	182037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723566
4609	NC_016911	ATG	2	6	182079	182084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723566
4610	NC_016911	TTAT	2	8	182181	182188	25 %	75 %	0 %	0 %	378723566
4611	NC_016911	AAAG	2	8	182205	182212	75 %	0 %	25 %	0 %	378723566
4612	NC_016911	CTA	2	6	182220	182225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723566
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4614	NC_016911	TAT	2	6	182273	182278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723566
4615	NC_016911	TAG	2	6	182370	182375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723566
4616	NC_016911	A	6	6	182412	182417	100 %	0 %	0 %	0 %	378723566
4617	NC_016911	A	6	6	182435	182440	100 %	0 %	0 %	0 %	378723566
4618	NC_016911	TAA	2	6	182458	182463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723566
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4622	NC_016911	TTAAAA	2	12	182595	182606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723566
4623	NC_016911	AATC	2	8	182623	182630	50 %	25 %	0 %	25 %	378723566
4624	NC_016911	AT	3	6	182644	182649	50 %	50 %	0 %	0 %	378723566
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4996	NC_016911	CAG	2	6	198980	198985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723574
4997	NC_016911	TAA	3	9	199104	199112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723574
4998	NC_016911	TTG	2	6	199116	199121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723574
4999	NC_016911	GTT	2	6	199179	199184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_016911	TCA	2	6	199201	199206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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