MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 32272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016908	ACTC	2	8	117176	117183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_016908	CAAA	2	8	117198	117205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_016908	CTAT	2	8	117269	117276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_016908	TAA	2	6	117277	117282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016908	T	6	6	117294	117299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016908	TAA	2	6	117306	117311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016908	TGC	2	6	117407	117412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720789
3008	NC_016908	TGC	2	6	117422	117427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720789
3009	NC_016908	ATG	2	6	117466	117471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720789
3010	NC_016908	TTA	2	6	117487	117492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720789
3011	NC_016908	TA	3	6	117639	117644	50 %	50 %	0 %	0 %	378720789
3012	NC_016908	A	7	7	117776	117782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016908	GTC	2	6	117855	117860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_016908	CTA	2	6	117917	117922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016908	GTT	2	6	117931	117936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016908	TAT	2	6	117975	117980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720790
3017	NC_016908	TAC	2	6	118076	118081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720790
3018	NC_016908	AGA	2	6	118082	118087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720790
3019	NC_016908	T	6	6	118163	118168	0 %	100 %	0 %	0 %	378720791
3020	NC_016908	AGT	2	6	118297	118302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016908	TAT	2	6	118306	118311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016908	TAA	2	6	118476	118481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720792
3023	NC_016908	ATT	2	6	118522	118527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720792
3024	NC_016908	TTAGT	2	10	118545	118554	20 %	60 %	20 %	0 %	378720792
3025	NC_016908	GCT	2	6	118586	118591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720792
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3027	NC_016908	TGC	2	6	118669	118674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720792
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3029	NC_016908	A	7	7	118737	118743	100 %	0 %	0 %	0 %	378720792
3030	NC_016908	TA	3	6	118771	118776	50 %	50 %	0 %	0 %	378720792
3031	NC_016908	ATC	2	6	118780	118785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720792
3032	NC_016908	TAGCGG	2	12	118815	118826	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378720792
3033	NC_016908	ATA	2	6	118892	118897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720792
3034	NC_016908	CTT	2	6	119025	119030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720792
3035	NC_016908	A	6	6	119167	119172	100 %	0 %	0 %	0 %	378720792
3036	NC_016908	TAG	2	6	119227	119232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720792
3037	NC_016908	ATA	2	6	119339	119344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720792
3038	NC_016908	TATC	2	8	119346	119353	25 %	50 %	0 %	25 %	378720792
3039	NC_016908	AAG	2	6	119421	119426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720792
3040	NC_016908	AACG	2	8	119436	119443	50 %	0 %	25 %	25 %	378720792
3041	NC_016908	TAT	2	6	119463	119468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720792
3042	NC_016908	TGCT	2	8	119502	119509	0 %	50 %	25 %	25 %	378720792
3043	NC_016908	TTA	2	6	119642	119647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720792
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3047	NC_016908	ATA	2	6	119797	119802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720792
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3049	NC_016908	CAT	2	6	119809	119814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720792
3050	NC_016908	TAT	2	6	119937	119942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720793
3051	NC_016908	TAA	2	6	119996	120001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720793
3052	NC_016908	TA	3	6	120050	120055	50 %	50 %	0 %	0 %	378720793
3053	NC_016908	TAT	2	6	120084	120089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720793
3054	NC_016908	TAG	2	6	120149	120154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720793
3055	NC_016908	CTA	2	6	120158	120163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720793
3056	NC_016908	CTA	2	6	120185	120190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720793
3057	NC_016908	AAGTA	2	10	120368	120377	60 %	20 %	20 %	0 %	378720793
3058	NC_016908	TATT	2	8	120427	120434	25 %	75 %	0 %	0 %	378720793
3059	NC_016908	T	6	6	120436	120441	0 %	100 %	0 %	0 %	378720793
3060	NC_016908	T	6	6	120447	120452	0 %	100 %	0 %	0 %	378720793
3061	NC_016908	ATT	2	6	120466	120471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720793
3062	NC_016908	T	7	7	120470	120476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016908	AAGT	2	8	120526	120533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016908	GCT	2	6	120581	120586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_016908	ATG	2	6	120591	120596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3067	NC_016908	TAC	2	6	120735	120740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720794
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3071	NC_016908	TA	3	6	120951	120956	50 %	50 %	0 %	0 %	378720794
3072	NC_016908	AGC	2	6	120984	120989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720794
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3080	NC_016908	TA	4	8	121508	121515	50 %	50 %	0 %	0 %	378720794
3081	NC_016908	CCG	2	6	121525	121530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720794
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3083	NC_016908	TCA	2	6	121546	121551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720794
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3089	NC_016908	T	7	7	121757	121763	0 %	100 %	0 %	0 %	378720794
3090	NC_016908	AAT	2	6	121812	121817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720794
3091	NC_016908	TA	3	6	121856	121861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016908	AT	3	6	121887	121892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016908	ATA	2	6	121934	121939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016908	CTT	2	6	121982	121987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_016908	T	6	6	121993	121998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3097	NC_016908	T	6	6	122038	122043	0 %	100 %	0 %	0 %	378720795
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3102	NC_016908	AGATT	2	10	122166	122175	40 %	40 %	20 %	0 %	378720796
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3105	NC_016908	TTCT	2	8	122241	122248	0 %	75 %	0 %	25 %	378720796
3106	NC_016908	TAA	2	6	122251	122256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720796
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3108	NC_016908	CTAC	2	8	122342	122349	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_016908	TAA	2	6	122355	122360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016908	ATT	3	9	122402	122410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016908	TAT	2	6	122439	122444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_016908	TAAAA	2	10	122483	122492	80 %	20 %	0 %	0 %	378720797
3113	NC_016908	ATT	2	6	122506	122511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720797
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3117	NC_016908	CT	3	6	122595	122600	0 %	50 %	0 %	50 %	378720797
3118	NC_016908	TA	3	6	122641	122646	50 %	50 %	0 %	0 %	378720797
3119	NC_016908	ATG	2	6	122659	122664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720797
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3121	NC_016908	T	6	6	122744	122749	0 %	100 %	0 %	0 %	378720797
3122	NC_016908	A	6	6	122750	122755	100 %	0 %	0 %	0 %	378720797
3123	NC_016908	T	6	6	122822	122827	0 %	100 %	0 %	0 %	378720797
3124	NC_016908	CTA	2	6	122905	122910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720797
3125	NC_016908	TAA	2	6	122915	122920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720797
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3494	NC_016908	CTTTAG	2	12	137888	137899	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378720816
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