MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 3756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016909	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016909	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016909	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	378722023
4	NC_016909	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	378722023
5	NC_016909	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	378722024
6	NC_016909	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	378722024
7	NC_016909	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	378722024
8	NC_016909	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	378722024
9	NC_016909	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	378722024
10	NC_016909	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016909	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	378722026
12	NC_016909	ATTT	2	8	7682	7689	25 %	75 %	0 %	0 %	378722027
13	NC_016909	CTGT	2	8	8118	8125	0 %	50 %	25 %	25 %	378722028
14	NC_016909	CCTC	2	8	9847	9854	0 %	25 %	0 %	75 %	378722030
15	NC_016909	CAAT	2	8	9894	9901	50 %	25 %	0 %	25 %	378722030
16	NC_016909	ATTA	2	8	10891	10898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016909	ATTA	2	8	11105	11112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016909	ATCT	2	8	11411	11418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016909	TTTA	2	8	11716	11723	25 %	75 %	0 %	0 %	378722033
20	NC_016909	GATT	2	8	12160	12167	25 %	50 %	25 %	0 %	378722034
21	NC_016909	AAAT	2	8	12168	12175	75 %	25 %	0 %	0 %	378722034
22	NC_016909	AATT	2	8	12195	12202	50 %	50 %	0 %	0 %	378722034
23	NC_016909	TTAA	2	8	12376	12383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016909	ATGA	2	8	13073	13080	50 %	25 %	25 %	0 %	378722035
25	NC_016909	TAAA	2	8	14096	14103	75 %	25 %	0 %	0 %	378722036
26	NC_016909	TAAA	2	8	14255	14262	75 %	25 %	0 %	0 %	378722036
27	NC_016909	TCAT	2	8	14376	14383	25 %	50 %	0 %	25 %	378722036
28	NC_016909	CTTT	2	8	14510	14517	0 %	75 %	0 %	25 %	378722036
29	NC_016909	TTAG	2	8	14752	14759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016909	GCAA	2	8	14851	14858	50 %	0 %	25 %	25 %	378722037
31	NC_016909	TCTT	2	8	14928	14935	0 %	75 %	0 %	25 %	378722037
32	NC_016909	AGTA	2	8	15186	15193	50 %	25 %	25 %	0 %	378722038
33	NC_016909	GCTT	2	8	15712	15719	0 %	50 %	25 %	25 %	378722039
34	NC_016909	AATT	2	8	16061	16068	50 %	50 %	0 %	0 %	378722039
35	NC_016909	TTGC	2	8	16334	16341	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016909	AATA	2	8	16685	16692	75 %	25 %	0 %	0 %	378722040
37	NC_016909	TCTA	2	8	17152	17159	25 %	50 %	0 %	25 %	378722040
38	NC_016909	ACGT	2	8	17575	17582	25 %	25 %	25 %	25 %	378722040
39	NC_016909	CTTG	2	8	17690	17697	0 %	50 %	25 %	25 %	378722040
40	NC_016909	AGTA	2	8	18756	18763	50 %	25 %	25 %	0 %	378722042
41	NC_016909	ATTA	2	8	18781	18788	50 %	50 %	0 %	0 %	378722042
42	NC_016909	AATA	2	8	18825	18832	75 %	25 %	0 %	0 %	378722042
43	NC_016909	CTTT	2	8	18870	18877	0 %	75 %	0 %	25 %	378722042
44	NC_016909	TAAA	2	8	19061	19068	75 %	25 %	0 %	0 %	378722042
45	NC_016909	AGAT	2	8	19249	19256	50 %	25 %	25 %	0 %	378722042
46	NC_016909	TAAA	2	8	19414	19421	75 %	25 %	0 %	0 %	378722043
47	NC_016909	AGTA	2	8	19814	19821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016909	AAAC	2	8	19864	19871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016909	TAAA	2	8	19939	19946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016909	TTAT	2	8	20137	20144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016909	GTAA	2	8	21041	21048	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
52	NC_016909	AGAT	2	8	21295	21302	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
53	NC_016909	AGCA	2	8	21414	21421	50 %	0 %	25 %	25 %	378722044
54	NC_016909	AAAT	2	8	21457	21464	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
55	NC_016909	AATG	2	8	21658	21665	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
56	NC_016909	ATTA	2	8	21959	21966	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
57	NC_016909	ATAG	2	8	22007	22014	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
58	NC_016909	ATAG	2	8	22019	22026	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
59	NC_016909	CGTT	2	8	22437	22444	0 %	50 %	25 %	25 %	378722044
60	NC_016909	TAGT	2	8	22884	22891	25 %	50 %	25 %	0 %	378722044
61	NC_016909	AAGC	2	8	23624	23631	50 %	0 %	25 %	25 %	378722044
62	NC_016909	TAAA	2	8	23949	23956	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
63	NC_016909	AAGT	2	8	24459	24466	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
64	NC_016909	AAGT	2	8	24546	24553	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
65	NC_016909	TTCA	2	8	25095	25102	25 %	50 %	0 %	25 %	378722044
66	NC_016909	AATA	2	8	25588	25595	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
67	NC_016909	TAAA	2	8	25734	25741	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
68	NC_016909	ACTA	2	8	25870	25877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016909	ATGT	2	8	26533	26540	25 %	50 %	25 %	0 %	378722046
70	NC_016909	TTAT	2	8	26587	26594	25 %	75 %	0 %	0 %	378722046
71	NC_016909	AGCA	2	8	26661	26668	50 %	0 %	25 %	25 %	378722046
72	NC_016909	TAAT	2	8	27462	27469	50 %	50 %	0 %	0 %	378722047
73	NC_016909	AAGA	2	8	27614	27621	75 %	0 %	25 %	0 %	378722047
74	NC_016909	AAAT	2	8	27706	27713	75 %	25 %	0 %	0 %	378722047
75	NC_016909	ATTA	2	8	27734	27741	50 %	50 %	0 %	0 %	378722047
76	NC_016909	TAAA	2	8	28581	28588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016909	AGGA	2	8	28639	28646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016909	TAAA	2	8	28671	28678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016909	GCTA	2	8	28681	28688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016909	TCTA	2	8	29430	29437	25 %	50 %	0 %	25 %	378722051
81	NC_016909	ATTT	2	8	29474	29481	25 %	75 %	0 %	0 %	378722051
82	NC_016909	TGTC	2	8	29538	29545	0 %	50 %	25 %	25 %	378722051
83	NC_016909	TAAT	2	8	29928	29935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016909	ATAC	2	8	30135	30142	50 %	25 %	0 %	25 %	378722053
85	NC_016909	ATAA	2	8	30559	30566	75 %	25 %	0 %	0 %	378722053
86	NC_016909	CACT	2	8	30653	30660	25 %	25 %	0 %	50 %	378722053
87	NC_016909	TATT	2	8	31477	31484	25 %	75 %	0 %	0 %	378722055
88	NC_016909	AATT	2	8	33111	33118	50 %	50 %	0 %	0 %	378722057
89	NC_016909	TACC	2	8	33201	33208	25 %	25 %	0 %	50 %	378722057
90	NC_016909	GTTA	2	8	33583	33590	25 %	50 %	25 %	0 %	378722057
91	NC_016909	AAAC	2	8	35006	35013	75 %	0 %	0 %	25 %	378722059
92	NC_016909	TTAG	2	8	35182	35189	25 %	50 %	25 %	0 %	378722059
93	NC_016909	TTGC	2	8	35477	35484	0 %	50 %	25 %	25 %	378722059
94	NC_016909	TTCC	2	8	35717	35724	0 %	50 %	0 %	50 %	378722059
95	NC_016909	TGTT	2	8	36185	36192	0 %	75 %	25 %	0 %	378722060
96	NC_016909	TTGT	2	8	36791	36798	0 %	75 %	25 %	0 %	378722061
97	NC_016909	TATT	2	8	36870	36877	25 %	75 %	0 %	0 %	378722061
98	NC_016909	GTAA	2	8	36881	36888	50 %	25 %	25 %	0 %	378722061
99	NC_016909	AATG	2	8	37653	37660	50 %	25 %	25 %	0 %	378722063
100	NC_016909	GTTT	2	8	38167	38174	0 %	75 %	25 %	0 %	378722063
101	NC_016909	ATAA	2	8	38662	38669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016909	AACA	2	8	38759	38766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016909	TAAA	2	8	39861	39868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016909	CTTG	2	8	40703	40710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016909	CTGA	2	8	40711	40718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016909	ATTG	2	8	40889	40896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016909	TAAA	2	8	41045	41052	75 %	25 %	0 %	0 %	378722065
108	NC_016909	ATTT	2	8	41150	41157	25 %	75 %	0 %	0 %	378722065
109	NC_016909	ATTA	2	8	41316	41323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016909	ATTA	2	8	41373	41380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016909	TGCT	3	12	41496	41507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016909	GCTT	2	8	41623	41630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016909	TTTA	2	8	41663	41670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016909	ATTA	2	8	42104	42111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016909	TAAT	2	8	42397	42404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016909	ATTA	2	8	42467	42474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016909	AAAT	2	8	42570	42577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016909	GAAA	2	8	42781	42788	75 %	0 %	25 %	0 %	378722067
119	NC_016909	ATTT	2	8	42825	42832	25 %	75 %	0 %	0 %	378722067
120	NC_016909	ACAA	2	8	43092	43099	75 %	0 %	0 %	25 %	378722067
121	NC_016909	AAAT	2	8	43296	43303	75 %	25 %	0 %	0 %	378722068
122	NC_016909	TACC	2	8	44650	44657	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016909	AAAC	2	8	44658	44665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016909	TAAT	2	8	44734	44741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016909	ATTT	2	8	44761	44768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016909	ATTA	2	8	44769	44776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016909	AAAT	2	8	44788	44795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016909	ATGA	2	8	44991	44998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016909	TAAC	2	8	45181	45188	50 %	25 %	0 %	25 %	378722070
130	NC_016909	ATTC	2	8	45610	45617	25 %	50 %	0 %	25 %	378722071
131	NC_016909	ATGT	2	8	45966	45973	25 %	50 %	25 %	0 %	378722072
132	NC_016909	ATTT	2	8	46125	46132	25 %	75 %	0 %	0 %	378722072
133	NC_016909	TTAC	2	8	46204	46211	25 %	50 %	0 %	25 %	378722072
134	NC_016909	ATCA	2	8	46881	46888	50 %	25 %	0 %	25 %	378722073
135	NC_016909	TGCC	2	8	47191	47198	0 %	25 %	25 %	50 %	378722073
136	NC_016909	TATC	2	8	47750	47757	25 %	50 %	0 %	25 %	378722073
137	NC_016909	TTAA	2	8	47773	47780	50 %	50 %	0 %	0 %	378722073
138	NC_016909	AGTA	2	8	48879	48886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016909	ATAC	2	8	49097	49104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016909	TTGC	2	8	49242	49249	0 %	50 %	25 %	25 %	378722075
141	NC_016909	TGTT	2	8	49611	49618	0 %	75 %	25 %	0 %	378722076
142	NC_016909	AAGT	2	8	49648	49655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016909	CTTG	2	8	50115	50122	0 %	50 %	25 %	25 %	378722077
144	NC_016909	ATCT	2	8	50694	50701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016909	TGCT	2	8	50867	50874	0 %	50 %	25 %	25 %	378722079
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