MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016909	GTT	2	6	199186	199191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016909	TCA	2	6	199208	199213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_016909	T	7	7	199274	199280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016909	ATT	2	6	199281	199286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016909	T	6	6	199285	199290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016909	ATG	2	6	199323	199328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016909	A	6	6	199478	199483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016909	TCT	2	6	199535	199540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722216
5009	NC_016909	TAAAG	2	10	199592	199601	60 %	20 %	20 %	0 %	378722216
5010	NC_016909	ATA	2	6	199608	199613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722216
5011	NC_016909	AG	3	6	199716	199721	50 %	0 %	50 %	0 %	378722216
5012	NC_016909	AAAG	2	8	199728	199735	75 %	0 %	25 %	0 %	378722216
5013	NC_016909	A	6	6	199799	199804	100 %	0 %	0 %	0 %	378722216
5014	NC_016909	AAAG	2	8	199880	199887	75 %	0 %	25 %	0 %	378722216
5015	NC_016909	ATA	2	6	199966	199971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722216
5016	NC_016909	GCT	2	6	200112	200117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722216
5017	NC_016909	TA	3	6	200152	200157	50 %	50 %	0 %	0 %	378722216
5018	NC_016909	T	6	6	200199	200204	0 %	100 %	0 %	0 %	378722216
5019	NC_016909	GGC	2	6	200207	200212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378722216
5020	NC_016909	ATA	2	6	200267	200272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016909	T	6	6	200294	200299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016909	ATTA	2	8	200308	200315	50 %	50 %	0 %	0 %	378722217
5023	NC_016909	ATT	2	6	200434	200439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722217
5024	NC_016909	CCA	2	6	200485	200490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378722217
5025	NC_016909	CTT	2	6	200521	200526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722217
5026	NC_016909	T	6	6	200562	200567	0 %	100 %	0 %	0 %	378722217
5027	NC_016909	AGCA	2	8	200583	200590	50 %	0 %	25 %	25 %	378722217
5028	NC_016909	CAG	2	6	200594	200599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722217
5029	NC_016909	T	6	6	200616	200621	0 %	100 %	0 %	0 %	378722217
5030	NC_016909	ATC	2	6	200658	200663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722217
5031	NC_016909	CTT	2	6	200678	200683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722217
5032	NC_016909	TAT	2	6	200816	200821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722217
5033	NC_016909	TAAT	3	12	200833	200844	50 %	50 %	0 %	0 %	378722217
5034	NC_016909	GAT	2	6	200874	200879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722217
5035	NC_016909	ATC	2	6	200910	200915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722217
5036	NC_016909	ATT	2	6	200919	200924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722217
5037	NC_016909	TGC	2	6	200940	200945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722217
5038	NC_016909	TC	3	6	200973	200978	0 %	50 %	0 %	50 %	378722217
5039	NC_016909	TAA	2	6	201051	201056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016909	AGTA	2	8	201063	201070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016909	TTA	2	6	201154	201159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016909	ACG	2	6	201161	201166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_016909	T	6	6	201222	201227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016909	TAA	2	6	201237	201242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016909	A	6	6	201273	201278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016909	GCA	2	6	201290	201295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_016909	A	6	6	201295	201300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016909	ATA	2	6	201339	201344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722218
5049	NC_016909	TATT	2	8	201372	201379	25 %	75 %	0 %	0 %	378722218
5050	NC_016909	AAG	2	6	201417	201422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722218
5051	NC_016909	TTA	2	6	201428	201433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722218
5052	NC_016909	TTA	2	6	201459	201464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722218
5053	NC_016909	TTA	2	6	201479	201484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722218
5054	NC_016909	TTA	2	6	201512	201517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722218
5055	NC_016909	T	6	6	201591	201596	0 %	100 %	0 %	0 %	378722218
5056	NC_016909	TTA	2	6	201623	201628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722218
5057	NC_016909	ATA	2	6	201636	201641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722218
5058	NC_016909	CGG	2	6	201646	201651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378722218
5059	NC_016909	TGT	2	6	201712	201717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722218
5060	NC_016909	T	6	6	201789	201794	0 %	100 %	0 %	0 %	378722218
5061	NC_016909	T	7	7	201819	201825	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
5062	NC_016909	ATTA	2	8	201852	201859	50 %	50 %	0 %	0 %	378722219
5063	NC_016909	TTC	2	6	201903	201908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722219
5064	NC_016909	ATT	2	6	201933	201938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722219
5065	NC_016909	T	6	6	201948	201953	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
5066	NC_016909	ATA	2	6	201973	201978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722219
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5072	NC_016909	AT	3	6	202204	202209	50 %	50 %	0 %	0 %	378722219
5073	NC_016909	T	6	6	202300	202305	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
5074	NC_016909	T	6	6	202314	202319	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
5075	NC_016909	ATA	2	6	202345	202350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722219
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5081	NC_016909	T	8	8	202443	202450	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
5082	NC_016909	AAT	2	6	202503	202508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_016909	TTG	2	6	202555	202560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016909	GTA	2	6	202596	202601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_016909	CAA	2	6	202685	202690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_016909	GCT	2	6	202699	202704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5093	NC_016909	TTTA	2	8	203120	203127	25 %	75 %	0 %	0 %	378722220
5094	NC_016909	AAT	2	6	203136	203141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722220
5095	NC_016909	CATT	2	8	203178	203185	25 %	50 %	0 %	25 %	378722220
5096	NC_016909	TGC	2	6	203186	203191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722220
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5098	NC_016909	CAT	2	6	203239	203244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722220
5099	NC_016909	TCA	2	6	203331	203336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722220
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5101	NC_016909	CTT	3	9	203389	203397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722220
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5105	NC_016909	ATG	2	6	203517	203522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722220
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5107	NC_016909	CGC	2	6	203572	203577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722220
5108	NC_016909	T	6	6	203670	203675	0 %	100 %	0 %	0 %	378722220
5109	NC_016909	GCT	2	6	203685	203690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722220
5110	NC_016909	TGA	2	6	203699	203704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722220
5111	NC_016909	TGAT	2	8	203777	203784	25 %	50 %	25 %	0 %	378722220
5112	NC_016909	AAT	2	6	203941	203946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722220
5113	NC_016909	ATTT	3	12	203968	203979	25 %	75 %	0 %	0 %	378722220
5114	NC_016909	AAGCCC	2	12	203987	203998	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378722220
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5118	NC_016909	A	6	6	204118	204123	100 %	0 %	0 %	0 %	378722220
5119	NC_016909	AT	3	6	204198	204203	50 %	50 %	0 %	0 %	378722220
5120	NC_016909	CAG	2	6	204345	204350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722221
5121	NC_016909	TAAA	2	8	204393	204400	75 %	25 %	0 %	0 %	378722221
5122	NC_016909	ATA	2	6	204413	204418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722221
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5124	NC_016909	ATT	2	6	204502	204507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722221
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