MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016835	ATC	2	6	99110	99115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704024
2003	NC_016835	CAGTA	2	10	99120	99129	40 %	20 %	20 %	20 %	379704024
2004	NC_016835	AAC	2	6	99224	99229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704024
2005	NC_016835	ATT	2	6	99257	99262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704024
2006	NC_016835	GCG	2	6	99263	99268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704024
2007	NC_016835	CGT	2	6	99352	99357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704024
2008	NC_016835	ATG	2	6	99359	99364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704024
2009	NC_016835	ATT	2	6	99392	99397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704024
2010	NC_016835	CCA	2	6	99414	99419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704024
2011	NC_016835	GCC	2	6	99446	99451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704024
2012	NC_016835	TGA	2	6	99580	99585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704024
2013	NC_016835	GCT	2	6	99619	99624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704024
2014	NC_016835	ATCC	2	8	99642	99649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_016835	TCA	2	6	99726	99731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704025
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2019	NC_016835	GATT	2	8	99937	99944	25 %	50 %	25 %	0 %	379704025
2020	NC_016835	GCT	2	6	99974	99979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704025
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2022	NC_016835	ATT	2	6	100078	100083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_016835	T	7	7	100133	100139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2030	NC_016835	GGA	2	6	100525	100530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_016835	ATG	2	6	100532	100537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704027
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2104	NC_016835	ATA	2	6	104005	104010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2113	NC_016835	ATA	2	6	104613	104618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704031
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2124	NC_016835	CAA	2	6	105423	105428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704032
2125	NC_016835	GCA	2	6	105471	105476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704032
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2127	NC_016835	GCA	2	6	105516	105521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704032
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2246	NC_016835	GGT	2	6	110907	110912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704036
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2249	NC_016835	CCA	2	6	111007	111012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704037
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2254	NC_016835	CGG	2	6	111403	111408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704037
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2261	NC_016835	CGG	2	6	111814	111819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704037
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2357	NC_016835	TA	3	6	117538	117543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2358	NC_016835	TAAAAA	2	12	117552	117563	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2359	NC_016835	TTTAT	2	10	117579	117588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2360	NC_016835	ATAA	2	8	117620	117627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2361	NC_016835	TAATC	2	10	117628	117637	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2362	NC_016835	TAA	2	6	117640	117645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2363	NC_016835	GGT	2	6	117742	117747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2364	NC_016835	TCA	2	6	117768	117773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2365	NC_016835	ACCAA	2	10	117797	117806	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2366	NC_016835	CAA	3	9	117827	117835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704043
2367	NC_016835	CTC	2	6	117853	117858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704043
2368	NC_016835	GTC	2	6	117880	117885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704043
2369	NC_016835	GGT	2	6	117907	117912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704043
2370	NC_016835	AGG	2	6	117930	117935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704043
2371	NC_016835	CTG	2	6	117949	117954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704043
2372	NC_016835	CCG	2	6	117977	117982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704043
2373	NC_016835	TAT	2	6	118044	118049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704043
2374	NC_016835	GCT	2	6	118146	118151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704043
2375	NC_016835	CG	3	6	118159	118164	0 %	0 %	50 %	50 %	379704043
2376	NC_016835	TGG	2	6	118169	118174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704043
2377	NC_016835	GGC	2	6	118200	118205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704043
2378	NC_016835	ATC	2	6	118261	118266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704043
2379	NC_016835	CAGAA	2	10	118313	118322	60 %	0 %	20 %	20 %	379704043
2380	NC_016835	TGC	2	6	118365	118370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704043
2381	NC_016835	GATCA	2	10	118375	118384	40 %	20 %	20 %	20 %	379704043
2382	NC_016835	CTGT	2	8	118537	118544	0 %	50 %	25 %	25 %	379704043
2383	NC_016835	TGA	2	6	118545	118550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704043
2384	NC_016835	TTA	2	6	118620	118625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704043
2385	NC_016835	AAC	2	6	118630	118635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704043
2386	NC_016835	GCT	2	6	118726	118731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704043
2387	NC_016835	CGG	2	6	118760	118765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704043
2388	NC_016835	CGG	2	6	118770	118775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704043
2389	NC_016835	CGT	2	6	118798	118803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704043
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2400	NC_016835	GGC	2	6	119704	119709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704043
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2404	NC_016835	CGGT	2	8	119981	119988	0 %	25 %	50 %	25 %	379704043
2405	NC_016835	CTG	2	6	120085	120090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704043
2406	NC_016835	TTC	2	6	120091	120096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704043
2407	NC_016835	GC	3	6	120120	120125	0 %	0 %	50 %	50 %	379704043
2408	NC_016835	CAT	3	9	120228	120236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704043
2409	NC_016835	CGG	2	6	120349	120354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2410	NC_016835	T	7	7	120357	120363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2411	NC_016835	CTGTT	2	10	120474	120483	0 %	60 %	20 %	20 %	379704044
2412	NC_016835	T	6	6	120482	120487	0 %	100 %	0 %	0 %	379704044
2413	NC_016835	TCA	2	6	120500	120505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704044
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2432	NC_016835	TCG	2	6	121418	121423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704044
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2435	NC_016835	TGA	2	6	121579	121584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704044
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2439	NC_016835	AAT	2	6	121753	121758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704045
2440	NC_016835	TCC	2	6	121927	121932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2441	NC_016835	ATA	2	6	121940	121945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2442	NC_016835	CAG	2	6	121989	121994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2443	NC_016835	ATA	2	6	122023	122028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2444	NC_016835	GAT	2	6	122048	122053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2446	NC_016835	CCT	2	6	122131	122136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2447	NC_016835	A	7	7	122178	122184	100 %	0 %	0 %	0 %	379704046
2448	NC_016835	CCG	2	6	122253	122258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704046
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2452	NC_016835	TGA	2	6	122510	122515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704046
2453	NC_016835	GCG	2	6	122540	122545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704046
2454	NC_016835	CAGC	2	8	122549	122556	25 %	0 %	25 %	50 %	379704046
2455	NC_016835	TGCC	2	8	122584	122591	0 %	25 %	25 %	50 %	379704046
2456	NC_016835	AGA	2	6	122614	122619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704046
2457	NC_016835	CATTC	2	10	122628	122637	20 %	40 %	0 %	40 %	379704046
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2459	NC_016835	CA	3	6	122719	122724	50 %	0 %	0 %	50 %	379704046
2460	NC_016835	A	6	6	122736	122741	100 %	0 %	0 %	0 %	379704046
2461	NC_016835	GCC	2	6	122748	122753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704046
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2472	NC_016835	GCCA	2	8	123363	123370	25 %	0 %	25 %	50 %	379704047
2473	NC_016835	CTG	2	6	123449	123454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704047
2474	NC_016835	CGT	2	6	123475	123480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704047
2475	NC_016835	CTGATC	2	12	123551	123562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379704047
2476	NC_016835	CGCC	2	8	123571	123578	0 %	0 %	25 %	75 %	379704047
2477	NC_016835	TTC	2	6	123689	123694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704047
2478	NC_016835	CGCC	2	8	123703	123710	0 %	0 %	25 %	75 %	379704047
2479	NC_016835	CAAA	2	8	123751	123758	75 %	0 %	0 %	25 %	379704047
2480	NC_016835	CAT	3	9	123866	123874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704047
2481	NC_016835	GCT	2	6	123964	123969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704047
2482	NC_016835	ACC	2	6	124020	124025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704047
2483	NC_016835	TAA	2	6	124101	124106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_016835	TTA	2	6	124113	124118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2485	NC_016835	GGC	2	6	124132	124137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2486	NC_016835	AAAC	2	8	124243	124250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2487	NC_016835	ACTGC	2	10	124258	124267	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2488	NC_016835	AAC	2	6	124273	124278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2489	NC_016835	TGA	2	6	124298	124303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2490	NC_016835	GTTT	2	8	124320	124327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_016835	CAT	2	6	124339	124344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2492	NC_016835	AAT	2	6	124370	124375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2493	NC_016835	GTC	2	6	124382	124387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2494	NC_016835	AAT	2	6	124411	124416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704048
2495	NC_016835	TTA	2	6	124425	124430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704048
2496	NC_016835	CGA	2	6	124501	124506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704048
2497	NC_016835	ATC	2	6	124586	124591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704048
2498	NC_016835	ACG	2	6	124614	124619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704048
2499	NC_016835	ACA	3	9	124661	124669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704048
2500	NC_016835	GAT	2	6	124771	124776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704048

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