MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 32272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016908	AGT	2	6	40307	40312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016908	AGC	2	6	40403	40408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016908	TTG	2	6	40444	40449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016908	TTG	2	6	40475	40480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016908	TA	3	6	40507	40512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016908	TAA	2	6	40571	40576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016908	AT	3	6	40631	40636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016908	CTTG	2	8	40711	40718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_016908	CTGA	2	8	40719	40726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_016908	TAT	2	6	40756	40761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016908	AAT	2	6	40812	40817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016908	T	6	6	40875	40880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016908	TA	4	8	40885	40892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016908	ATTG	2	8	40895	40902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016908	ATCTTT	2	12	40981	40992	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1016	NC_016908	TAA	2	6	41017	41022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016908	CTTTT	2	10	41023	41032	0 %	80 %	0 %	20 %	378720714
1018	NC_016908	TAAA	2	8	41051	41058	75 %	25 %	0 %	0 %	378720714
1019	NC_016908	T	6	6	41100	41105	0 %	100 %	0 %	0 %	378720714
1020	NC_016908	AGA	2	6	41143	41148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720714
1021	NC_016908	ATTT	2	8	41156	41163	25 %	75 %	0 %	0 %	378720714
1022	NC_016908	T	6	6	41196	41201	0 %	100 %	0 %	0 %	378720714
1023	NC_016908	TCT	2	6	41239	41244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720714
1024	NC_016908	TAA	2	6	41254	41259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720714
1025	NC_016908	ATTA	2	8	41322	41329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016908	TA	3	6	41335	41340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016908	CTT	2	6	41372	41377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_016908	ATTA	2	8	41379	41386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016908	AT	3	6	41404	41409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016908	TTATT	2	10	41432	41441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016908	ATC	2	6	41466	41471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_016908	TGCT	3	12	41502	41513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_016908	TTTTA	2	10	41536	41545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016908	TCA	2	6	41594	41599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016908	ATT	2	6	41623	41628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016908	GCTT	2	8	41629	41636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_016908	ACT	2	6	41649	41654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016908	TTTA	2	8	41669	41676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016908	T	6	6	41770	41775	0 %	100 %	0 %	0 %	378720715
1040	NC_016908	TAG	2	6	41792	41797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720715
1041	NC_016908	T	6	6	41813	41818	0 %	100 %	0 %	0 %	378720715
1042	NC_016908	TAG	2	6	41837	41842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720715
1043	NC_016908	AGC	2	6	41859	41864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720715
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1045	NC_016908	T	7	7	41948	41954	0 %	100 %	0 %	0 %	378720715
1046	NC_016908	TCT	2	6	42033	42038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_016908	TTA	2	6	42066	42071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016908	AAT	2	6	42080	42085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016908	ATTA	2	8	42110	42117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016908	TCT	2	6	42182	42187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_016908	T	6	6	42187	42192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016908	CAT	2	6	42196	42201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_016908	ATT	2	6	42238	42243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016908	AGTTG	2	10	42284	42293	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016908	TTG	3	9	42296	42304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016908	CTA	2	6	42331	42336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_016908	T	6	6	42353	42358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016908	TAAT	2	8	42403	42410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016908	GTT	2	6	42421	42426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016908	T	6	6	42425	42430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016908	TAA	2	6	42434	42439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016908	A	6	6	42449	42454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016908	TAA	2	6	42467	42472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016908	ATTA	2	8	42473	42480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016908	GAT	2	6	42534	42539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016908	AT	3	6	42549	42554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016908	TAT	2	6	42570	42575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016908	AAAT	2	8	42576	42583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016908	TAA	2	6	42586	42591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016908	ATA	2	6	42610	42615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720716
1071	NC_016908	TAT	2	6	42629	42634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720716
1072	NC_016908	ATA	2	6	42669	42674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720716
1073	NC_016908	TTC	2	6	42692	42697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720716
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1078	NC_016908	TAC	2	6	42842	42847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720716
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1080	NC_016908	TAT	2	6	42890	42895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720716
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1082	NC_016908	AGT	2	6	42929	42934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720716
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1085	NC_016908	A	6	6	42991	42996	100 %	0 %	0 %	0 %	378720716
1086	NC_016908	GAT	2	6	42999	43004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720716
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1089	NC_016908	ACA	2	6	43115	43120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720716
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1101	NC_016908	GTT	2	6	43577	43582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720717
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1103	NC_016908	A	6	6	43603	43608	100 %	0 %	0 %	0 %	378720717
1104	NC_016908	CTT	2	6	43662	43667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720717
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1106	NC_016908	TA	3	6	43795	43800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016908	AT	3	6	43801	43806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016908	ATT	2	6	43821	43826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_016908	TTA	2	6	43948	43953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720718
1113	NC_016908	T	6	6	43973	43978	0 %	100 %	0 %	0 %	378720718
1114	NC_016908	AT	3	6	43985	43990	50 %	50 %	0 %	0 %	378720718
1115	NC_016908	AT	3	6	44009	44014	50 %	50 %	0 %	0 %	378720718
1116	NC_016908	ATT	2	6	44037	44042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720718
1117	NC_016908	TTA	2	6	44154	44159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720718
1118	NC_016908	TAC	2	6	44177	44182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720718
1119	NC_016908	T	6	6	44199	44204	0 %	100 %	0 %	0 %	378720718
1120	NC_016908	GTA	2	6	44262	44267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720718
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1123	NC_016908	AAT	2	6	44409	44414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720718
1124	NC_016908	CT	3	6	44423	44428	0 %	50 %	0 %	50 %	378720718
1125	NC_016908	GAT	2	6	44451	44456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720718
1126	NC_016908	GAT	2	6	44502	44507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720718
1127	NC_016908	ATT	2	6	44550	44555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016908	TACC	2	8	44656	44663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_016908	AAAC	2	8	44664	44671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_016908	TAAT	2	8	44740	44747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016908	ATTT	2	8	44767	44774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016908	ATTA	2	8	44775	44782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016908	CGT	2	6	44788	44793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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