MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016909	TTTAGT	2	12	138530	138541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378722170
3503	NC_016909	CCA	2	6	138545	138550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378722170
3504	NC_016909	TATT	2	8	138553	138560	25 %	75 %	0 %	0 %	378722170
3505	NC_016909	ATG	2	6	138590	138595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722170
3506	NC_016909	TGC	2	6	138640	138645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722170
3507	NC_016909	CTC	2	6	138705	138710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378722170
3508	NC_016909	ATT	2	6	138747	138752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722170
3509	NC_016909	TGG	2	6	138798	138803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378722170
3510	NC_016909	AGA	2	6	138895	138900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722170
3511	NC_016909	TAA	2	6	138952	138957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722170
3512	NC_016909	GAT	2	6	138965	138970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722170
3513	NC_016909	AGT	2	6	139153	139158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722170
3514	NC_016909	GTTA	2	8	139228	139235	25 %	50 %	25 %	0 %	378722170
3515	NC_016909	TAG	2	6	139270	139275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722170
3516	NC_016909	AGCT	2	8	139278	139285	25 %	25 %	25 %	25 %	378722170
3517	NC_016909	TGC	2	6	139291	139296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722170
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3519	NC_016909	GCAA	2	8	139342	139349	50 %	0 %	25 %	25 %	378722170
3520	NC_016909	TGC	2	6	139387	139392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722170
3521	NC_016909	G	6	6	139399	139404	0 %	0 %	100 %	0 %	378722170
3522	NC_016909	AGG	2	6	139423	139428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722170
3523	NC_016909	GGA	2	6	139457	139462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722170
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3526	NC_016909	AGT	2	6	139580	139585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722170
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3530	NC_016909	CAC	2	6	139677	139682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378722170
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3533	NC_016909	ATA	2	6	139734	139739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722170
3534	NC_016909	TAG	2	6	139926	139931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722170
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3536	NC_016909	AAG	2	6	139959	139964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722170
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3540	NC_016909	A	8	8	140040	140047	100 %	0 %	0 %	0 %	378722170
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3543	NC_016909	TAGC	2	8	140119	140126	25 %	25 %	25 %	25 %	378722171
3544	NC_016909	TA	3	6	140205	140210	50 %	50 %	0 %	0 %	378722171
3545	NC_016909	GTTTT	2	10	140273	140282	0 %	80 %	20 %	0 %	378722171
3546	NC_016909	GTA	3	9	140296	140304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722171
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3551	NC_016909	TAA	2	6	140633	140638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722171
3552	NC_016909	T	6	6	140643	140648	0 %	100 %	0 %	0 %	378722171
3553	NC_016909	TGC	2	6	140699	140704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722171
3554	NC_016909	T	6	6	140769	140774	0 %	100 %	0 %	0 %	378722171
3555	NC_016909	A	6	6	140815	140820	100 %	0 %	0 %	0 %	378722171
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3557	NC_016909	TTG	2	6	140848	140853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722171
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3563	NC_016909	TTA	2	6	141083	141088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722171
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3589	NC_016909	TAATGC	2	12	142229	142240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378722172
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3591	NC_016909	TAG	2	6	142336	142341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722172
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3593	NC_016909	TA	3	6	142398	142403	50 %	50 %	0 %	0 %	378722172
3594	NC_016909	AAT	2	6	142491	142496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722172
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3604	NC_016909	TCC	2	6	143006	143011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378722172
3605	NC_016909	AAAGAT	2	12	143052	143063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378722172
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3607	NC_016909	AGG	2	6	143153	143158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722172
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3609	NC_016909	ATGA	2	8	143187	143194	50 %	25 %	25 %	0 %	378722172
3610	NC_016909	TTG	2	6	143245	143250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722172
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3612	NC_016909	TA	3	6	143299	143304	50 %	50 %	0 %	0 %	378722172
3613	NC_016909	TA	4	8	143309	143316	50 %	50 %	0 %	0 %	378722172
3614	NC_016909	TAG	2	6	143387	143392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722172
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3619	NC_016909	TAA	2	6	143642	143647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722172
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