MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 6600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016835	CGC	2	6	115	120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703933
2	NC_016835	GCC	2	6	151	156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703933
3	NC_016835	GCT	2	6	207	212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
4	NC_016835	CGC	2	6	256	261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703933
5	NC_016835	CTG	2	6	295	300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
6	NC_016835	TGA	2	6	368	373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703933
7	NC_016835	CTG	2	6	433	438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
8	NC_016835	AGC	2	6	452	457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703933
9	NC_016835	CTG	2	6	463	468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
10	NC_016835	GAA	2	6	550	555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703933
11	NC_016835	CAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703933
12	NC_016835	TCG	2	6	598	603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
13	NC_016835	ATA	2	6	611	616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703933
14	NC_016835	ATG	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703933
15	NC_016835	GGC	2	6	646	651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703933
16	NC_016835	CCG	3	9	786	794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703933
17	NC_016835	AAC	2	6	799	804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703933
18	NC_016835	AGC	2	6	968	973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703933
19	NC_016835	CTG	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
20	NC_016835	GGT	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703933
21	NC_016835	CCA	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703933
22	NC_016835	TGC	2	6	1247	1252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
23	NC_016835	CAT	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703933
24	NC_016835	GCC	2	6	1315	1320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703933
25	NC_016835	CCG	2	6	1332	1337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703933
26	NC_016835	GAA	2	6	1474	1479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703933
27	NC_016835	CTG	2	6	1486	1491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
28	NC_016835	AAC	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703933
29	NC_016835	ACA	2	6	1617	1622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703933
30	NC_016835	GAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703933
31	NC_016835	AAC	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703933
32	NC_016835	CGC	2	6	1706	1711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703933
33	NC_016835	CTG	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
34	NC_016835	CGT	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
35	NC_016835	CTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
36	NC_016835	CGG	2	6	2004	2009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703933
37	NC_016835	GGC	2	6	2110	2115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703933
38	NC_016835	CGT	2	6	2151	2156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
39	NC_016835	GCT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
40	NC_016835	TGA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703933
41	NC_016835	ACC	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703933
42	NC_016835	CTG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
43	NC_016835	GAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703933
44	NC_016835	ACA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703933
45	NC_016835	CAG	2	6	2611	2616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703933
46	NC_016835	TGC	2	6	2642	2647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703933
47	NC_016835	ACA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703933
48	NC_016835	ATT	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703934
49	NC_016835	TTC	2	6	3148	3153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703934
50	NC_016835	TCA	2	6	3220	3225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703934
51	NC_016835	TCA	2	6	3325	3330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703934
52	NC_016835	GTC	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703934
53	NC_016835	TGA	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703934
54	NC_016835	AGA	2	6	3593	3598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703934
55	NC_016835	AGA	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703934
56	NC_016835	CAG	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703934
57	NC_016835	CTG	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703934
58	NC_016835	CTG	2	6	3756	3761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703934
59	NC_016835	CAC	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703934
60	NC_016835	CGA	2	6	3977	3982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703934
61	NC_016835	CGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703934
62	NC_016835	CAA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703934
63	NC_016835	TGG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703934
64	NC_016835	AGA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703934
65	NC_016835	CAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703934
66	NC_016835	CGC	2	6	4490	4495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703934
67	NC_016835	AGC	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703934
68	NC_016835	CCG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703934
69	NC_016835	AAC	2	6	4797	4802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703934
70	NC_016835	ATC	3	9	4857	4865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703934
71	NC_016835	CGG	3	9	4892	4900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703934
72	NC_016835	TGG	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703934
73	NC_016835	AAC	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703935
74	NC_016835	CCG	3	9	5222	5230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703935
75	NC_016835	CTG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703935
76	NC_016835	CGG	2	6	5298	5303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703935
77	NC_016835	ACC	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703935
78	NC_016835	CCA	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703935
79	NC_016835	TCG	2	6	5429	5434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703935
80	NC_016835	CAC	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703935
81	NC_016835	AGC	2	6	5541	5546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703935
82	NC_016835	ACC	2	6	5629	5634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703935
83	NC_016835	GGC	2	6	5638	5643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703935
84	NC_016835	AGA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703935
85	NC_016835	CCG	2	6	5702	5707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703935
86	NC_016835	CGT	2	6	5712	5717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703935
87	NC_016835	CGG	2	6	5814	5819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703935
88	NC_016835	TGG	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703935
89	NC_016835	CGG	3	9	5906	5914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703935
90	NC_016835	TAC	2	6	5941	5946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703935
91	NC_016835	GCT	2	6	6021	6026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703935
92	NC_016835	TGA	2	6	6107	6112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703935
93	NC_016835	CGC	2	6	6137	6142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703935
94	NC_016835	GTC	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703935
95	NC_016835	CGG	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703935
96	NC_016835	TCA	2	6	6214	6219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703935
97	NC_016835	GCG	2	6	6271	6276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703935
98	NC_016835	GCC	2	6	6397	6402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703935
99	NC_016835	GGT	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703935
100	NC_016835	ATC	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703935
101	NC_016835	GAC	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703935
102	NC_016835	GCT	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703935
103	NC_016835	CGA	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703935
104	NC_016835	GCA	2	6	6909	6914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703935
105	NC_016835	GAA	2	6	6996	7001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703935
106	NC_016835	GAT	2	6	7026	7031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703935
107	NC_016835	GAA	2	6	7038	7043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703935
108	NC_016835	AAT	2	6	7599	7604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703935
109	NC_016835	GAA	2	6	7637	7642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703935
110	NC_016835	AAT	2	6	7695	7700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703935
111	NC_016835	AGA	2	6	7761	7766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703935
112	NC_016835	TCT	2	6	7771	7776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703935
113	NC_016835	AAT	2	6	7804	7809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703936
114	NC_016835	TTC	2	6	7821	7826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703936
115	NC_016835	TGC	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703936
116	NC_016835	GAA	2	6	7940	7945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703936
117	NC_016835	CTT	2	6	7978	7983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703936
118	NC_016835	TGA	2	6	8161	8166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703936
119	NC_016835	GGA	2	6	8246	8251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379703936
120	NC_016835	AAT	2	6	8282	8287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703936
121	NC_016835	ACA	2	6	8369	8374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703936
122	NC_016835	GTT	2	6	8402	8407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703936
123	NC_016835	GAA	2	6	8510	8515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703936
124	NC_016835	AAT	2	6	8579	8584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703936
125	NC_016835	TAA	2	6	8674	8679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703936
126	NC_016835	TAA	2	6	8683	8688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703936
127	NC_016835	TAT	2	6	8862	8867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016835	AAT	2	6	8892	8897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016835	TAA	2	6	8913	8918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016835	GAT	2	6	8967	8972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016835	CGG	3	9	9011	9019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016835	ACC	2	6	9091	9096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_016835	TGG	2	6	9106	9111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016835	GCT	2	6	9207	9212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016835	AGA	2	6	9404	9409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703937
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251	NC_016835	ATA	2	6	18381	18386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703944
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253	NC_016835	CCA	2	6	18709	18714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
254	NC_016835	CGT	2	6	18743	18748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_016835	CGG	2	6	18845	18850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_016835	CGG	3	9	18937	18945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_016835	TAC	2	6	18972	18977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_016835	CGT	2	6	19007	19012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_016835	GCT	2	6	19052	19057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_016835	TGA	2	6	19138	19143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_016835	CGC	2	6	19168	19173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_016835	CGG	2	6	19208	19213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_016835	TCA	2	6	19245	19250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_016835	TAA	2	6	19329	19334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703945
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269	NC_016835	TAT	2	6	19629	19634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703946
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277	NC_016835	CTG	2	6	20361	20366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703947
278	NC_016835	ACC	2	6	20380	20385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703947
279	NC_016835	CCG	2	6	20422	20427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703947
280	NC_016835	CTG	2	6	20445	20450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703947
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292	NC_016835	GAT	2	6	22012	22017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703948
293	NC_016835	TTC	2	6	22104	22109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703948
294	NC_016835	AAT	2	6	22307	22312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703948
295	NC_016835	GGC	2	6	22414	22419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703948
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