MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016909	AT	3	6	19832	19837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016909	AAAC	2	8	19864	19871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_016909	A	6	6	19874	19879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016909	A	7	7	19882	19888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016909	TTG	2	6	19889	19894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016909	AAT	2	6	19929	19934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016909	TAAA	2	8	19939	19946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016909	ATT	2	6	19971	19976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016909	AT	3	6	20117	20122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016909	TTAT	2	8	20137	20144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016909	TTTAA	2	10	20164	20173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016909	AAC	2	6	20205	20210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
513	NC_016909	A	7	7	20218	20224	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
514	NC_016909	AAG	2	6	20304	20309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
515	NC_016909	TAA	2	6	20329	20334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
516	NC_016909	TTG	2	6	20336	20341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722044
517	NC_016909	GCA	2	6	20389	20394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722044
518	NC_016909	GTA	2	6	20538	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
519	NC_016909	A	6	6	20610	20615	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
520	NC_016909	TAA	2	6	20682	20687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
521	NC_016909	TAC	2	6	20752	20757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722044
522	NC_016909	TAC	2	6	20779	20784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722044
523	NC_016909	CAT	2	6	20799	20804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722044
524	NC_016909	ACC	2	6	20872	20877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378722044
525	NC_016909	GCA	2	6	20894	20899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722044
526	NC_016909	CAA	2	6	20930	20935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
527	NC_016909	TCC	2	6	20974	20979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378722044
528	NC_016909	A	7	7	21007	21013	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
529	NC_016909	GTAA	2	8	21041	21048	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
530	NC_016909	GAT	2	6	21067	21072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
531	NC_016909	A	6	6	21122	21127	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
532	NC_016909	A	6	6	21174	21179	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
533	NC_016909	TCAAG	2	10	21192	21201	40 %	20 %	20 %	20 %	378722044
534	NC_016909	ATAAA	2	10	21246	21255	80 %	20 %	0 %	0 %	378722044
535	NC_016909	AGAT	2	8	21295	21302	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
536	NC_016909	A	6	6	21318	21323	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
537	NC_016909	AGCA	2	8	21414	21421	50 %	0 %	25 %	25 %	378722044
538	NC_016909	TAA	2	6	21451	21456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
539	NC_016909	AAAT	2	8	21457	21464	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
540	NC_016909	AGAAA	2	10	21508	21517	80 %	0 %	20 %	0 %	378722044
541	NC_016909	A	6	6	21515	21520	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
542	NC_016909	AAG	2	6	21522	21527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
543	NC_016909	GCT	2	6	21602	21607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722044
544	NC_016909	AGA	2	6	21616	21621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
545	NC_016909	AATG	2	8	21658	21665	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
546	NC_016909	TTA	2	6	21707	21712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
547	NC_016909	TGT	2	6	21718	21723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722044
548	NC_016909	AAAGC	2	10	21764	21773	60 %	0 %	20 %	20 %	378722044
549	NC_016909	AAC	2	6	21816	21821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
550	NC_016909	CAG	2	6	21860	21865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722044
551	NC_016909	ATTA	2	8	21959	21966	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
552	NC_016909	GAATA	2	10	21970	21979	60 %	20 %	20 %	0 %	378722044
553	NC_016909	ATAG	2	8	22007	22014	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
554	NC_016909	ATAG	2	8	22019	22026	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
555	NC_016909	TAT	2	6	22248	22253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
556	NC_016909	ATC	2	6	22282	22287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722044
557	NC_016909	GAA	2	6	22295	22300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
558	NC_016909	ACA	2	6	22350	22355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
559	NC_016909	TTC	2	6	22378	22383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722044
560	NC_016909	TAA	2	6	22396	22401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
561	NC_016909	ATTTAG	2	12	22416	22427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378722044
562	NC_016909	CGTT	2	8	22437	22444	0 %	50 %	25 %	25 %	378722044
563	NC_016909	TAA	2	6	22491	22496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
564	NC_016909	AAT	2	6	22544	22549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
565	NC_016909	ACA	2	6	22573	22578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
566	NC_016909	A	6	6	22590	22595	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
567	NC_016909	GAT	2	6	22622	22627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
568	NC_016909	GAA	2	6	22670	22675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
569	NC_016909	A	6	6	22700	22705	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
570	NC_016909	TAATA	2	10	22711	22720	60 %	40 %	0 %	0 %	378722044
571	NC_016909	AG	3	6	22722	22727	50 %	0 %	50 %	0 %	378722044
572	NC_016909	CA	3	6	22754	22759	50 %	0 %	0 %	50 %	378722044
573	NC_016909	ATT	2	6	22761	22766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
574	NC_016909	CAAAG	2	10	22803	22812	60 %	0 %	20 %	20 %	378722044
575	NC_016909	TAGT	2	8	22884	22891	25 %	50 %	25 %	0 %	378722044
576	NC_016909	A	6	6	22900	22905	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
577	NC_016909	AAC	2	6	22957	22962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
578	NC_016909	TTAGT	2	10	22986	22995	20 %	60 %	20 %	0 %	378722044
579	NC_016909	TC	3	6	23037	23042	0 %	50 %	0 %	50 %	378722044
580	NC_016909	CAG	2	6	23051	23056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722044
581	NC_016909	A	8	8	23106	23113	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
582	NC_016909	AGCAG	2	10	23129	23138	40 %	0 %	40 %	20 %	378722044
583	NC_016909	ATA	2	6	23151	23156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
584	NC_016909	A	6	6	23239	23244	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
585	NC_016909	TA	3	6	23280	23285	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
586	NC_016909	CAA	2	6	23300	23305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
587	NC_016909	TAA	2	6	23331	23336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
588	NC_016909	CTA	2	6	23412	23417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722044
589	NC_016909	TA	3	6	23416	23421	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
590	NC_016909	TGA	2	6	23434	23439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
591	NC_016909	AT	3	6	23459	23464	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
592	NC_016909	ATT	2	6	23530	23535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
593	NC_016909	ATTTAG	2	12	23568	23579	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378722044
594	NC_016909	AAGC	2	8	23624	23631	50 %	0 %	25 %	25 %	378722044
595	NC_016909	TGA	2	6	23815	23820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
596	NC_016909	GTG	2	6	23838	23843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378722044
597	NC_016909	TAAA	2	8	23949	23956	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
598	NC_016909	ATG	2	6	24063	24068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
599	NC_016909	AGT	2	6	24074	24079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
600	NC_016909	TGT	2	6	24085	24090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722044
601	NC_016909	TAA	2	6	24121	24126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
602	NC_016909	TA	3	6	24143	24148	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
603	NC_016909	AGA	2	6	24178	24183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
604	NC_016909	AAG	2	6	24228	24233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
605	NC_016909	TA	3	6	24242	24247	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
606	NC_016909	A	6	6	24282	24287	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
607	NC_016909	TAA	2	6	24297	24302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
608	NC_016909	ATG	2	6	24321	24326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
609	NC_016909	A	6	6	24327	24332	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
610	NC_016909	TTC	2	6	24334	24339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722044
611	NC_016909	GAA	2	6	24350	24355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
612	NC_016909	TACCT	2	10	24421	24430	20 %	40 %	0 %	40 %	378722044
613	NC_016909	GAA	2	6	24440	24445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
614	NC_016909	AAG	2	6	24447	24452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
615	NC_016909	AAGT	2	8	24459	24466	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
616	NC_016909	TACCT	2	10	24508	24517	20 %	40 %	0 %	40 %	378722044
617	NC_016909	GAA	2	6	24527	24532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
618	NC_016909	AAG	2	6	24534	24539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
619	NC_016909	AAGT	2	8	24546	24553	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
620	NC_016909	GCATTA	2	12	24599	24610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378722044
621	NC_016909	GAA	2	6	24662	24667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
622	NC_016909	GAA	3	9	24692	24700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
623	NC_016909	TCCGAT	2	12	24716	24727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378722044
624	NC_016909	A	7	7	24784	24790	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
625	NC_016909	AAATGC	2	12	24792	24803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378722044
626	NC_016909	GTT	2	6	24842	24847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722044
627	NC_016909	ATA	2	6	24861	24866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
628	NC_016909	TAA	2	6	24898	24903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
629	NC_016909	TGA	2	6	24922	24927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
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