MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 32272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016908	CT	3	6	58608	58613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_016908	TAT	2	6	58681	58686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720733
1503	NC_016908	A	7	7	58720	58726	100 %	0 %	0 %	0 %	378720733
1504	NC_016908	TAA	2	6	58823	58828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720733
1505	NC_016908	TAT	2	6	58829	58834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720733
1506	NC_016908	CTA	2	6	58880	58885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720733
1507	NC_016908	AAG	2	6	58897	58902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720733
1508	NC_016908	A	7	7	58910	58916	100 %	0 %	0 %	0 %	378720733
1509	NC_016908	GTTA	2	8	58939	58946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016908	TTA	2	6	58954	58959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016908	TAA	2	6	58984	58989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016908	AGC	2	6	59001	59006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016908	A	7	7	59012	59018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016908	TTA	2	6	59050	59055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016908	CT	4	8	59068	59075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_016908	T	6	6	59105	59110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016908	T	7	7	59112	59118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016908	TCA	2	6	59148	59153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016908	TTAA	2	8	59169	59176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016908	AAT	2	6	59186	59191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016908	TTA	2	6	59213	59218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016908	ATA	2	6	59257	59262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016908	T	6	6	59264	59269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016908	ATA	2	6	59274	59279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016908	TTG	2	6	59326	59331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016908	TA	3	6	59340	59345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016908	TAT	2	6	59371	59376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720734
1528	NC_016908	TGA	2	6	59416	59421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720734
1529	NC_016908	ATT	2	6	59432	59437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720734
1530	NC_016908	ATA	2	6	59442	59447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720734
1531	NC_016908	A	7	7	59461	59467	100 %	0 %	0 %	0 %	378720734
1532	NC_016908	TAA	2	6	59506	59511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720734
1533	NC_016908	A	6	6	59513	59518	100 %	0 %	0 %	0 %	378720734
1534	NC_016908	ATT	3	9	59523	59531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720734
1535	NC_016908	T	6	6	59530	59535	0 %	100 %	0 %	0 %	378720734
1536	NC_016908	AGA	2	6	59563	59568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720734
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1540	NC_016908	TAA	2	6	59704	59709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720734
1541	NC_016908	TAA	2	6	59749	59754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720735
1542	NC_016908	GCT	2	6	59768	59773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720735
1543	NC_016908	A	6	6	59798	59803	100 %	0 %	0 %	0 %	378720735
1544	NC_016908	T	6	6	59807	59812	0 %	100 %	0 %	0 %	378720735
1545	NC_016908	AGA	2	6	59813	59818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720735
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1547	NC_016908	AAAG	2	8	59952	59959	75 %	0 %	25 %	0 %	378720735
1548	NC_016908	AAT	2	6	59963	59968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720735
1549	NC_016908	TTA	2	6	59996	60001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720735
1550	NC_016908	TAAA	2	8	60019	60026	75 %	25 %	0 %	0 %	378720735
1551	NC_016908	ATA	2	6	60030	60035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016908	TAA	2	6	60050	60055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720736
1553	NC_016908	TAA	2	6	60162	60167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720736
1554	NC_016908	AGA	2	6	60222	60227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720736
1555	NC_016908	A	6	6	60233	60238	100 %	0 %	0 %	0 %	378720736
1556	NC_016908	TTA	2	6	60248	60253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720736
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1558	NC_016908	TCGGT	2	10	60305	60314	0 %	40 %	40 %	20 %	378720736
1559	NC_016908	TAA	2	6	60318	60323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720736
1560	NC_016908	AT	3	6	60350	60355	50 %	50 %	0 %	0 %	378720736
1561	NC_016908	TTG	2	6	60467	60472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720736
1562	NC_016908	ATCAGA	2	12	60477	60488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378720736
1563	NC_016908	ATT	2	6	60497	60502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720736
1564	NC_016908	AGA	2	6	60528	60533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720736
1565	NC_016908	T	8	8	60554	60561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016908	ATC	2	6	60562	60567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_016908	T	6	6	60579	60584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016908	TTG	2	6	60608	60613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016908	T	6	6	60718	60723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016908	CAA	2	6	60763	60768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_016908	TAC	2	6	60793	60798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_016908	ACAA	2	8	60828	60835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1578	NC_016908	AAT	2	6	61121	61126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720737
1579	NC_016908	AAGA	2	8	61140	61147	75 %	0 %	25 %	0 %	378720737
1580	NC_016908	TGA	2	6	61170	61175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720737
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1585	NC_016908	TA	3	6	61338	61343	50 %	50 %	0 %	0 %	378720737
1586	NC_016908	TAG	2	6	61362	61367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720737
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1600	NC_016908	TA	3	6	61942	61947	50 %	50 %	0 %	0 %	378720737
1601	NC_016908	A	6	6	61961	61966	100 %	0 %	0 %	0 %	378720737
1602	NC_016908	ATA	2	6	62010	62015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720737
1603	NC_016908	A	6	6	62029	62034	100 %	0 %	0 %	0 %	378720737
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1605	NC_016908	ATA	2	6	62087	62092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720737
1606	NC_016908	ATCT	2	8	62124	62131	25 %	50 %	0 %	25 %	378720737
1607	NC_016908	AT	3	6	62205	62210	50 %	50 %	0 %	0 %	378720737
1608	NC_016908	TAAA	2	8	62315	62322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016908	ATTT	2	8	62336	62343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016908	CT	3	6	62350	62355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_016908	TTA	2	6	62372	62377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016908	AAT	2	6	62393	62398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720738
1613	NC_016908	TGG	2	6	62482	62487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720738
1614	NC_016908	ATA	2	6	62493	62498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720738
1615	NC_016908	T	6	6	62512	62517	0 %	100 %	0 %	0 %	378720738
1616	NC_016908	TGA	2	6	62527	62532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720738
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1621	NC_016908	TAG	2	6	62898	62903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720738
1622	NC_016908	T	6	6	62905	62910	0 %	100 %	0 %	0 %	378720738
1623	NC_016908	CAAG	2	8	62919	62926	50 %	0 %	25 %	25 %	378720738
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1627	NC_016908	CTT	2	6	62996	63001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720738
1628	NC_016908	T	6	6	63035	63040	0 %	100 %	0 %	0 %	378720738
1629	NC_016908	TTG	2	6	63060	63065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720738
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