MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 3760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016908	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016908	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016908	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	378720672
4	NC_016908	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	378720672
5	NC_016908	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	378720673
6	NC_016908	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	378720673
7	NC_016908	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	378720673
8	NC_016908	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	378720673
9	NC_016908	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	378720673
10	NC_016908	TGTA	2	8	5910	5917	25 %	50 %	25 %	0 %	378720673
11	NC_016908	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016908	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	378720675
13	NC_016908	ATTT	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	378720676
14	NC_016908	CTGT	2	8	8116	8123	0 %	50 %	25 %	25 %	378720677
15	NC_016908	CCTC	2	8	9845	9852	0 %	25 %	0 %	75 %	378720679
16	NC_016908	CAAT	2	8	9892	9899	50 %	25 %	0 %	25 %	378720679
17	NC_016908	ATTA	2	8	10889	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016908	ATTA	2	8	11103	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016908	ATCT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016908	TTTA	2	8	11714	11721	25 %	75 %	0 %	0 %	378720682
21	NC_016908	GATT	2	8	12158	12165	25 %	50 %	25 %	0 %	378720683
22	NC_016908	AAAT	2	8	12166	12173	75 %	25 %	0 %	0 %	378720683
23	NC_016908	AATT	2	8	12193	12200	50 %	50 %	0 %	0 %	378720683
24	NC_016908	TTAA	2	8	12374	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	378720683
25	NC_016908	ATGA	2	8	13071	13078	50 %	25 %	25 %	0 %	378720684
26	NC_016908	TAAA	2	8	14094	14101	75 %	25 %	0 %	0 %	378720685
27	NC_016908	TAAA	2	8	14253	14260	75 %	25 %	0 %	0 %	378720685
28	NC_016908	TCAT	2	8	14374	14381	25 %	50 %	0 %	25 %	378720685
29	NC_016908	CTTT	2	8	14508	14515	0 %	75 %	0 %	25 %	378720685
30	NC_016908	TTAG	2	8	14750	14757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016908	GCAA	2	8	14849	14856	50 %	0 %	25 %	25 %	378720686
32	NC_016908	TCTT	2	8	14926	14933	0 %	75 %	0 %	25 %	378720686
33	NC_016908	AGTA	2	8	15184	15191	50 %	25 %	25 %	0 %	378720687
34	NC_016908	GCTT	2	8	15710	15717	0 %	50 %	25 %	25 %	378720688
35	NC_016908	AATT	2	8	16059	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	378720688
36	NC_016908	TTGC	2	8	16332	16339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016908	AATA	2	8	16683	16690	75 %	25 %	0 %	0 %	378720689
38	NC_016908	TCTA	2	8	17150	17157	25 %	50 %	0 %	25 %	378720689
39	NC_016908	ACGT	2	8	17573	17580	25 %	25 %	25 %	25 %	378720689
40	NC_016908	CTTG	2	8	17688	17695	0 %	50 %	25 %	25 %	378720689
41	NC_016908	AGTA	2	8	18754	18761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016908	ATTA	2	8	18779	18786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016908	AATA	2	8	18823	18830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016908	CTTT	2	8	18868	18875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016908	TAAA	2	8	19059	19066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016908	AGAT	2	8	19247	19254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016908	TAAA	2	8	19412	19419	75 %	25 %	0 %	0 %	378720692
48	NC_016908	AGTA	2	8	19812	19819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016908	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016908	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016908	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016908	GTAA	2	8	21049	21056	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
53	NC_016908	AGAT	2	8	21303	21310	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
54	NC_016908	AGCA	2	8	21422	21429	50 %	0 %	25 %	25 %	378720694
55	NC_016908	AAAT	2	8	21465	21472	75 %	25 %	0 %	0 %	378720694
56	NC_016908	AATG	2	8	21666	21673	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
57	NC_016908	ATTA	2	8	21967	21974	50 %	50 %	0 %	0 %	378720694
58	NC_016908	ATAG	2	8	22015	22022	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
59	NC_016908	ATAG	2	8	22027	22034	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
60	NC_016908	CGTT	2	8	22445	22452	0 %	50 %	25 %	25 %	378720694
61	NC_016908	TAGT	2	8	22892	22899	25 %	50 %	25 %	0 %	378720694
62	NC_016908	AAGC	2	8	23632	23639	50 %	0 %	25 %	25 %	378720694
63	NC_016908	TAAA	2	8	23957	23964	75 %	25 %	0 %	0 %	378720694
64	NC_016908	AAGT	2	8	24467	24474	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
65	NC_016908	AAGT	2	8	24554	24561	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
66	NC_016908	TTCA	2	8	25103	25110	25 %	50 %	0 %	25 %	378720694
67	NC_016908	AATA	2	8	25596	25603	75 %	25 %	0 %	0 %	378720694
68	NC_016908	TAAA	2	8	25742	25749	75 %	25 %	0 %	0 %	378720694
69	NC_016908	ACTA	2	8	25878	25885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016908	ATGT	2	8	26541	26548	25 %	50 %	25 %	0 %	378720696
71	NC_016908	TTAT	2	8	26595	26602	25 %	75 %	0 %	0 %	378720696
72	NC_016908	AGCA	2	8	26669	26676	50 %	0 %	25 %	25 %	378720696
73	NC_016908	TAAT	2	8	27470	27477	50 %	50 %	0 %	0 %	378720697
74	NC_016908	AAGA	2	8	27622	27629	75 %	0 %	25 %	0 %	378720697
75	NC_016908	AAAT	2	8	27714	27721	75 %	25 %	0 %	0 %	378720697
76	NC_016908	ATTA	2	8	27742	27749	50 %	50 %	0 %	0 %	378720697
77	NC_016908	TAAA	2	8	28589	28596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016908	AGGA	2	8	28647	28654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016908	TAAA	2	8	28679	28686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016908	GCTA	2	8	28689	28696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016908	TCTA	2	8	29438	29445	25 %	50 %	0 %	25 %	378720701
82	NC_016908	ATTT	2	8	29482	29489	25 %	75 %	0 %	0 %	378720701
83	NC_016908	TGTC	2	8	29546	29553	0 %	50 %	25 %	25 %	378720701
84	NC_016908	TAAT	2	8	29936	29943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016908	ATAC	2	8	30143	30150	50 %	25 %	0 %	25 %	378720703
86	NC_016908	ATAA	2	8	30567	30574	75 %	25 %	0 %	0 %	378720703
87	NC_016908	CACT	2	8	30661	30668	25 %	25 %	0 %	50 %	378720703
88	NC_016908	TATT	2	8	31485	31492	25 %	75 %	0 %	0 %	378720705
89	NC_016908	AATT	2	8	33119	33126	50 %	50 %	0 %	0 %	378720707
90	NC_016908	TACC	2	8	33209	33216	25 %	25 %	0 %	50 %	378720707
91	NC_016908	GTTA	2	8	33591	33598	25 %	50 %	25 %	0 %	378720707
92	NC_016908	AAAC	2	8	35014	35021	75 %	0 %	0 %	25 %	378720709
93	NC_016908	TTAG	2	8	35190	35197	25 %	50 %	25 %	0 %	378720709
94	NC_016908	TTGC	2	8	35485	35492	0 %	50 %	25 %	25 %	378720709
95	NC_016908	TTCC	2	8	35725	35732	0 %	50 %	0 %	50 %	378720709
96	NC_016908	TGTT	2	8	36193	36200	0 %	75 %	25 %	0 %	378720710
97	NC_016908	TTGT	2	8	36799	36806	0 %	75 %	25 %	0 %	378720711
98	NC_016908	TATT	2	8	36878	36885	25 %	75 %	0 %	0 %	378720711
99	NC_016908	GTAA	2	8	36889	36896	50 %	25 %	25 %	0 %	378720711
100	NC_016908	AATG	2	8	37661	37668	50 %	25 %	25 %	0 %	378720712
101	NC_016908	GTTT	2	8	38175	38182	0 %	75 %	25 %	0 %	378720712
102	NC_016908	ATAA	2	8	38670	38677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016908	AACA	2	8	38767	38774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016908	TAAA	2	8	39869	39876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016908	CTTG	2	8	40711	40718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016908	CTGA	2	8	40719	40726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016908	ATTG	2	8	40895	40902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016908	TAAA	2	8	41051	41058	75 %	25 %	0 %	0 %	378720714
109	NC_016908	ATTT	2	8	41156	41163	25 %	75 %	0 %	0 %	378720714
110	NC_016908	ATTA	2	8	41322	41329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016908	ATTA	2	8	41379	41386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016908	TGCT	3	12	41502	41513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016908	GCTT	2	8	41629	41636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016908	TTTA	2	8	41669	41676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016908	ATTA	2	8	42110	42117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016908	TAAT	2	8	42403	42410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016908	ATTA	2	8	42473	42480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016908	AAAT	2	8	42576	42583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016908	GAAA	2	8	42787	42794	75 %	0 %	25 %	0 %	378720716
120	NC_016908	ATTT	2	8	42831	42838	25 %	75 %	0 %	0 %	378720716
121	NC_016908	ACAA	2	8	43098	43105	75 %	0 %	0 %	25 %	378720716
122	NC_016908	AAAT	2	8	43302	43309	75 %	25 %	0 %	0 %	378720717
123	NC_016908	TACC	2	8	44656	44663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016908	AAAC	2	8	44664	44671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016908	TAAT	2	8	44740	44747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016908	ATTT	2	8	44767	44774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016908	ATTA	2	8	44775	44782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016908	AAAT	2	8	44794	44801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016908	ATGA	2	8	44997	45004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016908	TAAC	2	8	45187	45194	50 %	25 %	0 %	25 %	378720719
131	NC_016908	ATTC	2	8	45616	45623	25 %	50 %	0 %	25 %	378720720
132	NC_016908	ATGT	2	8	45972	45979	25 %	50 %	25 %	0 %	378720721
133	NC_016908	ATTT	2	8	46131	46138	25 %	75 %	0 %	0 %	378720721
134	NC_016908	TTAC	2	8	46210	46217	25 %	50 %	0 %	25 %	378720721
135	NC_016908	ATCA	2	8	46887	46894	50 %	25 %	0 %	25 %	378720722
136	NC_016908	TGCC	2	8	47197	47204	0 %	25 %	25 %	50 %	378720722
137	NC_016908	TATC	2	8	47756	47763	25 %	50 %	0 %	25 %	378720722
138	NC_016908	TTAA	2	8	47779	47786	50 %	50 %	0 %	0 %	378720722
139	NC_016908	AGTA	2	8	48885	48892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016908	ATAC	2	8	49103	49110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016908	TTGC	2	8	49248	49255	0 %	50 %	25 %	25 %	378720724
142	NC_016908	TGTT	2	8	49617	49624	0 %	75 %	25 %	0 %	378720725
143	NC_016908	AAGT	2	8	49654	49661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016908	CTTG	2	8	50121	50128	0 %	50 %	25 %	25 %	378720726
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